161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1778 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  100 
 
 
323 aa  651    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  40.57 
 
 
342 aa  244  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  42.24 
 
 
339 aa  243  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  41.06 
 
 
326 aa  217  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  37.54 
 
 
327 aa  203  4e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06105  cytochrome oxidase assembly protein  32.94 
 
 
343 aa  187  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0296  cytochrome oxidase assembly  34.24 
 
 
354 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300662  normal  0.0109948 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  37.58 
 
 
311 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  34.1 
 
 
341 aa  169  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  33.15 
 
 
335 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  26.02 
 
 
363 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  32.61 
 
 
335 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  25.54 
 
 
367 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4613  cytochrome oxidase assembly protein, putative  30.09 
 
 
330 aa  87  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  26.64 
 
 
327 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  32.08 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  29.74 
 
 
326 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  27.01 
 
 
328 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  32.84 
 
 
325 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  28.5 
 
 
339 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3997  cytochrome oxidase assembly  32.34 
 
 
352 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  25 
 
 
325 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0230  cytochrome oxidase assembly protein  31.91 
 
 
353 aa  78.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3798  cytochrome oxidase assembly  31.74 
 
 
352 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3871  cytochrome oxidase assembly  31.74 
 
 
352 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  25.09 
 
 
363 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  25.57 
 
 
367 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4187  cytochrome oxidase assembly  32.39 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4318  cytochrome oxidase assembly  32.39 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4119  cytochrome oxidase assembly  32.39 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  24.63 
 
 
363 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  25.34 
 
 
404 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0148  cytochrome oxidase assembly  32.39 
 
 
325 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  25.22 
 
 
376 aa  77.4  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0171  cytochrome oxidase assembly  25.28 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4005  cytochrome oxidase assembly  28.36 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  29.44 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  27 
 
 
392 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  24.79 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  33.74 
 
 
339 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  24.66 
 
 
399 aa  73.6  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  30.15 
 
 
348 aa  72.4  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  22.97 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  29.46 
 
 
391 aa  70.9  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3523  cytochrome oxidase assembly  25 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0334  putative cytochrome aa3 oxidase assembly protein,related to CtaA  27.46 
 
 
327 aa  68.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0072  cytochrome oxidase assembly  31.58 
 
 
359 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  29.3 
 
 
331 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3490  cytochrome oxidase assembly  29.79 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3040  cytochrome oxidase assembly  29.14 
 
 
342 aa  66.2  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00748587  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  24.56 
 
 
369 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  29.09 
 
 
308 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0043  putative cytochrome oxidase assembly protein  28.33 
 
 
394 aa  64.3  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.484274  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  33.11 
 
 
285 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2249  cytochrome oxidase assembly  28.23 
 
 
386 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000165994 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  25.15 
 
 
383 aa  63.9  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2430  cytochrome oxidase assembly  25.73 
 
 
325 aa  63.5  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  28.48 
 
 
308 aa  62.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4383  cytochrome oxidase assembly  24.91 
 
 
406 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  28.86 
 
 
369 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2711  cytochrome oxidase assembly  30 
 
 
375 aa  62  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318505  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  25.98 
 
 
308 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  30 
 
 
307 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  29.45 
 
 
370 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  28.86 
 
 
369 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  29.45 
 
 
370 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  29.45 
 
 
370 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  28.86 
 
 
369 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  28.86 
 
 
369 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  28.19 
 
 
369 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0069  cytochrome oxidase assembly  29.85 
 
 
368 aa  60.8  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  28.19 
 
 
369 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  28.19 
 
 
369 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  28.19 
 
 
369 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0126  cytochrome oxidase assembly  26.95 
 
 
359 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0149  cytochrome oxidase assembly  28.03 
 
 
345 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  28.77 
 
 
370 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0193  cytochrome oxidase assembly  26.92 
 
 
321 aa  59.7  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1778  hypothetical protein  26.06 
 
 
308 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1045  cytochrome oxidase assembly  29.71 
 
 
356 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05011  hypothetical protein  26.67 
 
 
308 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.550155  normal  0.119353 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00950  Cytochrome oxidase assembly protein  31.21 
 
 
356 aa  58.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04027  cytochrome oxidase assembly protein  24.02 
 
 
387 aa  58.5  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0109  cytochrome oxidase assembly  26.24 
 
 
359 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.475032  normal  0.476439 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  30.88 
 
 
311 aa  58.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  24.03 
 
 
369 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  25 
 
 
351 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0629  putative cytochrome oxidase assembly protein  37.97 
 
 
387 aa  57.4  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0712  cytochrome oxidase assembly protein  37.97 
 
 
387 aa  57.4  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809899  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0124  cytochrome oxidase assembly  26.95 
 
 
359 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190927  normal  0.0274429 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  31.62 
 
 
333 aa  57  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6009  hypothetical protein  27.16 
 
 
329 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00257584  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1780  cytochrome oxidase assembly  29.63 
 
 
304 aa  56.6  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  27.97 
 
 
370 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  27.97 
 
 
370 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0129  cytochrome oxidase assembly  27.27 
 
 
357 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.96534 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  27.27 
 
 
370 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2601  putative cytochrome aa3 controlling protein  30.15 
 
 
304 aa  56.2  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.705731 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  29.37 
 
 
622 aa  55.8  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0318  cytochrome oxidase assembly  23.84 
 
 
387 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14987 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>