90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4601 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4601  putative cytochrome oxidase assembly protein  100 
 
 		 362 aa  701    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3097  cytochrome oxidase assembly  68.62 
 
 		 370 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2687  cytochrome oxidase assembly  70.26 
 
 		 362 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0468581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2460  cytochrome oxidase assembly  67.75 
 
 		 389 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1418  cytochrome oxidase assembly  66.08 
 
 		 360 aa  428  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2701  cytochrome oxidase assembly  68.01 
 
 		 362 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2665  cytochrome oxidase assembly  66.76 
 
 		 365 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.352051  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  56.73 
 
 		 363 aa  352  5e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0858  cytochrome oxidase assembly  52.44 
 
 		 367 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  0.254409 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1160  cytochrome oxidase assembly  52.84 
 
 		 361 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  49.85 
 
 		 364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1228  cytochrome oxidase assembly  50.15 
 
 		 367 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1316  cytochrome oxidase assembly  49.55 
 
 		 367 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2502  cytochrome oxidase assembly  49.24 
 
 		 357 aa  293  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2927  cytochrome oxidase assembly  48.14 
 
 		 344 aa  275  7e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548442  hitchhiker  0.000233387 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0782  putative cytochrome c oxidase assembly protein  48.65 
 
 		 382 aa  273  4.0000000000000004e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5863  cytochrome oxidase assembly  50 
 
 		 360 aa  272  6e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0787  cytochrome c oxidase assembly protein, putative  48.65 
 
 		 358 aa  272  7e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1204  cytochrome oxidase assembly  46.13 
 
 		 356 aa  266  5.999999999999999e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1878  cytochrome oxidase assembly  48.51 
 
 		 359 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2709  cytochrome oxidase assembly  50.72 
 
 		 367 aa  264  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0393197 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1519  cytochrome oxidase assembly  45.4 
 
 		 341 aa  263  4.999999999999999e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.459506 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0808  cytochrome oxidase assembly  49.12 
 
 		 359 aa  258  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1888  cytochrome oxidase assembly  48.12 
 
 		 382 aa  257  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0627  cytochrome oxidase assembly protein  45.21 
 
 		 358 aa  256  4e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00536761  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1607  cytochrome oxidase assembly  48.41 
 
 		 382 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905771 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1632  cytochrome oxidase assembly  46.85 
 
 		 381 aa  250  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3028  cytochrome oxidase assembly  46.94 
 
 		 343 aa  250  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1335  cytochrome oxidase assembly  43.58 
 
 		 381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5367  cytochrome oxidase assembly  51.37 
 
 		 360 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3831  putative cytochrome oxidase assembly factor  44.76 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149666  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3524  cytochrome oxidase assembly  44.76 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0242  cytochrome oxidase assembly  43.57 
 
 		 355 aa  229  5e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177445  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4907  cytochrome oxidase assembly  36.31 
 
 		 341 aa  223  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84097  Cytochrome c oxidase assembly protein COX15  40.92 
 
 		 480 aa  223  4e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3699  cytochrome oxidase assembly  45.62 
 
 		 391 aa  223  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2097  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2047  cytochrome oxidase assembly  43.19 
 
 		 362 aa  219  5e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4596  cytochrome oxidase assembly  49.05 
 
 		 380 aa  219  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3812  carboxypeptidase Taq  44.13 
 
 		 391 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0177967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1512  putative cytochrome oxidase assembly protein  44.67 
 
 		 383 aa  216  7e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159721  normal  0.764722 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21354  predicted protein  38.32 
 
 		 422 aa  214  9.999999999999999e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.875011  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0432  cytochrome c oxidase assembly protein  38.08 
 
 		 350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.668345  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  39.14 
 
 		 325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43606  predicted protein  39.18 
 
 		 367 aa  206  4e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.953763 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00720  cytochrome c oxidase biogenesis-related protein, putative  39.53 
 
 		 452 aa  205  1e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.564736  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01915  cytochrome c oxidase assembly protein cox15 (AFU_orthologue; AFUA_6G07670)  36.51 
 
 		 441 aa  202  8e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0653735 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2432  cytochrome oxidase assembly  43.5 
 
 		 379 aa  200  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.11345 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0709  cytochrome oxidase assembly  37.85 
 
 		 347 aa  192  8e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0841  cytochrome oxidase assembly  36.78 
 
 		 349 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0294  putative cytochrome oxidase assembly protein  39.21 
 
 		 344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3288  cytochrome oxidase assembly  38.18 
 
 		 350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1225  cytochrome oxidase assembly  36.22 
 
 		 367 aa  172  9e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1224  cytochrome oxidase assembly  36.11 
 
 		 358 aa  160  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  24.79 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  24.51 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  27.8 
 
 		 327 aa  57  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  29.26 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  23.91 
 
 		 325 aa  55.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  28.82 
 
 		 363 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  25.46 
 
 		 363 aa  54.3  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  27.14 
 
 		 369 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  20.36 
 
 		 328 aa  49.3  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4005  cytochrome oxidase assembly  22.77 
 
 		 327 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  31 
 
 		 341 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0705  cytochrome oxidase assembly protein  24 
 
 		 302 aa  47  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  26.2 
 
 		 367 aa  46.6  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  27.27 
 
 		 373 aa  46.6  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  26.14 
 
 		 369 aa  46.2  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  26.14 
 
 		 369 aa  46.2  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  26.14 
 
 		 369 aa  46.2  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  26.14 
 
 		 369 aa  46.2  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  25.57 
 
 		 369 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  25.57 
 
 		 369 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  21.59 
 
 		 327 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1197  cytochrome oxidase assembly  24.42 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1175  cytochrome oxidase assembly  24.42 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  31.06 
 
 		 286 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  27.85 
 
 		 376 aa  45.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  28.68 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  27.51 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  25 
 
 		 367 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  25.43 
 
 		 392 aa  43.9  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  27.51 
 
 		 399 aa  43.9  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  25.57 
 
 		 369 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  25.43 
 
 		 308 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  29.41 
 
 		 308 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13300  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  26.24 
 
 		 287 aa  43.9  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0813876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0981  cytochrome oxidase assembly  25.83 
 
 		 319 aa  43.5  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2430  cytochrome oxidase assembly  28.44 
 
 		 325 aa  43.5  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  25 
 
 		 369 aa  42.7  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>