168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1045 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1045  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 
356 aa  682    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  49.52 
 
 
339 aa  266  5e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  48.24 
 
 
339 aa  263  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  49.24 
 
 
325 aa  263  4e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  48.01 
 
 
328 aa  258  9e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  45.95 
 
 
325 aa  257  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0230  cytochrome oxidase assembly protein  43.82 
 
 
353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  48.69 
 
 
327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  49.38 
 
 
326 aa  250  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4318  cytochrome oxidase assembly  47.4 
 
 
325 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4187  cytochrome oxidase assembly  47.4 
 
 
325 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4119  cytochrome oxidase assembly  47.4 
 
 
325 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4613  cytochrome oxidase assembly protein, putative  46.47 
 
 
330 aa  247  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0148  cytochrome oxidase assembly  47.4 
 
 
325 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3490  cytochrome oxidase assembly  48.44 
 
 
327 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4005  cytochrome oxidase assembly  47.74 
 
 
327 aa  238  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0171  cytochrome oxidase assembly  48.85 
 
 
327 aa  232  9e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  44.19 
 
 
335 aa  227  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  43.87 
 
 
335 aa  226  4e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3997  cytochrome oxidase assembly  44.51 
 
 
352 aa  225  9e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3523  cytochrome oxidase assembly  45.45 
 
 
326 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0069  cytochrome oxidase assembly  47.37 
 
 
368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3798  cytochrome oxidase assembly  43.03 
 
 
352 aa  212  7e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3871  cytochrome oxidase assembly  43.03 
 
 
352 aa  212  7e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  48.01 
 
 
339 aa  202  9e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  45.62 
 
 
348 aa  199  9e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0109  cytochrome oxidase assembly  46.33 
 
 
359 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.475032  normal  0.476439 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0072  cytochrome oxidase assembly  44.55 
 
 
359 aa  186  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0126  cytochrome oxidase assembly  46.33 
 
 
359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2711  cytochrome oxidase assembly  38.51 
 
 
375 aa  182  5.0000000000000004e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318505  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  40.77 
 
 
363 aa  182  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04006  cytochrome oxidase assembly  41.97 
 
 
354 aa  181  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0149  cytochrome oxidase assembly  46.08 
 
 
345 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  40.48 
 
 
363 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  40.18 
 
 
363 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0129  cytochrome oxidase assembly  45.69 
 
 
357 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.96534 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00950  Cytochrome oxidase assembly protein  45.29 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  40.53 
 
 
369 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  40.53 
 
 
369 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0124  cytochrome oxidase assembly  45.28 
 
 
359 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190927  normal  0.0274429 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  40.83 
 
 
369 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  40.53 
 
 
369 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  40.53 
 
 
369 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  40.53 
 
 
369 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  40.53 
 
 
369 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3040  cytochrome oxidase assembly  41.84 
 
 
342 aa  170  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00748587  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0334  putative cytochrome aa3 oxidase assembly protein,related to CtaA  45.79 
 
 
327 aa  170  4e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  40.28 
 
 
369 aa  169  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  39.53 
 
 
367 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01360  hypothetical protein  44.22 
 
 
357 aa  165  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0318  cytochrome oxidase assembly  37.14 
 
 
387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  39.34 
 
 
369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  38.94 
 
 
370 aa  160  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  39.05 
 
 
370 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  39.05 
 
 
370 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  38.76 
 
 
370 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0187  hypothetical protein  43.89 
 
 
357 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  37.22 
 
 
367 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  39.2 
 
 
361 aa  157  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  38.14 
 
 
369 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0712  cytochrome oxidase assembly protein  34.41 
 
 
387 aa  156  6e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809899  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  39.64 
 
 
370 aa  156  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  39.64 
 
 
370 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  39.64 
 
 
370 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4163  putative cytochrome oxidase assembly protein  39.94 
 
 
369 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  38.89 
 
 
392 aa  153  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  35.84 
 
 
376 aa  153  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0629  putative cytochrome oxidase assembly protein  34.41 
 
 
387 aa  153  4e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  38.75 
 
 
383 aa  153  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  38.79 
 
 
404 aa  152  7e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04027  cytochrome oxidase assembly protein  37.5 
 
 
387 aa  151  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  36.12 
 
 
396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  39.83 
 
 
391 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  36.12 
 
 
399 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  34.73 
 
 
373 aa  144  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1688  cytochrome oxidase assembly  38.96 
 
 
398 aa  136  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3827  cytochrome oxidase assembly  37.58 
 
 
411 aa  135  9e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.502475 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4383  cytochrome oxidase assembly  37.13 
 
 
406 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4065  cytochrome oxidase assembly  35.77 
 
 
506 aa  129  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.328508  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0043  putative cytochrome oxidase assembly protein  41.81 
 
 
394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.484274  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1387  cytochrome oxidase assembly  37.04 
 
 
407 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0133  cytochrome oxidase assembly family protein/cell division protein FtsY  40.74 
 
 
671 aa  103  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  33.16 
 
 
326 aa  77  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  29.5 
 
 
327 aa  73.2  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  36.18 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1780  cytochrome oxidase assembly  29.54 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  31.16 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  28.53 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  28.53 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  29.88 
 
 
311 aa  68.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  29.19 
 
 
311 aa  67.8  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  36.84 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  25.39 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2047  cytochrome oxidase assembly  28.61 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  24.84 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  30.05 
 
 
308 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2347  cytochrome oxidase assembly  35.75 
 
 
328 aa  63.5  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0173507  normal  0.0130822 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  34.25 
 
 
331 aa  63.5  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  23.46 
 
 
308 aa  62.8  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  30 
 
 
285 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>