157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0230 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0230  cytochrome oxidase assembly protein  100 
 
 		 353 aa  716    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  53.71 
 
 		 325 aa  331  1e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  50.61 
 
 		 327 aa  294  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  45.72 
 
 		 328 aa  290  4e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  49.85 
 
 		 339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  47.81 
 
 		 339 aa  282  7.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  48.48 
 
 		 325 aa  277  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4005  cytochrome oxidase assembly  46.29 
 
 		 327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  43.73 
 
 		 335 aa  268  1e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  42.81 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4613  cytochrome oxidase assembly protein, putative  46.47 
 
 		 330 aa  266  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0069  cytochrome oxidase assembly  45.43 
 
 		 368 aa  266  5e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3490  cytochrome oxidase assembly  47.04 
 
 		 327 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  43.92 
 
 		 326 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3523  cytochrome oxidase assembly  47.48 
 
 		 326 aa  262  6e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4187  cytochrome oxidase assembly  46.6 
 
 		 325 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4119  cytochrome oxidase assembly  46.6 
 
 		 325 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4318  cytochrome oxidase assembly  46.6 
 
 		 325 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0148  cytochrome oxidase assembly  45.95 
 
 		 325 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0072  cytochrome oxidase assembly  46.42 
 
 		 359 aa  252  6e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0109  cytochrome oxidase assembly  45.94 
 
 		 359 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.475032  normal  0.476439 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0171  cytochrome oxidase assembly  45.81 
 
 		 327 aa  250  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0043  putative cytochrome oxidase assembly protein  38.87 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.484274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0126  cytochrome oxidase assembly  45.94 
 
 		 359 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3997  cytochrome oxidase assembly  44.78 
 
 		 352 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  44 
 
 		 339 aa  241  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04006  cytochrome oxidase assembly  45.16 
 
 		 354 aa  239  5.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0149  cytochrome oxidase assembly  47.35 
 
 		 345 aa  236  6e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  43.73 
 
 		 348 aa  233  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0129  cytochrome oxidase assembly  47.04 
 
 		 357 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.96534 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3798  cytochrome oxidase assembly  44.48 
 
 		 352 aa  232  6e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3871  cytochrome oxidase assembly  44.48 
 
 		 352 aa  232  6e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0124  cytochrome oxidase assembly  46.65 
 
 		 359 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190927  normal  0.0274429 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1045  cytochrome oxidase assembly  44.64 
 
 		 356 aa  229  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01360  hypothetical protein  47.27 
 
 		 357 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2711  cytochrome oxidase assembly  41.42 
 
 		 375 aa  225  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318505  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0187  hypothetical protein  46.36 
 
 		 357 aa  219  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3040  cytochrome oxidase assembly  44.37 
 
 		 342 aa  218  8.999999999999998e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00748587  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00950  Cytochrome oxidase assembly protein  46.25 
 
 		 356 aa  216  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  38.87 
 
 		 363 aa  216  5e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0334  putative cytochrome aa3 oxidase assembly protein,related to CtaA  42.94 
 
 		 327 aa  212  9e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0318  cytochrome oxidase assembly  34.29 
 
 		 387 aa  211  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  37.5 
 
 		 363 aa  202  7e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  40.58 
 
 		 361 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  37.2 
 
 		 363 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0629  putative cytochrome oxidase assembly protein  34.12 
 
 		 387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0712  cytochrome oxidase assembly protein  34.12 
 
 		 387 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809899  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04027  cytochrome oxidase assembly protein  32.81 
 
 		 387 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  33.52 
 
 		 404 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  34.12 
 
 		 369 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  35.36 
 
 		 367 aa  180  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  34.78 
 
 		 367 aa  180  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  34.22 
 
 		 369 aa  179  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  34.59 
 
 		 392 aa  177  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  35.01 
 
 		 369 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  35.01 
 
 		 369 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  35.01 
 
 		 369 aa  175  9e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  34.72 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  34.72 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  34.72 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  34.72 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  33.83 
 
 		 369 aa  173  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  33.62 
 
 		 383 aa  170  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  33.83 
 
 		 370 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  33.83 
 
 		 370 aa  169  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  33.83 
 
 		 370 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  33.83 
 
 		 370 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4163  putative cytochrome oxidase assembly protein  35.01 
 
 		 369 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  34.4 
 
 		 370 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  33.83 
 
 		 370 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  33.53 
 
 		 370 aa  165  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  32.84 
 
 		 396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  35.95 
 
 		 391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  32.54 
 
 		 399 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  36.25 
 
 		 376 aa  162  8.000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1387  cytochrome oxidase assembly  34.58 
 
 		 407 aa  152  8.999999999999999e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  33.96 
 
 		 373 aa  146  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4065  cytochrome oxidase assembly  33.52 
 
 		 506 aa  142  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.328508  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3827  cytochrome oxidase assembly  32.19 
 
 		 411 aa  141  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.502475 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4383  cytochrome oxidase assembly  32.35 
 
 		 406 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1688  cytochrome oxidase assembly  34.26 
 
 		 398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0133  cytochrome oxidase assembly family protein/cell division protein FtsY  29.46 
 
 		 671 aa  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  27.71 
 
 		 323 aa  92.8  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  27.41 
 
 		 311 aa  79  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  24.8 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  27.46 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  25 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  22.63 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  30.35 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  26.72 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  26.72 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1778  hypothetical protein  28.24 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1780  cytochrome oxidase assembly  28.83 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1210  cytochrome oxidase assembly  33.02 
 
 		 336 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.294531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  24.18 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05011  hypothetical protein  29.85 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.550155  normal  0.119353 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  24.12 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2502  cytochrome oxidase assembly  22.62 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  24.15 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  22.26 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>