88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2648 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2648  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 
313 aa  637    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3993  cytochrome aa3 controlling protein  91.91 
 
 
311 aa  578  1e-164  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3961  cytochrome aa3 controlling protein  91.91 
 
 
311 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4064  cytochrome aa3 controlling protein  91.59 
 
 
311 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.839964  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4049  cytochrome aa3 controlling protein  91.26 
 
 
311 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3706  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  91.26 
 
 
311 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.006652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4156  cytochrome aa3 controlling protein  91.26 
 
 
311 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1191  cytochrome aa3 controlling protein  90.94 
 
 
311 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3689  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  91.26 
 
 
311 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3858  cytochrome aa3 controlling protein  91.26 
 
 
311 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3772  cytochrome oxidase assembly  90.94 
 
 
311 aa  551  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161471  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0981  cytochrome oxidase assembly  62.38 
 
 
319 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1853  cytochrome oxidase assembly  63.86 
 
 
317 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0705  cytochrome oxidase assembly protein  48.67 
 
 
302 aa  280  2e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1197  cytochrome oxidase assembly  46.84 
 
 
356 aa  264  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1175  cytochrome oxidase assembly  46.84 
 
 
356 aa  264  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  30.22 
 
 
622 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0662  cytochrome oxidase assembly  28.34 
 
 
335 aa  102  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1459  cytochrome oxidase assembly  39.52 
 
 
337 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.494782  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4134  cytochrome oxidase assembly  36.88 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  28.82 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2414  cytochrome oxidase assembly  29.15 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0989704  normal  0.228946 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0224  cytochrome oxidase assembly  36.36 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15999  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0213  cytochrome oxidase assembly  36.36 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0340  cytochrome oxidase assembly  41.3 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0409  cytochrome oxidase assembly  41.67 
 
 
326 aa  73.6  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0200  cytochrome oxidase assembly protein  34.46 
 
 
316 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.571706  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0545  cytochrome oxidase assembly  37.93 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  35.78 
 
 
624 aa  70.1  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  26.05 
 
 
363 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  25.75 
 
 
363 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0707  cytochrome oxidase assembly  38.3 
 
 
317 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  25.11 
 
 
363 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  27.71 
 
 
373 aa  63.2  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  25.93 
 
 
367 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2076  cytochrome oxidase assembly  23.84 
 
 
326 aa  58.9  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.809724 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  25.22 
 
 
391 aa  58.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2061  cytochrome oxidase assembly  32.12 
 
 
309 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.603923  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0186  hypothetical protein  29.6 
 
 
137 aa  57.4  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.480963 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  26.46 
 
 
313 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  26.46 
 
 
313 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  24.12 
 
 
404 aa  57  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  23.74 
 
 
383 aa  56.6  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  25.11 
 
 
376 aa  54.7  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0133  cytochrome oxidase assembly family protein/cell division protein FtsY  27.05 
 
 
671 aa  53.9  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0334  putative cytochrome aa3 oxidase assembly protein,related to CtaA  28.5 
 
 
327 aa  53.5  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14570  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  28 
 
 
307 aa  53.1  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852831  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  25.74 
 
 
339 aa  52.8  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2249  cytochrome oxidase assembly  24.05 
 
 
386 aa  52.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000165994 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2407  protoheme IX farnesyltransferase  29.91 
 
 
452 aa  52  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.805442  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  25 
 
 
307 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  23.71 
 
 
399 aa  50.4  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  22.68 
 
 
339 aa  50.4  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  22.04 
 
 
331 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  20.38 
 
 
339 aa  50.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  25 
 
 
367 aa  50.1  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  24.32 
 
 
311 aa  50.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  27.86 
 
 
333 aa  50.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  28.44 
 
 
326 aa  49.3  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3827  cytochrome oxidase assembly  24.65 
 
 
411 aa  48.9  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.502475 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  22.84 
 
 
396 aa  48.5  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2347  cytochrome oxidase assembly  28.36 
 
 
328 aa  48.9  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0173507  normal  0.0130822 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  22.76 
 
 
348 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1135  cytochrome oxidase assembly  27.82 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  26.81 
 
 
311 aa  47.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  27.07 
 
 
327 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2302  protoheme IX farnesyltransferase  31.16 
 
 
495 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  20.78 
 
 
337 aa  47  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  23.21 
 
 
323 aa  47.4  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  23.89 
 
 
335 aa  47  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  24.12 
 
 
361 aa  46.6  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1780  cytochrome oxidase assembly  25.36 
 
 
304 aa  46.6  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  25 
 
 
335 aa  46.6  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  28.68 
 
 
351 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22000  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  30.08 
 
 
313 aa  46.6  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.891794  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0636  cytochrome oxidase assembly  25.58 
 
 
283 aa  46.2  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2601  putative cytochrome aa3 controlling protein  29.2 
 
 
304 aa  45.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.705731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  20.92 
 
 
339 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0858  cytochrome oxidase assembly  25.41 
 
 
367 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  0.254409 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  25.63 
 
 
325 aa  43.9  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1335  cytochrome oxidase assembly  25.26 
 
 
381 aa  43.9  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16080  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  24.18 
 
 
323 aa  44.3  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0230  cytochrome oxidase assembly protein  23.51 
 
 
353 aa  43.9  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  22.5 
 
 
341 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2099  cytochrome oxidase assembly  28.06 
 
 
301 aa  43.5  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1228  cytochrome oxidase assembly  26.75 
 
 
367 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26943  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1688  cytochrome oxidase assembly  23.71 
 
 
398 aa  42.7  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  23.05 
 
 
370 aa  42.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>