114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0186 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0186  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  274  3e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.480963 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  29.41 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  32.81 
 
 
311 aa  66.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  30.06 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  31.93 
 
 
333 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2601  putative cytochrome aa3 controlling protein  33.61 
 
 
304 aa  64.3  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.705731 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  33.06 
 
 
307 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  32.86 
 
 
622 aa  61.6  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1780  cytochrome oxidase assembly  32.2 
 
 
304 aa  60.8  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1803  cytochrome oxidase assembly  37.63 
 
 
297 aa  60.8  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1210  cytochrome oxidase assembly  31.36 
 
 
336 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.294531  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  33.62 
 
 
308 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3993  cytochrome aa3 controlling protein  29.6 
 
 
311 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3858  cytochrome aa3 controlling protein  29.6 
 
 
311 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3689  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  29.6 
 
 
311 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3706  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  29.6 
 
 
311 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.006652  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  28.57 
 
 
339 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4156  cytochrome aa3 controlling protein  29.6 
 
 
311 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4064  cytochrome aa3 controlling protein  29.6 
 
 
311 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.839964  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1191  cytochrome aa3 controlling protein  29.6 
 
 
311 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3961  cytochrome aa3 controlling protein  29.6 
 
 
311 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4049  cytochrome aa3 controlling protein  29.6 
 
 
311 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  32.76 
 
 
308 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  32.76 
 
 
308 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  30.17 
 
 
285 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0662  cytochrome oxidase assembly  30.6 
 
 
335 aa  56.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2648  cytochrome oxidase assembly  33.88 
 
 
313 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  26.8 
 
 
339 aa  56.6  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3772  cytochrome oxidase assembly  29.75 
 
 
311 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161471  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1756  cytochrome oxidase assembly  35.29 
 
 
268 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0855621  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  29.75 
 
 
313 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  29.75 
 
 
313 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  25.48 
 
 
399 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1853  cytochrome oxidase assembly  30.71 
 
 
317 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2302  protoheme IX farnesyltransferase  26.52 
 
 
495 aa  53.9  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  25.62 
 
 
396 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2430  cytochrome oxidase assembly  30.09 
 
 
325 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  28.87 
 
 
339 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  26.83 
 
 
326 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1181  protoheme IX farnesyltransferase  27.41 
 
 
482 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0069  cytochrome oxidase assembly  30.67 
 
 
368 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  28.23 
 
 
286 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  26.35 
 
 
342 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0705  cytochrome oxidase assembly protein  25.98 
 
 
302 aa  52  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  24.69 
 
 
404 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0981  cytochrome oxidase assembly  29.69 
 
 
319 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  28.26 
 
 
367 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  21.53 
 
 
327 aa  51.6  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  28 
 
 
370 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  28.99 
 
 
351 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  29.75 
 
 
327 aa  50.4  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  30.53 
 
 
472 aa  50.4  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  27.04 
 
 
323 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1778  hypothetical protein  31.07 
 
 
308 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  28 
 
 
369 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  28 
 
 
369 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  28 
 
 
370 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  28 
 
 
370 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05011  hypothetical protein  31.07 
 
 
308 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.550155  normal  0.119353 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  28 
 
 
369 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  28 
 
 
369 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  24.48 
 
 
341 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  28 
 
 
370 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13300  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  29.85 
 
 
287 aa  50.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0813876  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  28 
 
 
369 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  28 
 
 
369 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  28 
 
 
369 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  28 
 
 
369 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4134  cytochrome oxidase assembly  28.26 
 
 
318 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  26.14 
 
 
373 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2487  protoheme IX farnesyltransferase  31.31 
 
 
478 aa  48.9  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316472  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1459  cytochrome oxidase assembly  27.54 
 
 
337 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.494782  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04451  hypothetical protein  31.45 
 
 
288 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.898486  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1753  putative cytochrome c oxidase assembly protein  31.07 
 
 
327 aa  48.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0609  putative cytochrome c oxidase assembly protein  35.48 
 
 
308 aa  48.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.868245  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1175  cytochrome oxidase assembly  27.34 
 
 
356 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1197  cytochrome oxidase assembly  27.34 
 
 
356 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  32.8 
 
 
483 aa  48.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  26.45 
 
 
328 aa  47.4  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06441  hypothetical protein  28.68 
 
 
307 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0836643 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3013  cytochrome oxidase assembly  27.08 
 
 
267 aa  47  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.217193  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  27.87 
 
 
370 aa  47  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0636  cytochrome oxidase assembly  24.63 
 
 
283 aa  46.2  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  26.23 
 
 
367 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  25.56 
 
 
376 aa  47  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2407  protoheme IX farnesyltransferase  33.05 
 
 
452 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.805442  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0510  hypothetical protein  27.27 
 
 
304 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  26.95 
 
 
335 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  27.05 
 
 
370 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  26.56 
 
 
325 aa  45.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  27.05 
 
 
370 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  25.41 
 
 
369 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  24.83 
 
 
363 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  24.83 
 
 
363 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4163  putative cytochrome oxidase assembly protein  26.23 
 
 
369 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  24.26 
 
 
391 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3827  cytochrome oxidase assembly  26.23 
 
 
411 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.502475 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  25.33 
 
 
363 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  26.24 
 
 
335 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  25 
 
 
383 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>