138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1780 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1780  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 
304 aa  604  9.999999999999999e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  74.32 
 
 
333 aa  431  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  69.86 
 
 
311 aa  417  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  67.67 
 
 
307 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  67.33 
 
 
313 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  67.33 
 
 
313 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1210  cytochrome oxidase assembly  61.18 
 
 
336 aa  344  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.294531  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2601  putative cytochrome aa3 controlling protein  52.31 
 
 
304 aa  233  3e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.705731 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  37.99 
 
 
285 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  35.53 
 
 
308 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05011  hypothetical protein  38.11 
 
 
308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.550155  normal  0.119353 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1778  hypothetical protein  37.16 
 
 
308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06441  hypothetical protein  38.1 
 
 
307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0836643 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04451  hypothetical protein  41.02 
 
 
288 aa  152  8e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.898486  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  36.23 
 
 
308 aa  152  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  36.6 
 
 
308 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0609  putative cytochrome c oxidase assembly protein  41.49 
 
 
308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.868245  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1753  putative cytochrome c oxidase assembly protein  41.32 
 
 
327 aa  144  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  32.5 
 
 
367 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  35 
 
 
367 aa  91.3  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  30.5 
 
 
363 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  31.68 
 
 
363 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  29.08 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  30.5 
 
 
363 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  28.79 
 
 
335 aa  77  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  28 
 
 
335 aa  76.3  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  30.61 
 
 
326 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  39.23 
 
 
361 aa  72.8  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  31.19 
 
 
404 aa  70.1  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  33 
 
 
399 aa  69.3  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  27.97 
 
 
328 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0334  putative cytochrome aa3 oxidase assembly protein,related to CtaA  32.98 
 
 
327 aa  68.9  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  32.18 
 
 
369 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  32.18 
 
 
370 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  29.67 
 
 
391 aa  67.8  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  32.18 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  32.18 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  33 
 
 
396 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  32.18 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  32.18 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  32.18 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  32.18 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  32.18 
 
 
370 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  32.18 
 
 
370 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  32.18 
 
 
369 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  32.18 
 
 
370 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  32.11 
 
 
327 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  26.6 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  29.58 
 
 
383 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  33.17 
 
 
370 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  33.17 
 
 
370 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  33.85 
 
 
339 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  35.51 
 
 
325 aa  64.3  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3013  cytochrome oxidase assembly  34.15 
 
 
267 aa  63.9  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.217193  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  32.18 
 
 
370 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  27.81 
 
 
339 aa  60.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0186  hypothetical protein  32.2 
 
 
137 aa  60.8  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.480963 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1803  cytochrome oxidase assembly  38.38 
 
 
297 aa  60.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  32.99 
 
 
339 aa  60.8  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4163  putative cytochrome oxidase assembly protein  33.33 
 
 
369 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  26.44 
 
 
341 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  31.91 
 
 
369 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1786  cytochrome oxidase assembly  27.12 
 
 
338 aa  60.1  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.637517  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1756  cytochrome oxidase assembly  40.17 
 
 
268 aa  60.1  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0855621  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  32.61 
 
 
369 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  26.87 
 
 
373 aa  59.3  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0230  cytochrome oxidase assembly protein  28.83 
 
 
353 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  31.97 
 
 
331 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  31.51 
 
 
392 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4005  cytochrome oxidase assembly  28.71 
 
 
327 aa  58.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  27.62 
 
 
286 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  29.63 
 
 
323 aa  56.6  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  34.13 
 
 
325 aa  56.6  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3827  cytochrome oxidase assembly  34.4 
 
 
411 aa  56.6  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.502475 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4613  cytochrome oxidase assembly protein, putative  34.09 
 
 
330 aa  55.8  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3523  cytochrome oxidase assembly  28.16 
 
 
326 aa  55.8  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2076  cytochrome oxidase assembly  37.11 
 
 
326 aa  55.8  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.809724 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2956  Uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly-like protein  27.65 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1688  cytochrome oxidase assembly  27.52 
 
 
398 aa  55.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  28.85 
 
 
376 aa  55.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1387  cytochrome oxidase assembly  31.07 
 
 
407 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1045  cytochrome oxidase assembly  32.55 
 
 
356 aa  54.3  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0636  cytochrome oxidase assembly  31.58 
 
 
283 aa  53.5  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2268  cytochrome oxidase assembly  27.01 
 
 
337 aa  53.1  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00686495  normal  0.0860504 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0171  cytochrome oxidase assembly  32.63 
 
 
327 aa  53.1  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2099  cytochrome oxidase assembly  31.65 
 
 
301 aa  52  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0149  cytochrome oxidase assembly  35.71 
 
 
345 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2249  cytochrome oxidase assembly  31.37 
 
 
386 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000165994 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22000  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  28.66 
 
 
313 aa  52  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.891794  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0043  putative cytochrome oxidase assembly protein  27.08 
 
 
394 aa  50.4  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.484274  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4383  cytochrome oxidase assembly  31.88 
 
 
406 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0069  cytochrome oxidase assembly  33.08 
 
 
368 aa  50.4  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  24.21 
 
 
622 aa  50.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0072  cytochrome oxidase assembly  31.75 
 
 
359 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  36 
 
 
348 aa  49.3  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3798  cytochrome oxidase assembly  34.13 
 
 
352 aa  49.3  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3871  cytochrome oxidase assembly  34.13 
 
 
352 aa  49.3  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3997  cytochrome oxidase assembly  34.31 
 
 
352 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2302  protoheme IX farnesyltransferase  32.39 
 
 
495 aa  47.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1841  cytochrome oxidase assembly  33.09 
 
 
314 aa  47  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355712 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>