166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1932 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 
376 aa  746    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  78.44 
 
 
373 aa  558  1e-158  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  51.27 
 
 
363 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  50.42 
 
 
363 aa  328  7e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  50.99 
 
 
363 aa  328  9e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  51.12 
 
 
367 aa  315  8e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  50.84 
 
 
367 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  46.99 
 
 
369 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  46.72 
 
 
369 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  46.72 
 
 
369 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  46.45 
 
 
369 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  46.45 
 
 
369 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  46.45 
 
 
369 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  46.45 
 
 
369 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  47.18 
 
 
369 aa  281  9e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  46.72 
 
 
369 aa  281  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  45.88 
 
 
369 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  46.19 
 
 
392 aa  277  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  46.81 
 
 
370 aa  275  7e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  46.81 
 
 
370 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  46.81 
 
 
370 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  46.81 
 
 
370 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  46.54 
 
 
370 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4163  putative cytochrome oxidase assembly protein  47.59 
 
 
369 aa  272  7e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  46.36 
 
 
383 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  46.26 
 
 
370 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  45.95 
 
 
370 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  46.59 
 
 
399 aa  269  5e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  46.69 
 
 
396 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  48.66 
 
 
404 aa  264  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  46.88 
 
 
391 aa  250  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1688  cytochrome oxidase assembly  51.12 
 
 
398 aa  242  6e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3827  cytochrome oxidase assembly  46.48 
 
 
411 aa  242  9e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.502475 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4383  cytochrome oxidase assembly  45.76 
 
 
406 aa  235  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4065  cytochrome oxidase assembly  45.93 
 
 
506 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.328508  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1387  cytochrome oxidase assembly  45.09 
 
 
407 aa  233  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  41.08 
 
 
348 aa  203  5e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0334  putative cytochrome aa3 oxidase assembly protein,related to CtaA  43.38 
 
 
327 aa  195  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0072  cytochrome oxidase assembly  41.38 
 
 
359 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  37.34 
 
 
335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  36 
 
 
339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  42.5 
 
 
339 aa  183  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  36.71 
 
 
335 aa  184  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0124  cytochrome oxidase assembly  39.58 
 
 
359 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190927  normal  0.0274429 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0149  cytochrome oxidase assembly  40.24 
 
 
345 aa  182  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  39.16 
 
 
325 aa  180  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0069  cytochrome oxidase assembly  38.94 
 
 
368 aa  178  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0126  cytochrome oxidase assembly  39.47 
 
 
359 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  35.78 
 
 
339 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0109  cytochrome oxidase assembly  39.76 
 
 
359 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.475032  normal  0.476439 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0318  cytochrome oxidase assembly  34.21 
 
 
387 aa  175  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0129  cytochrome oxidase assembly  40.48 
 
 
357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.96534 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0043  putative cytochrome oxidase assembly protein  34.51 
 
 
394 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.484274  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  37.05 
 
 
325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  36.36 
 
 
326 aa  173  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  36.59 
 
 
328 aa  172  9e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3040  cytochrome oxidase assembly  41.84 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00748587  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  40 
 
 
361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3490  cytochrome oxidase assembly  36.11 
 
 
327 aa  164  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4005  cytochrome oxidase assembly  37.24 
 
 
327 aa  162  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01360  hypothetical protein  39.94 
 
 
357 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  37.01 
 
 
327 aa  160  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4187  cytochrome oxidase assembly  38.55 
 
 
325 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0148  cytochrome oxidase assembly  38.55 
 
 
325 aa  159  7e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0230  cytochrome oxidase assembly protein  34.88 
 
 
353 aa  159  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4119  cytochrome oxidase assembly  37.24 
 
 
325 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4318  cytochrome oxidase assembly  38.55 
 
 
325 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0187  hypothetical protein  38.99 
 
 
357 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4613  cytochrome oxidase assembly protein, putative  36.61 
 
 
330 aa  153  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0629  putative cytochrome oxidase assembly protein  30.59 
 
 
387 aa  153  4e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00950  Cytochrome oxidase assembly protein  39.41 
 
 
356 aa  152  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0712  cytochrome oxidase assembly protein  30.33 
 
 
387 aa  152  8.999999999999999e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809899  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04027  cytochrome oxidase assembly protein  30.99 
 
 
387 aa  151  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3523  cytochrome oxidase assembly  35.42 
 
 
326 aa  146  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0171  cytochrome oxidase assembly  35.37 
 
 
327 aa  143  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3997  cytochrome oxidase assembly  34.25 
 
 
352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1045  cytochrome oxidase assembly  36.45 
 
 
356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3798  cytochrome oxidase assembly  32.96 
 
 
352 aa  129  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3871  cytochrome oxidase assembly  32.96 
 
 
352 aa  129  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2711  cytochrome oxidase assembly  32.93 
 
 
375 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318505  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04006  cytochrome oxidase assembly  33.21 
 
 
354 aa  122  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0133  cytochrome oxidase assembly family protein/cell division protein FtsY  33.45 
 
 
671 aa  113  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  27.96 
 
 
342 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  24.21 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06105  cytochrome oxidase assembly protein  28.26 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  32.54 
 
 
308 aa  77  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  32.06 
 
 
308 aa  77  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  34.01 
 
 
341 aa  77  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  33.66 
 
 
308 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  27.27 
 
 
311 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1778  hypothetical protein  32.11 
 
 
308 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  26.5 
 
 
339 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05011  hypothetical protein  31.58 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.550155  normal  0.119353 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  32.24 
 
 
327 aa  73.9  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  31.96 
 
 
285 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  27.84 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  30.24 
 
 
313 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  30.24 
 
 
313 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04451  hypothetical protein  34.59 
 
 
288 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.898486  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2601  putative cytochrome aa3 controlling protein  28.78 
 
 
304 aa  67.4  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.705731 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>