67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11484 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11484  antibiotic ABC transporter membrane protein  100 
 
 		 310 aa  595  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.802636 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3684  cytochrome oxidase assembly  76.55 
 
 		 318 aa  364  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2467  cytochrome oxidase assembly  73.84 
 
 		 342 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2474  cytochrome oxidase assembly  73.84 
 
 		 342 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2429  cytochrome oxidase assembly  73.51 
 
 		 342 aa  361  8e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2726  cytochrome oxidase assembly  76.22 
 
 		 318 aa  352  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0568935  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2514  cytochrome oxidase assembly  49.33 
 
 		 326 aa  267  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787939  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5168  cytochrome oxidase assembly  50 
 
 		 322 aa  218  8.999999999999998e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251951  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16080  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  42.35 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2268  cytochrome oxidase assembly  44.6 
 
 		 337 aa  216  5e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00686495  normal  0.0860504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2553  cytochrome oxidase assembly  44.94 
 
 		 304 aa  169  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1977  cytochrome oxidase assembly  40.48 
 
 		 328 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.628163 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2249  cytochrome oxidase assembly  39.78 
 
 		 386 aa  165  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165994 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2430  cytochrome oxidase assembly  38.03 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6009  hypothetical protein  36.93 
 
 		 329 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00257584  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3312  cytochrome oxidase assembly  43.42 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000656603 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2543  cytochrome oxidase assembly  39.06 
 
 		 305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0684946  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3085  cytochrome oxidase assembly  40.86 
 
 		 326 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734948  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2971  cytochrome oxidase assembly  37.03 
 
 		 370 aa  142  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1653  cytochrome oxidase assembly  38.33 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  38.44 
 
 		 351 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2061  cytochrome oxidase assembly  37.86 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.603923  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2217  cytochrome oxidase assembly  40.38 
 
 		 351 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000899528  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1133  cytochrome oxidase assembly  37.04 
 
 		 370 aa  132  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2347  cytochrome oxidase assembly  38.46 
 
 		 328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0173507  normal  0.0130822 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13300  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  39.54 
 
 		 287 aa  129  6e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0813876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1995  putative integral membrane transport protein  36.84 
 
 		 351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2099  cytochrome oxidase assembly  36.24 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  35.22 
 
 		 337 aa  123  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0193  cytochrome oxidase assembly  35.09 
 
 		 321 aa  122  6e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1841  cytochrome oxidase assembly  38.49 
 
 		 314 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355712 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1135  cytochrome oxidase assembly  35.76 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22000  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  38.37 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.891794  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11450  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  35.59 
 
 		 338 aa  113  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.314019  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1666  cytochrome oxidase assembly  32.7 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00799414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1353  cytochrome oxidase assembly  36.52 
 
 		 320 aa  109  5e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  33.21 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14570  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  35.47 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852831  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3264  cytochrome oxidase assembly  35.98 
 
 		 298 aa  92.8  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  25.91 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  28.31 
 
 		 622 aa  53.5  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  25.53 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  27.44 
 
 		 404 aa  51.2  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1853  cytochrome oxidase assembly  32.26 
 
 		 317 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0981  cytochrome oxidase assembly  26.88 
 
 		 319 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  40 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0296  cytochrome oxidase assembly  38.64 
 
 		 354 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300662  normal  0.0109948 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  28.81 
 
 		 286 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  32.58 
 
 		 339 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  31.34 
 
 		 339 aa  47  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06105  cytochrome oxidase assembly protein  47.22 
 
 		 343 aa  46.6  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  29.08 
 
 		 339 aa  46.6  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  41.18 
 
 		 383 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  37.21 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  25.52 
 
 		 327 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  28.77 
 
 		 396 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  39.22 
 
 		 392 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  37.14 
 
 		 399 aa  43.5  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  30.07 
 
 		 363 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  30.71 
 
 		 325 aa  43.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3858  cytochrome aa3 controlling protein  26.98 
 
 		 311 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  30.07 
 
 		 363 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4156  cytochrome aa3 controlling protein  26.98 
 
 		 311 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3706  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  26.98 
 
 		 311 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.006652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3689  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  26.98 
 
 		 311 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  29.58 
 
 		 367 aa  42.7  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1045  cytochrome oxidase assembly  45.1 
 
 		 356 aa  42.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>