159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_22000 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_22000  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 313 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.891794  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2347  cytochrome oxidase assembly  63.49 
 
 		 328 aa  312  3.9999999999999997e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0173507  normal  0.0130822 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1353  cytochrome oxidase assembly  57.29 
 
 		 320 aa  282  6.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1666  cytochrome oxidase assembly  57.81 
 
 		 348 aa  281  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00799414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1135  cytochrome oxidase assembly  53.12 
 
 		 318 aa  267  1e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14570  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  51.71 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852831  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1653  cytochrome oxidase assembly  48.01 
 
 		 342 aa  195  8.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  44.56 
 
 		 351 aa  195  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  44.1 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13300  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  46.15 
 
 		 287 aa  188  9e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0813876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2217  cytochrome oxidase assembly  46.38 
 
 		 351 aa  183  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000899528  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2249  cytochrome oxidase assembly  44.1 
 
 		 386 aa  182  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165994 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3312  cytochrome oxidase assembly  45.36 
 
 		 325 aa  182  6e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000656603 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1977  cytochrome oxidase assembly  41.55 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.628163 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16080  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  40.91 
 
 		 323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2543  cytochrome oxidase assembly  47.41 
 
 		 305 aa  172  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0684946  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2061  cytochrome oxidase assembly  47.74 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.603923  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2099  cytochrome oxidase assembly  44.29 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3085  cytochrome oxidase assembly  47.35 
 
 		 326 aa  166  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734948  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5168  cytochrome oxidase assembly  41.08 
 
 		 322 aa  162  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251951  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1995  putative integral membrane transport protein  41.05 
 
 		 351 aa  159  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2430  cytochrome oxidase assembly  41.4 
 
 		 325 aa  159  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6009  hypothetical protein  40.78 
 
 		 329 aa  159  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00257584  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1841  cytochrome oxidase assembly  42.96 
 
 		 314 aa  156  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355712 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1133  cytochrome oxidase assembly  43.06 
 
 		 370 aa  155  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2971  cytochrome oxidase assembly  41.43 
 
 		 370 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2268  cytochrome oxidase assembly  42.26 
 
 		 337 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00686495  normal  0.0860504 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11450  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  38.83 
 
 		 338 aa  150  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.314019  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2553  cytochrome oxidase assembly  40.22 
 
 		 304 aa  146  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0193  cytochrome oxidase assembly  37.23 
 
 		 321 aa  139  6e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2514  cytochrome oxidase assembly  39.86 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787939  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2429  cytochrome oxidase assembly  40.32 
 
 		 342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3684  cytochrome oxidase assembly  40.97 
 
 		 318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2474  cytochrome oxidase assembly  40.32 
 
 		 342 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2467  cytochrome oxidase assembly  40 
 
 		 342 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2726  cytochrome oxidase assembly  37.75 
 
 		 318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0568935  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11484  antibiotic ABC transporter membrane protein  38.19 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.802636 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3264  cytochrome oxidase assembly  41.94 
 
 		 298 aa  105  9e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  33.33 
 
 		 331 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  34.13 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  26.47 
 
 		 622 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  25.09 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0334  putative cytochrome aa3 oxidase assembly protein,related to CtaA  36.11 
 
 		 327 aa  65.9  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1780  cytochrome oxidase assembly  28.42 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  36.64 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2601  putative cytochrome aa3 controlling protein  32.89 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.705731 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  31.79 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  33.33 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3993  cytochrome aa3 controlling protein  31.69 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4049  cytochrome aa3 controlling protein  31.69 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1786  cytochrome oxidase assembly  28.46 
 
 		 338 aa  62  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.637517  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4064  cytochrome aa3 controlling protein  31.69 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.839964  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1459  cytochrome oxidase assembly  34.92 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.494782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  34.13 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3858  cytochrome aa3 controlling protein  31.69 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3689  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  31.69 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3706  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  31.69 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.006652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4156  cytochrome aa3 controlling protein  31.69 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  30.61 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  30.61 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3961  cytochrome aa3 controlling protein  31.69 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1191  cytochrome aa3 controlling protein  31.69 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  25.91 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  31.08 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  24.37 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  30.12 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  30.12 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  32.54 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4134  cytochrome oxidase assembly  33.84 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  27.69 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  33.09 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3772  cytochrome oxidase assembly  30.7 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161471  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  31.97 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  29.41 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  31.3 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1853  cytochrome oxidase assembly  28.28 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  26.32 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  29.05 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  30.87 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  27.94 
 
 		 311 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04451  hypothetical protein  33.59 
 
 		 288 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.898486  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0230  cytochrome oxidase assembly protein  33.58 
 
 		 353 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4613  cytochrome oxidase assembly protein, putative  34.11 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  33.06 
 
 		 311 aa  54.3  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  34.78 
 
 		 383 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1175  cytochrome oxidase assembly  23.97 
 
 		 356 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1197  cytochrome oxidase assembly  23.97 
 
 		 356 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0662  cytochrome oxidase assembly  27.73 
 
 		 335 aa  53.9  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  28.36 
 
 		 328 aa  53.5  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  31.34 
 
 		 327 aa  53.1  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  32.03 
 
 		 396 aa  52.8  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1778  hypothetical protein  35.34 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  33.06 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  33.06 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0981  cytochrome oxidase assembly  28.68 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  31.21 
 
 		 404 aa  51.2  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  33.06 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  33.06 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  33.06 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  33.06 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>