164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0251 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 326 aa  655    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3523  cytochrome oxidase assembly  77.91 
 
 		 326 aa  463  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  72 
 
 		 328 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4005  cytochrome oxidase assembly  73.39 
 
 		 327 aa  437  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0171  cytochrome oxidase assembly  74.01 
 
 		 327 aa  430  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  67.89 
 
 		 327 aa  420  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4613  cytochrome oxidase assembly protein, putative  70.55 
 
 		 330 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4119  cytochrome oxidase assembly  72.7 
 
 		 325 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4187  cytochrome oxidase assembly  72.39 
 
 		 325 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0148  cytochrome oxidase assembly  72.39 
 
 		 325 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  66.87 
 
 		 325 aa  412  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4318  cytochrome oxidase assembly  72.39 
 
 		 325 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3490  cytochrome oxidase assembly  66.06 
 
 		 327 aa  397  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3997  cytochrome oxidase assembly  64.02 
 
 		 352 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3798  cytochrome oxidase assembly  63.46 
 
 		 352 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3871  cytochrome oxidase assembly  63.46 
 
 		 352 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  48.77 
 
 		 339 aa  329  4e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  49.07 
 
 		 339 aa  326  4.0000000000000003e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  50.61 
 
 		 325 aa  311  1e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0230  cytochrome oxidase assembly protein  45.1 
 
 		 353 aa  259  4e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  45.42 
 
 		 335 aa  250  3e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  44.44 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0072  cytochrome oxidase assembly  47.44 
 
 		 359 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  45.81 
 
 		 339 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2711  cytochrome oxidase assembly  43.63 
 
 		 375 aa  231  1e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318505  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0126  cytochrome oxidase assembly  44.75 
 
 		 359 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0149  cytochrome oxidase assembly  49.84 
 
 		 345 aa  230  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1045  cytochrome oxidase assembly  49.03 
 
 		 356 aa  230  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0109  cytochrome oxidase assembly  44.75 
 
 		 359 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.475032  normal  0.476439 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0043  putative cytochrome oxidase assembly protein  38.19 
 
 		 394 aa  226  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.484274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  43.67 
 
 		 348 aa  224  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0124  cytochrome oxidase assembly  45.06 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190927  normal  0.0274429 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0069  cytochrome oxidase assembly  45.27 
 
 		 368 aa  224  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00950  Cytochrome oxidase assembly protein  49.07 
 
 		 356 aa  222  7e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04006  cytochrome oxidase assembly  45.42 
 
 		 354 aa  219  3.9999999999999997e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0129  cytochrome oxidase assembly  46.91 
 
 		 357 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.96534 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  45.03 
 
 		 361 aa  214  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01360  hypothetical protein  48.57 
 
 		 357 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0187  hypothetical protein  48.25 
 
 		 357 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0334  putative cytochrome aa3 oxidase assembly protein,related to CtaA  44.48 
 
 		 327 aa  208  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  38.75 
 
 		 367 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  37.89 
 
 		 363 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0318  cytochrome oxidase assembly  35.75 
 
 		 387 aa  200  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  36.98 
 
 		 399 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3040  cytochrome oxidase assembly  42.31 
 
 		 342 aa  199  5e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00748587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  36.69 
 
 		 396 aa  199  5e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04027  cytochrome oxidase assembly protein  35.64 
 
 		 387 aa  198  7.999999999999999e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  40.12 
 
 		 369 aa  198  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  36.14 
 
 		 363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  38.12 
 
 		 363 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  39.63 
 
 		 369 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  38.39 
 
 		 369 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  39.38 
 
 		 367 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  38.39 
 
 		 369 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  38.39 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  38.7 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  38.39 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  38.39 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  38.39 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4163  putative cytochrome oxidase assembly protein  40.56 
 
 		 369 aa  192  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  38.46 
 
 		 370 aa  192  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  38.39 
 
 		 369 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0629  putative cytochrome oxidase assembly protein  34.15 
 
 		 387 aa  191  1e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  38.7 
 
 		 370 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  38.7 
 
 		 370 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  38.7 
 
 		 370 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0712  cytochrome oxidase assembly protein  34.15 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809899  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  38.77 
 
 		 370 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  38.7 
 
 		 370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  38.34 
 
 		 370 aa  189  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  36.23 
 
 		 404 aa  188  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  34.85 
 
 		 392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  35.96 
 
 		 376 aa  172  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  34.7 
 
 		 391 aa  168  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1387  cytochrome oxidase assembly  35.38 
 
 		 407 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  37.28 
 
 		 373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  33.85 
 
 		 383 aa  163  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4383  cytochrome oxidase assembly  34.73 
 
 		 406 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3827  cytochrome oxidase assembly  35.17 
 
 		 411 aa  158  9e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.502475 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4065  cytochrome oxidase assembly  33.23 
 
 		 506 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.328508  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1688  cytochrome oxidase assembly  36.02 
 
 		 398 aa  150  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0133  cytochrome oxidase assembly family protein/cell division protein FtsY  33.13 
 
 		 671 aa  97.8  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1780  cytochrome oxidase assembly  31.06 
 
 		 304 aa  89.4  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  29.74 
 
 		 323 aa  87.8  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  33.67 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  29.07 
 
 		 341 aa  75.9  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  32.66 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  27.16 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  32.84 
 
 		 307 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  31.86 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1210  cytochrome oxidase assembly  34.17 
 
 		 336 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.294531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  31.86 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  34.21 
 
 		 311 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05011  hypothetical protein  25.08 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.550155  normal  0.119353 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1778  hypothetical protein  24.76 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04451  hypothetical protein  31.79 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.898486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  26.44 
 
 		 286 aa  67  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1204  cytochrome oxidase assembly  24.71 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  26.35 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  25.38 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>