86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_04006 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_04006  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 354 aa  719    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  55.05 
 
 		 325 aa  288  8e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0230  cytochrome oxidase assembly protein  45.12 
 
 		 353 aa  235  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  46.07 
 
 		 339 aa  230  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  46.53 
 
 		 328 aa  227  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  43.53 
 
 		 339 aa  219  7.999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  47.25 
 
 		 327 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  45.68 
 
 		 326 aa  210  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4005  cytochrome oxidase assembly  45.76 
 
 		 327 aa  202  8e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  44.77 
 
 		 325 aa  199  5e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4613  cytochrome oxidase assembly protein, putative  46.93 
 
 		 330 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0069  cytochrome oxidase assembly  41.87 
 
 		 368 aa  194  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  39.04 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  38.36 
 
 		 335 aa  192  6e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3523  cytochrome oxidase assembly  43.75 
 
 		 326 aa  192  9e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  45.22 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0171  cytochrome oxidase assembly  45.96 
 
 		 327 aa  187  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0072  cytochrome oxidase assembly  43.1 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3997  cytochrome oxidase assembly  44.41 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0126  cytochrome oxidase assembly  41.2 
 
 		 359 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0148  cytochrome oxidase assembly  45.05 
 
 		 325 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0109  cytochrome oxidase assembly  41.16 
 
 		 359 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.475032  normal  0.476439 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4187  cytochrome oxidase assembly  44.69 
 
 		 325 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4119  cytochrome oxidase assembly  44.69 
 
 		 325 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0043  putative cytochrome oxidase assembly protein  36.15 
 
 		 394 aa  183  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.484274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  41.58 
 
 		 348 aa  182  7e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4318  cytochrome oxidase assembly  44.69 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3798  cytochrome oxidase assembly  43.71 
 
 		 352 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3871  cytochrome oxidase assembly  43.71 
 
 		 352 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3040  cytochrome oxidase assembly  42.65 
 
 		 342 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00748587  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3490  cytochrome oxidase assembly  44.72 
 
 		 327 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0124  cytochrome oxidase assembly  43.86 
 
 		 359 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190927  normal  0.0274429 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0149  cytochrome oxidase assembly  43.07 
 
 		 345 aa  169  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0318  cytochrome oxidase assembly  35.65 
 
 		 387 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1045  cytochrome oxidase assembly  42.59 
 
 		 356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04027  cytochrome oxidase assembly protein  34.81 
 
 		 387 aa  158  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0334  putative cytochrome aa3 oxidase assembly protein,related to CtaA  43.7 
 
 		 327 aa  156  6e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0129  cytochrome oxidase assembly  40.14 
 
 		 357 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.96534 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  46.01 
 
 		 361 aa  155  7e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01360  hypothetical protein  44.24 
 
 		 357 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2711  cytochrome oxidase assembly  38.46 
 
 		 375 aa  152  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318505  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0187  hypothetical protein  43.88 
 
 		 357 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0712  cytochrome oxidase assembly protein  32.16 
 
 		 387 aa  149  6e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809899  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  37.82 
 
 		 363 aa  149  9e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0629  putative cytochrome oxidase assembly protein  32.16 
 
 		 387 aa  146  6e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  37.67 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  37.11 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00950  Cytochrome oxidase assembly protein  45 
 
 		 356 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  36.99 
 
 		 369 aa  136  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  35.96 
 
 		 369 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  35.96 
 
 		 369 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  35.96 
 
 		 369 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  36.3 
 
 		 369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  35.96 
 
 		 369 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  36.3 
 
 		 369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  36.3 
 
 		 369 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  36.24 
 
 		 369 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  35.17 
 
 		 369 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  33.22 
 
 		 376 aa  126  7e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  34.59 
 
 		 370 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  34.59 
 
 		 370 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  34.25 
 
 		 370 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  34.25 
 
 		 370 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  31.67 
 
 		 392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  31.16 
 
 		 383 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  35.23 
 
 		 367 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  33.57 
 
 		 367 aa  119  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  35.62 
 
 		 370 aa  119  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  33.9 
 
 		 370 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4163  putative cytochrome oxidase assembly protein  35.17 
 
 		 369 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  33.56 
 
 		 370 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  31.19 
 
 		 396 aa  116  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  31.86 
 
 		 399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  32.99 
 
 		 373 aa  106  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1387  cytochrome oxidase assembly  31.04 
 
 		 407 aa  106  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  29.39 
 
 		 404 aa  103  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1688  cytochrome oxidase assembly  31.8 
 
 		 398 aa  99.8  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3827  cytochrome oxidase assembly  31.1 
 
 		 411 aa  98.6  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.502475 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4383  cytochrome oxidase assembly  32.13 
 
 		 406 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4065  cytochrome oxidase assembly  32.73 
 
 		 506 aa  95.1  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.328508  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  31.91 
 
 		 391 aa  88.6  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0133  cytochrome oxidase assembly family protein/cell division protein FtsY  35.71 
 
 		 671 aa  72.8  0.000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  25.09 
 
 		 286 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1160  cytochrome oxidase assembly  25.79 
 
 		 361 aa  46.2  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  26.81 
 
 		 364 aa  46.2  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  23.76 
 
 		 325 aa  43.9  0.004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>