61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1197 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1175  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 
356 aa  722    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1197  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 
356 aa  722    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0705  cytochrome oxidase assembly protein  80.13 
 
 
302 aa  498  1e-140  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0981  cytochrome oxidase assembly  51.82 
 
 
319 aa  292  6e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3961  cytochrome aa3 controlling protein  46.51 
 
 
311 aa  266  5e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3706  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  46.51 
 
 
311 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.006652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4156  cytochrome aa3 controlling protein  46.51 
 
 
311 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3689  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  46.51 
 
 
311 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3858  cytochrome aa3 controlling protein  46.51 
 
 
311 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4049  cytochrome aa3 controlling protein  46.18 
 
 
311 aa  265  8e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4064  cytochrome aa3 controlling protein  46.51 
 
 
311 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.839964  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3993  cytochrome aa3 controlling protein  46.51 
 
 
311 aa  265  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1191  cytochrome aa3 controlling protein  45.85 
 
 
311 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1853  cytochrome oxidase assembly  50.7 
 
 
317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3772  cytochrome oxidase assembly  46.18 
 
 
311 aa  251  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2648  cytochrome oxidase assembly  46.84 
 
 
313 aa  249  5e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0662  cytochrome oxidase assembly  28.11 
 
 
335 aa  98.6  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1459  cytochrome oxidase assembly  27.01 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.494782  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4134  cytochrome oxidase assembly  34.26 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  24.81 
 
 
622 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2414  cytochrome oxidase assembly  28.52 
 
 
321 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0989704  normal  0.228946 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  26.17 
 
 
286 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0545  cytochrome oxidase assembly  38.61 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  35.65 
 
 
624 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0340  cytochrome oxidase assembly  38.37 
 
 
319 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0224  cytochrome oxidase assembly  36.36 
 
 
318 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15999  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0213  cytochrome oxidase assembly  36.36 
 
 
318 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2076  cytochrome oxidase assembly  21.98 
 
 
326 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.809724 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0200  cytochrome oxidase assembly protein  36.36 
 
 
316 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.571706  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2268  cytochrome oxidase assembly  28.34 
 
 
337 aa  59.3  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00686495  normal  0.0860504 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  24.83 
 
 
337 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0409  cytochrome oxidase assembly  47.83 
 
 
326 aa  54.7  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0707  cytochrome oxidase assembly  36.61 
 
 
317 aa  54.3  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2460  cytochrome oxidase assembly  25.29 
 
 
389 aa  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  24.89 
 
 
331 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1160  cytochrome oxidase assembly  23.91 
 
 
361 aa  50.4  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22000  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  25.7 
 
 
313 aa  50.1  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.891794  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  24.19 
 
 
363 aa  49.3  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  26.14 
 
 
308 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0186  hypothetical protein  27.34 
 
 
137 aa  48.1  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.480963 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2502  cytochrome oxidase assembly  24.72 
 
 
357 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0782  putative cytochrome c oxidase assembly protein  22.73 
 
 
382 aa  47.4  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0787  cytochrome c oxidase assembly protein, putative  22.73 
 
 
358 aa  47  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1353  cytochrome oxidase assembly  25.69 
 
 
320 aa  46.6  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0858  cytochrome oxidase assembly  24.28 
 
 
367 aa  46.2  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  0.254409 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  26.82 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1335  cytochrome oxidase assembly  25.23 
 
 
381 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2099  cytochrome oxidase assembly  25 
 
 
301 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4601  putative cytochrome oxidase assembly protein  24.42 
 
 
362 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314543  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3028  cytochrome oxidase assembly  30.83 
 
 
343 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  26.44 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2407  protoheme IX farnesyltransferase  24.56 
 
 
452 aa  44.7  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.805442  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1632  cytochrome oxidase assembly  26.03 
 
 
381 aa  44.3  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185838  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  23.78 
 
 
311 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  26.92 
 
 
333 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4907  cytochrome oxidase assembly  22.16 
 
 
341 aa  43.9  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1228  cytochrome oxidase assembly  30.3 
 
 
367 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26943  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  26.92 
 
 
311 aa  43.5  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21354  predicted protein  24.08 
 
 
422 aa  43.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.875011  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2709  cytochrome oxidase assembly  27.78 
 
 
367 aa  43.5  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0393197 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3013  cytochrome oxidase assembly  31.45 
 
 
267 aa  42.7  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.217193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>