88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4907 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4907  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 341 aa  692    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1204  cytochrome oxidase assembly  41.18 
 
 		 356 aa  256  3e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2927  cytochrome oxidase assembly  39.71 
 
 		 344 aa  236  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548442  hitchhiker  0.000233387 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1878  cytochrome oxidase assembly  42.25 
 
 		 359 aa  233  5e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  40.3 
 
 		 363 aa  232  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4601  putative cytochrome oxidase assembly protein  36.31 
 
 		 362 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3097  cytochrome oxidase assembly  37.06 
 
 		 370 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0841  cytochrome oxidase assembly  41.43 
 
 		 349 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2687  cytochrome oxidase assembly  38.89 
 
 		 362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0468581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  37.39 
 
 		 364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2502  cytochrome oxidase assembly  40.12 
 
 		 357 aa  220  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43606  predicted protein  37.08 
 
 		 367 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.953763 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1160  cytochrome oxidase assembly  38.6 
 
 		 361 aa  217  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1228  cytochrome oxidase assembly  37.5 
 
 		 367 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0808  cytochrome oxidase assembly  39.71 
 
 		 359 aa  216  5e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1316  cytochrome oxidase assembly  37.08 
 
 		 367 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0432  cytochrome c oxidase assembly protein  39.18 
 
 		 350 aa  216  7e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.668345  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  40.44 
 
 		 325 aa  215  9.999999999999999e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2665  cytochrome oxidase assembly  37.83 
 
 		 365 aa  212  7e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.352051  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1418  cytochrome oxidase assembly  35.76 
 
 		 360 aa  212  9e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2460  cytochrome oxidase assembly  35.71 
 
 		 389 aa  211  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0858  cytochrome oxidase assembly  35.87 
 
 		 367 aa  209  6e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  0.254409 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3028  cytochrome oxidase assembly  38.12 
 
 		 343 aa  208  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1519  cytochrome oxidase assembly  36.42 
 
 		 341 aa  208  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.459506 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2701  cytochrome oxidase assembly  37.54 
 
 		 362 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21354  predicted protein  35.59 
 
 		 422 aa  207  3e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.875011  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3288  cytochrome oxidase assembly  38.15 
 
 		 350 aa  205  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01915  cytochrome c oxidase assembly protein cox15 (AFU_orthologue; AFUA_6G07670)  34.99 
 
 		 441 aa  201  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0653735 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0709  cytochrome oxidase assembly  38.44 
 
 		 347 aa  200  3e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2709  cytochrome oxidase assembly  37.68 
 
 		 367 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0393197 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1335  cytochrome oxidase assembly  32.53 
 
 		 381 aa  199  6e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1607  cytochrome oxidase assembly  38.48 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905771 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3699  cytochrome oxidase assembly  35.16 
 
 		 391 aa  197  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2097  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0242  cytochrome oxidase assembly  35.74 
 
 		 355 aa  196  5.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177445  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_004310  BR0787  cytochrome c oxidase assembly protein, putative  38.6 
 
 		 358 aa  196  5.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1888  cytochrome oxidase assembly  38.19 
 
 		 382 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0782  putative cytochrome c oxidase assembly protein  38.6 
 
 		 382 aa  196  6e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1632  cytochrome oxidase assembly  37.57 
 
 		 381 aa  192  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5863  cytochrome oxidase assembly  38.1 
 
 		 360 aa  192  9e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2047  cytochrome oxidase assembly  34.11 
 
 		 362 aa  187  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0294  putative cytochrome oxidase assembly protein  36.08 
 
 		 344 aa  187  3e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0627  cytochrome oxidase assembly protein  34.43 
 
 		 358 aa  183  3e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00536761  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00720  cytochrome c oxidase biogenesis-related protein, putative  32.01 
 
 		 452 aa  181  1e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.564736  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3524  cytochrome oxidase assembly  33.81 
 
 		 391 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84097  Cytochrome c oxidase assembly protein COX15  33.33 
 
 		 480 aa  181  2e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3831  putative cytochrome oxidase assembly factor  33.52 
 
 		 391 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149666  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4596  cytochrome oxidase assembly  39.22 
 
 		 380 aa  179  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1512  putative cytochrome oxidase assembly protein  34.56 
 
 		 383 aa  179  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159721  normal  0.764722 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5367  cytochrome oxidase assembly  37.54 
 
 		 360 aa  178  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3812  carboxypeptidase Taq  33.24 
 
 		 391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0177967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2432  cytochrome oxidase assembly  34.66 
 
 		 379 aa  159  6e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.11345 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1225  cytochrome oxidase assembly  30.72 
 
 		 367 aa  149  7e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1224  cytochrome oxidase assembly  28.57 
 
 		 358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  23.74 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  23.44 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  23.15 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  25.66 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0318  cytochrome oxidase assembly  20.11 
 
 		 387 aa  53.1  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  22.51 
 
 		 363 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06105  cytochrome oxidase assembly protein  20.45 
 
 		 343 aa  50.8  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  21.52 
 
 		 363 aa  50.4  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  25.47 
 
 		 323 aa  50.4  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0629  putative cytochrome oxidase assembly protein  25 
 
 		 387 aa  49.3  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  24.39 
 
 		 327 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  21.33 
 
 		 341 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  24.55 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0712  cytochrome oxidase assembly protein  25 
 
 		 387 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809899  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  22.53 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  21.45 
 
 		 339 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  21.77 
 
 		 363 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  25.93 
 
 		 342 aa  46.6  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4005  cytochrome oxidase assembly  22.43 
 
 		 327 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  24.61 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  26.87 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4163  putative cytochrome oxidase assembly protein  26.77 
 
 		 369 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  26.19 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3040  cytochrome oxidase assembly  23.2 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00748587  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  27.21 
 
 		 369 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  27.21 
 
 		 369 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  26.21 
 
 		 369 aa  43.9  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1175  cytochrome oxidase assembly  22.16 
 
 		 356 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  27.21 
 
 		 369 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1197  cytochrome oxidase assembly  22.16 
 
 		 356 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  27.21 
 
 		 369 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  27.21 
 
 		 369 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  27.21 
 
 		 369 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  25.9 
 
 		 308 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  27.61 
 
 		 369 aa  42.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>