125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3028 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3028  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 343 aa  673    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  48.47 
 
 		 364 aa  288  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1519  cytochrome oxidase assembly  46.18 
 
 		 341 aa  286  4e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.459506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  47.77 
 
 		 363 aa  277  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2460  cytochrome oxidase assembly  46.85 
 
 		 389 aa  272  7e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4601  putative cytochrome oxidase assembly protein  47.13 
 
 		 362 aa  271  9e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1316  cytochrome oxidase assembly  44.57 
 
 		 367 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3097  cytochrome oxidase assembly  45.59 
 
 		 370 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1228  cytochrome oxidase assembly  45.65 
 
 		 367 aa  268  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1418  cytochrome oxidase assembly  46.15 
 
 		 360 aa  265  8e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2927  cytochrome oxidase assembly  46.8 
 
 		 344 aa  263  4.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548442  hitchhiker  0.000233387 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2687  cytochrome oxidase assembly  48.04 
 
 		 362 aa  262  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0468581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1160  cytochrome oxidase assembly  47.15 
 
 		 361 aa  257  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0858  cytochrome oxidase assembly  45.54 
 
 		 367 aa  255  7e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  0.254409 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2665  cytochrome oxidase assembly  46.51 
 
 		 365 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.352051  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1204  cytochrome oxidase assembly  42.77 
 
 		 356 aa  246  4e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2502  cytochrome oxidase assembly  44.87 
 
 		 357 aa  245  6.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2701  cytochrome oxidase assembly  46.46 
 
 		 362 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1878  cytochrome oxidase assembly  47.18 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1335  cytochrome oxidase assembly  43.36 
 
 		 381 aa  237  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4907  cytochrome oxidase assembly  38.12 
 
 		 341 aa  234  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0627  cytochrome oxidase assembly protein  39.07 
 
 		 358 aa  229  6e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00536761  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3699  cytochrome oxidase assembly  46.79 
 
 		 391 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2097  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0808  cytochrome oxidase assembly  47.58 
 
 		 359 aa  228  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0782  putative cytochrome c oxidase assembly protein  44.87 
 
 		 382 aa  222  8e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0787  cytochrome c oxidase assembly protein, putative  44.87 
 
 		 358 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3831  putative cytochrome oxidase assembly factor  42.56 
 
 		 391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149666  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3524  cytochrome oxidase assembly  42.26 
 
 		 391 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0242  cytochrome oxidase assembly  43.79 
 
 		 355 aa  215  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177445  normal  0.655757 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01915  cytochrome c oxidase assembly protein cox15 (AFU_orthologue; AFUA_6G07670)  37.5 
 
 		 441 aa  213  2.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0653735 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3812  carboxypeptidase Taq  39.7 
 
 		 391 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0177967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5863  cytochrome oxidase assembly  45.54 
 
 		 360 aa  208  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00720  cytochrome c oxidase biogenesis-related protein, putative  36.78 
 
 		 452 aa  207  2e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.564736  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2047  cytochrome oxidase assembly  37.97 
 
 		 362 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3288  cytochrome oxidase assembly  44.51 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21354  predicted protein  35.96 
 
 		 422 aa  204  1e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.875011  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0432  cytochrome c oxidase assembly protein  34.12 
 
 		 350 aa  204  2e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.668345  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43606  predicted protein  35.69 
 
 		 367 aa  201  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.953763 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1512  putative cytochrome oxidase assembly protein  41.38 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159721  normal  0.764722 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0841  cytochrome oxidase assembly  38.63 
 
 		 349 aa  200  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2709  cytochrome oxidase assembly  44.05 
 
 		 367 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0393197 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  37.27 
 
 		 325 aa  198  9e-50  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84097  Cytochrome c oxidase assembly protein COX15  36.9 
 
 		 480 aa  197  2.0000000000000003e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4596  cytochrome oxidase assembly  46.3 
 
 		 380 aa  193  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1888  cytochrome oxidase assembly  43.67 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1632  cytochrome oxidase assembly  42.99 
 
 		 381 aa  189  8e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1607  cytochrome oxidase assembly  43.9 
 
 		 382 aa  186  5e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905771 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2432  cytochrome oxidase assembly  41.93 
 
 		 379 aa  182  7e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.11345 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1225  cytochrome oxidase assembly  37.35 
 
 		 367 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5367  cytochrome oxidase assembly  46.49 
 
 		 360 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1224  cytochrome oxidase assembly  36.25 
 
 		 358 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0709  cytochrome oxidase assembly  32.73 
 
 		 347 aa  159  9e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0294  putative cytochrome oxidase assembly protein  34.77 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  27.63 
 
 		 363 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  28.11 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  27.22 
 
 		 363 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  27.79 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  27.49 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  23.48 
 
 		 339 aa  66.2  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  30.08 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  24.48 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  28.7 
 
 		 383 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  29.13 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3040  cytochrome oxidase assembly  26.89 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00748587  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  25.77 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  29.17 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  28.49 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  25.55 
 
 		 326 aa  55.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  26.36 
 
 		 392 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  26.81 
 
 		 376 aa  54.7  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3490  cytochrome oxidase assembly  25.99 
 
 		 327 aa  53.9  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  29.81 
 
 		 361 aa  53.5  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  24 
 
 		 327 aa  53.1  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0126  cytochrome oxidase assembly  28.53 
 
 		 359 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  28.15 
 
 		 373 aa  53.1  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0072  cytochrome oxidase assembly  27.3 
 
 		 359 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0043  putative cytochrome oxidase assembly protein  28.88 
 
 		 394 aa  53.1  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.484274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  23.24 
 
 		 339 aa  52.8  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  28.78 
 
 		 370 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  27.94 
 
 		 311 aa  52.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  27.89 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  25.47 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  23.85 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  26.93 
 
 		 369 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  28.49 
 
 		 370 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  25.07 
 
 		 325 aa  51.2  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  26.19 
 
 		 311 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0109  cytochrome oxidase assembly  27.61 
 
 		 359 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.475032  normal  0.476439 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  28.66 
 
 		 369 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  28.49 
 
 		 370 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  24.71 
 
 		 325 aa  50.4  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  28.49 
 
 		 370 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  28.66 
 
 		 369 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  23.03 
 
 		 308 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  28.49 
 
 		 370 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  33.59 
 
 		 339 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  28.66 
 
 		 369 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  28.66 
 
 		 369 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  28.66 
 
 		 369 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  28.66 
 
 		 369 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>