158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3469 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 342 aa  686    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  50.46 
 
 		 339 aa  308  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  40.57 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  43.79 
 
 		 327 aa  229  5e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0296  cytochrome oxidase assembly  39.51 
 
 		 354 aa  223  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300662  normal  0.0109948 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06105  cytochrome oxidase assembly protein  37.46 
 
 		 343 aa  191  1e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  35.6 
 
 		 341 aa  170  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  32.58 
 
 		 311 aa  166  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  31.85 
 
 		 326 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  32.43 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  28.29 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  32.47 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  30.34 
 
 		 325 aa  72.4  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  30.57 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  31.91 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  26.69 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  31.17 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  32.19 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  32.45 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  32.14 
 
 		 331 aa  69.3  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0230  cytochrome oxidase assembly protein  28.29 
 
 		 353 aa  68.9  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  33.33 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  27.49 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2430  cytochrome oxidase assembly  30.26 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4613  cytochrome oxidase assembly protein, putative  28.47 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1653  cytochrome oxidase assembly  24.78 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  24.54 
 
 		 363 aa  67  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  27.27 
 
 		 399 aa  66.2  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  26.12 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  33.1 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  29.52 
 
 		 391 aa  66.2  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  27.74 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0193  cytochrome oxidase assembly  29.31 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  26.04 
 
 		 348 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  26.35 
 
 		 326 aa  65.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  27.71 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  25 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  25.34 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  30.67 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  25.75 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4119  cytochrome oxidase assembly  27.01 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4187  cytochrome oxidase assembly  27.01 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4318  cytochrome oxidase assembly  27.01 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0148  cytochrome oxidase assembly  27.01 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  30.41 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  30.41 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  30.41 
 
 		 370 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  27.51 
 
 		 339 aa  62  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  30.41 
 
 		 370 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  30.41 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  30.41 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  30.77 
 
 		 339 aa  62  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  30.41 
 
 		 370 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  29.73 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  30.41 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  29.73 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  29.73 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  29.73 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5168  cytochrome oxidase assembly  27.75 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251951  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2601  putative cytochrome aa3 controlling protein  28.57 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.705731 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3490  cytochrome oxidase assembly  31.39 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1135  cytochrome oxidase assembly  27.06 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1977  cytochrome oxidase assembly  32.5 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.628163 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  31.47 
 
 		 622 aa  57.4  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4163  putative cytochrome oxidase assembly protein  30.34 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0069  cytochrome oxidase assembly  25.95 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13300  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  30.15 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0813876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  30.34 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4005  cytochrome oxidase assembly  31.39 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3523  cytochrome oxidase assembly  29.2 
 
 		 326 aa  57  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4065  cytochrome oxidase assembly  27.67 
 
 		 506 aa  56.6  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.328508  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0043  putative cytochrome oxidase assembly protein  29.58 
 
 		 394 aa  56.2  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.484274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3997  cytochrome oxidase assembly  27.74 
 
 		 352 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0318  cytochrome oxidase assembly  30.69 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22000  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  27.95 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.891794  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  28.97 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  30.34 
 
 		 370 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3798  cytochrome oxidase assembly  27.74 
 
 		 352 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3871  cytochrome oxidase assembly  27.74 
 
 		 352 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  30.34 
 
 		 370 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1387  cytochrome oxidase assembly  30.94 
 
 		 407 aa  55.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3827  cytochrome oxidase assembly  28.77 
 
 		 411 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.502475 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0149  cytochrome oxidase assembly  31.06 
 
 		 345 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04027  cytochrome oxidase assembly protein  29.27 
 
 		 387 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2347  cytochrome oxidase assembly  24.1 
 
 		 328 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0173507  normal  0.0130822 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  23.95 
 
 		 286 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0171  cytochrome oxidase assembly  28.47 
 
 		 327 aa  54.3  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4383  cytochrome oxidase assembly  26.28 
 
 		 406 aa  53.9  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  27.92 
 
 		 337 aa  53.5  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1841  cytochrome oxidase assembly  55 
 
 		 314 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355712 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2099  cytochrome oxidase assembly  29.34 
 
 		 301 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0129  cytochrome oxidase assembly  28.57 
 
 		 357 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.96534 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0124  cytochrome oxidase assembly  27.78 
 
 		 359 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190927  normal  0.0274429 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0126  cytochrome oxidase assembly  31.25 
 
 		 359 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16080  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  30.21 
 
 		 323 aa  52.8  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0629  putative cytochrome oxidase assembly protein  27.93 
 
 		 387 aa  52.4  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2711  cytochrome oxidase assembly  29.01 
 
 		 375 aa  52  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318505  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0186  hypothetical protein  26.35 
 
 		 137 aa  52.4  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.480963 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1688  cytochrome oxidase assembly  27.48 
 
 		 398 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0712  cytochrome oxidase assembly protein  26.13 
 
 		 387 aa  51.2  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>