144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0069 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0069  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 
368 aa  730    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0126  cytochrome oxidase assembly  58.65 
 
 
359 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0109  cytochrome oxidase assembly  58.33 
 
 
359 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.475032  normal  0.476439 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0072  cytochrome oxidase assembly  58.01 
 
 
359 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0149  cytochrome oxidase assembly  59.87 
 
 
345 aa  300  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0129  cytochrome oxidase assembly  59.2 
 
 
357 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.96534 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0124  cytochrome oxidase assembly  59.13 
 
 
359 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190927  normal  0.0274429 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01360  hypothetical protein  55.43 
 
 
357 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0187  hypothetical protein  54.86 
 
 
357 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00950  Cytochrome oxidase assembly protein  57.01 
 
 
356 aa  265  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0230  cytochrome oxidase assembly protein  44.91 
 
 
353 aa  260  3e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  44.83 
 
 
335 aa  253  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0043  putative cytochrome oxidase assembly protein  42.12 
 
 
394 aa  253  4.0000000000000004e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.484274  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  45.14 
 
 
335 aa  251  1e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  48.04 
 
 
339 aa  249  6e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  45.65 
 
 
339 aa  249  6e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  44.61 
 
 
328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  43.66 
 
 
339 aa  241  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  46.58 
 
 
327 aa  235  8e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  45.86 
 
 
348 aa  227  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  41.41 
 
 
325 aa  222  8e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  43.12 
 
 
325 aa  220  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  44.75 
 
 
326 aa  216  5e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  43.65 
 
 
363 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4613  cytochrome oxidase assembly protein, putative  42.21 
 
 
330 aa  207  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4005  cytochrome oxidase assembly  45.39 
 
 
327 aa  207  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3490  cytochrome oxidase assembly  46.53 
 
 
327 aa  207  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  42.01 
 
 
363 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3523  cytochrome oxidase assembly  46.28 
 
 
326 aa  206  6e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  41.72 
 
 
363 aa  206  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3040  cytochrome oxidase assembly  47.47 
 
 
342 aa  205  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00748587  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4187  cytochrome oxidase assembly  44.16 
 
 
325 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4318  cytochrome oxidase assembly  44.16 
 
 
325 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4119  cytochrome oxidase assembly  44.16 
 
 
325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0148  cytochrome oxidase assembly  44.16 
 
 
325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0334  putative cytochrome aa3 oxidase assembly protein,related to CtaA  48.67 
 
 
327 aa  200  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0171  cytochrome oxidase assembly  44.88 
 
 
327 aa  196  6e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  46.05 
 
 
361 aa  195  9e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  40.58 
 
 
369 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  40.58 
 
 
369 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  40.58 
 
 
369 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  40.58 
 
 
369 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  40.58 
 
 
369 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  40.58 
 
 
369 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  40.98 
 
 
370 aa  192  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04006  cytochrome oxidase assembly  43.59 
 
 
354 aa  191  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1045  cytochrome oxidase assembly  47.57 
 
 
356 aa  191  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  40 
 
 
370 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  40 
 
 
370 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  40.58 
 
 
369 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  40.58 
 
 
369 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3997  cytochrome oxidase assembly  41.77 
 
 
352 aa  190  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  39.71 
 
 
370 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  41.16 
 
 
369 aa  187  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3798  cytochrome oxidase assembly  43.08 
 
 
352 aa  185  8e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3871  cytochrome oxidase assembly  43.08 
 
 
352 aa  185  8e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  41.4 
 
 
367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  37.57 
 
 
399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  36.98 
 
 
383 aa  184  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  37.06 
 
 
396 aa  184  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0318  cytochrome oxidase assembly  34.92 
 
 
387 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0712  cytochrome oxidase assembly protein  33.77 
 
 
387 aa  183  5.0000000000000004e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809899  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0629  putative cytochrome oxidase assembly protein  33.77 
 
 
387 aa  182  7e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  40.98 
 
 
369 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  40.67 
 
 
370 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  40.37 
 
 
370 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  40.67 
 
 
370 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  40.97 
 
 
367 aa  179  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  39.52 
 
 
404 aa  179  9e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4163  putative cytochrome oxidase assembly protein  42.2 
 
 
369 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2711  cytochrome oxidase assembly  39.55 
 
 
375 aa  177  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318505  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3827  cytochrome oxidase assembly  38.44 
 
 
411 aa  177  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.502475 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04027  cytochrome oxidase assembly protein  34.04 
 
 
387 aa  175  9e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  36.08 
 
 
392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  38.94 
 
 
376 aa  172  6.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4383  cytochrome oxidase assembly  38.99 
 
 
406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  40.62 
 
 
391 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1387  cytochrome oxidase assembly  38.7 
 
 
407 aa  163  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4065  cytochrome oxidase assembly  38.55 
 
 
506 aa  155  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.328508  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1688  cytochrome oxidase assembly  41.08 
 
 
398 aa  152  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  39.32 
 
 
373 aa  149  6e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0133  cytochrome oxidase assembly family protein/cell division protein FtsY  36.23 
 
 
671 aa  100  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  31.73 
 
 
286 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  29.53 
 
 
323 aa  65.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  28.17 
 
 
311 aa  64.7  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  29.74 
 
 
285 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0186  hypothetical protein  30.87 
 
 
137 aa  60.5  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.480963 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  28.21 
 
 
308 aa  60.1  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  23.65 
 
 
326 aa  59.3  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  27.6 
 
 
308 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  27.04 
 
 
339 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  25.95 
 
 
342 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  30.13 
 
 
308 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4596  cytochrome oxidase assembly  26.69 
 
 
380 aa  56.2  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  30.97 
 
 
311 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  25.88 
 
 
313 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  25.88 
 
 
313 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2076  cytochrome oxidase assembly  23.86 
 
 
326 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.809724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  31.58 
 
 
333 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1780  cytochrome oxidase assembly  26.54 
 
 
304 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>