138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0609 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0609  putative cytochrome c oxidase assembly protein  100 
 
 		 308 aa  582  1.0000000000000001e-165  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.868245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06441  hypothetical protein  63.52 
 
 		 307 aa  333  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0836643 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1753  putative cytochrome c oxidase assembly protein  67.43 
 
 		 327 aa  324  1e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05011  hypothetical protein  53.2 
 
 		 308 aa  296  4e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.550155  normal  0.119353 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1778  hypothetical protein  52.19 
 
 		 308 aa  295  8e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04451  hypothetical protein  49.45 
 
 		 288 aa  286  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.898486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  40.68 
 
 		 308 aa  239  5e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  40.43 
 
 		 308 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  40.49 
 
 		 308 aa  235  6e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  41.2 
 
 		 285 aa  228  9e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  40.92 
 
 		 313 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  40.92 
 
 		 313 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2601  putative cytochrome aa3 controlling protein  42.72 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.705731 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  43.57 
 
 		 307 aa  178  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1780  cytochrome oxidase assembly  40.35 
 
 		 304 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  37.59 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  40.81 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1210  cytochrome oxidase assembly  42.21 
 
 		 336 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.294531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  32.84 
 
 		 363 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  32.18 
 
 		 367 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  32.34 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  31.84 
 
 		 363 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  32.16 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  28.61 
 
 		 341 aa  76.3  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  32.02 
 
 		 326 aa  75.9  0.0000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  31.51 
 
 		 396 aa  75.9  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  31.31 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  28.13 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  34.16 
 
 		 367 aa  72.8  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  31.28 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  32.97 
 
 		 335 aa  72.4  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  32.97 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  28.19 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  34.25 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  30.52 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  36.92 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  36.92 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  36.92 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  36.92 
 
 		 370 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  36.15 
 
 		 369 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  35.66 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  36.43 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  36.15 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  35.66 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  35.66 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  36.43 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  35.66 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  28.21 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  33.33 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  28.64 
 
 		 404 aa  62.8  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  36.75 
 
 		 370 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  32.84 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  36.75 
 
 		 370 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  36.75 
 
 		 370 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  30.37 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  32.45 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  30.1 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  32.61 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4163  putative cytochrome oxidase assembly protein  33.85 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1387  cytochrome oxidase assembly  31.25 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  30.75 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  38.13 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  34.38 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  34.13 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  34.07 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  26.58 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  25.64 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3013  cytochrome oxidase assembly  36.22 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.217193  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4613  cytochrome oxidase assembly protein, putative  31.96 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2430  cytochrome oxidase assembly  35.48 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4907  cytochrome oxidase assembly  25.76 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  38.02 
 
 		 622 aa  56.2  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0230  cytochrome oxidase assembly protein  32.39 
 
 		 353 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0149  cytochrome oxidase assembly  34.96 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2249  cytochrome oxidase assembly  31.62 
 
 		 386 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165994 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0186  hypothetical protein  27.87 
 
 		 137 aa  54.7  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.480963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4383  cytochrome oxidase assembly  29.14 
 
 		 406 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  27.62 
 
 		 286 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0334  putative cytochrome aa3 oxidase assembly protein,related to CtaA  35.77 
 
 		 327 aa  53.9  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0193  cytochrome oxidase assembly  33.04 
 
 		 321 aa  53.5  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0171  cytochrome oxidase assembly  31.54 
 
 		 327 aa  53.5  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11450  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  33.85 
 
 		 338 aa  52.8  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.314019  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1688  cytochrome oxidase assembly  30.4 
 
 		 398 aa  52.8  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1803  cytochrome oxidase assembly  36.17 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0069  cytochrome oxidase assembly  31.75 
 
 		 368 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  30.23 
 
 		 327 aa  52.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0242  cytochrome oxidase assembly  29.87 
 
 		 355 aa  51.6  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177445  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2099  cytochrome oxidase assembly  33.56 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  29.46 
 
 		 325 aa  51.2  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  35.22 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3827  cytochrome oxidase assembly  32.52 
 
 		 411 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.502475 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0072  cytochrome oxidase assembly  29.73 
 
 		 359 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3040  cytochrome oxidase assembly  29.03 
 
 		 342 aa  50.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00748587  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1756  cytochrome oxidase assembly  40.21 
 
 		 268 aa  50.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0855621  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06105  cytochrome oxidase assembly protein  22.29 
 
 		 343 aa  50.4  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  31.21 
 
 		 337 aa  50.4  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6009  hypothetical protein  33.11 
 
 		 329 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00257584  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13300  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  35.25 
 
 		 287 aa  50.1  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0813876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4065  cytochrome oxidase assembly  28.21 
 
 		 506 aa  49.7  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.328508  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2076  cytochrome oxidase assembly  40.82 
 
 		 326 aa  49.7  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.809724 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>