74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2701 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2701  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 362 aa  700    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2665  cytochrome oxidase assembly  88.22 
 
 		 365 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.352051  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3097  cytochrome oxidase assembly  79.08 
 
 		 370 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2687  cytochrome oxidase assembly  71.99 
 
 		 362 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0468581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1418  cytochrome oxidase assembly  70.11 
 
 		 360 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2460  cytochrome oxidase assembly  68.64 
 
 		 389 aa  463  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4601  putative cytochrome oxidase assembly protein  68.82 
 
 		 362 aa  443  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  59.41 
 
 		 363 aa  371  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  51.49 
 
 		 364 aa  312  5.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0858  cytochrome oxidase assembly  51.51 
 
 		 367 aa  295  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  0.254409 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1228  cytochrome oxidase assembly  50.15 
 
 		 367 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1316  cytochrome oxidase assembly  49.7 
 
 		 367 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1160  cytochrome oxidase assembly  52.62 
 
 		 361 aa  290  3e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1878  cytochrome oxidase assembly  49.71 
 
 		 359 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2502  cytochrome oxidase assembly  47.16 
 
 		 357 aa  275  8e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2927  cytochrome oxidase assembly  50.46 
 
 		 344 aa  274  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548442  hitchhiker  0.000233387 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1204  cytochrome oxidase assembly  47.45 
 
 		 356 aa  269  5e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2709  cytochrome oxidase assembly  50.15 
 
 		 367 aa  267  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0393197 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5863  cytochrome oxidase assembly  49.85 
 
 		 360 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0808  cytochrome oxidase assembly  48.39 
 
 		 359 aa  266  5e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0627  cytochrome oxidase assembly protein  45.07 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00536761  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0782  putative cytochrome c oxidase assembly protein  48.79 
 
 		 382 aa  256  5e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1519  cytochrome oxidase assembly  44.71 
 
 		 341 aa  255  7e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.459506 
 
 
-
 
NC_004310  BR0787  cytochrome c oxidase assembly protein, putative  48.79 
 
 		 358 aa  255  8e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1632  cytochrome oxidase assembly  47.44 
 
 		 381 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1335  cytochrome oxidase assembly  43.82 
 
 		 381 aa  248  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1888  cytochrome oxidase assembly  47.14 
 
 		 382 aa  247  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3028  cytochrome oxidase assembly  46.87 
 
 		 343 aa  246  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0242  cytochrome oxidase assembly  45.87 
 
 		 355 aa  239  4e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177445  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1607  cytochrome oxidase assembly  46.91 
 
 		 382 aa  238  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905771 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4907  cytochrome oxidase assembly  37.1 
 
 		 341 aa  225  9e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5367  cytochrome oxidase assembly  51.64 
 
 		 360 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_002978  WD0432  cytochrome c oxidase assembly protein  38.58 
 
 		 350 aa  222  8e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.668345  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3699  cytochrome oxidase assembly  42.2 
 
 		 391 aa  222  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2097  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3524  cytochrome oxidase assembly  43.9 
 
 		 391 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4596  cytochrome oxidase assembly  52.78 
 
 		 380 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3831  putative cytochrome oxidase assembly factor  43.6 
 
 		 391 aa  219  5e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149666  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2047  cytochrome oxidase assembly  42.09 
 
 		 362 aa  219  7e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  37.39 
 
 		 325 aa  218  2e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43606  predicted protein  38.78 
 
 		 367 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.953763 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1512  putative cytochrome oxidase assembly protein  43.29 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159721  normal  0.764722 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3812  carboxypeptidase Taq  42.73 
 
 		 391 aa  212  7e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0177967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21354  predicted protein  37.79 
 
 		 422 aa  212  7e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.875011  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00720  cytochrome c oxidase biogenesis-related protein, putative  38.37 
 
 		 452 aa  206  7e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.564736  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2432  cytochrome oxidase assembly  39.81 
 
 		 379 aa  201  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.11345 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84097  Cytochrome c oxidase assembly protein COX15  40.11 
 
 		 480 aa  201  1.9999999999999998e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1225  cytochrome oxidase assembly  38.28 
 
 		 367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01915  cytochrome c oxidase assembly protein cox15 (AFU_orthologue; AFUA_6G07670)  38.12 
 
 		 441 aa  194  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0653735 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3288  cytochrome oxidase assembly  43.12 
 
 		 350 aa  192  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0709  cytochrome oxidase assembly  35.49 
 
 		 347 aa  188  1e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0841  cytochrome oxidase assembly  40.91 
 
 		 349 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0294  putative cytochrome oxidase assembly protein  36.75 
 
 		 344 aa  179  5.999999999999999e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1224  cytochrome oxidase assembly  35.92 
 
 		 358 aa  159  7e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  27.19 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  26.99 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  27.07 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  23.29 
 
 		 339 aa  57  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  26.52 
 
 		 363 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  27.13 
 
 		 367 aa  53.1  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  27.73 
 
 		 341 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  22.19 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  23.05 
 
 		 327 aa  48.5  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  24.93 
 
 		 335 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  20.54 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  24.88 
 
 		 327 aa  46.6  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  23.86 
 
 		 335 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  27.2 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  27.2 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  27.2 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  27.2 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  26.91 
 
 		 369 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  29.68 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  26.91 
 
 		 369 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  25.58 
 
 		 373 aa  43.5  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>