72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2665 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2665  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 365 aa  706    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.352051  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2701  cytochrome oxidase assembly  88.22 
 
 		 362 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3097  cytochrome oxidase assembly  82.35 
 
 		 370 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2687  cytochrome oxidase assembly  72.57 
 
 		 362 aa  474  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0468581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2460  cytochrome oxidase assembly  70.45 
 
 		 389 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1418  cytochrome oxidase assembly  72.11 
 
 		 360 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4601  putative cytochrome oxidase assembly protein  68.24 
 
 		 362 aa  442  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  58.96 
 
 		 363 aa  373  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  48.61 
 
 		 364 aa  304  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1228  cytochrome oxidase assembly  49.69 
 
 		 367 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0858  cytochrome oxidase assembly  49.41 
 
 		 367 aa  290  4e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  0.254409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1316  cytochrome oxidase assembly  49.11 
 
 		 367 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1878  cytochrome oxidase assembly  50.3 
 
 		 359 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1160  cytochrome oxidase assembly  50.15 
 
 		 361 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2927  cytochrome oxidase assembly  51.82 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548442  hitchhiker  0.000233387 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1204  cytochrome oxidase assembly  47.89 
 
 		 356 aa  273  5.000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2502  cytochrome oxidase assembly  45.43 
 
 		 357 aa  268  7e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2709  cytochrome oxidase assembly  49.01 
 
 		 367 aa  268  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0393197 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0808  cytochrome oxidase assembly  48.97 
 
 		 359 aa  265  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5863  cytochrome oxidase assembly  49.55 
 
 		 360 aa  263  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1335  cytochrome oxidase assembly  44.7 
 
 		 381 aa  259  7e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0627  cytochrome oxidase assembly protein  44.48 
 
 		 358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00536761  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1519  cytochrome oxidase assembly  44.51 
 
 		 341 aa  255  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.459506 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0782  putative cytochrome c oxidase assembly protein  48.31 
 
 		 382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0787  cytochrome c oxidase assembly protein, putative  48.31 
 
 		 358 aa  253  5.000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1888  cytochrome oxidase assembly  46.88 
 
 		 382 aa  249  5e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3028  cytochrome oxidase assembly  46.38 
 
 		 343 aa  248  9e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1632  cytochrome oxidase assembly  45.4 
 
 		 381 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1607  cytochrome oxidase assembly  46.31 
 
 		 382 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905771 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0242  cytochrome oxidase assembly  45.07 
 
 		 355 aa  237  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177445  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3524  cytochrome oxidase assembly  45.1 
 
 		 391 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3699  cytochrome oxidase assembly  43.6 
 
 		 391 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2097  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3831  putative cytochrome oxidase assembly factor  44.82 
 
 		 391 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149666  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4907  cytochrome oxidase assembly  37.83 
 
 		 341 aa  228  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4596  cytochrome oxidase assembly  50.73 
 
 		 380 aa  223  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5367  cytochrome oxidase assembly  51.21 
 
 		 360 aa  219  6e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1512  putative cytochrome oxidase assembly protein  43.29 
 
 		 383 aa  219  7e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159721  normal  0.764722 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3812  carboxypeptidase Taq  42.7 
 
 		 391 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0177967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21354  predicted protein  37.39 
 
 		 422 aa  213  3.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.875011  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0432  cytochrome c oxidase assembly protein  38.53 
 
 		 350 aa  213  3.9999999999999995e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.668345  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43606  predicted protein  37.85 
 
 		 367 aa  213  5.999999999999999e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.953763 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2047  cytochrome oxidase assembly  42.32 
 
 		 362 aa  209  5e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2432  cytochrome oxidase assembly  41.67 
 
 		 379 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.11345 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  36.25 
 
 		 325 aa  206  5e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1225  cytochrome oxidase assembly  38.1 
 
 		 367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00720  cytochrome c oxidase biogenesis-related protein, putative  35.89 
 
 		 452 aa  199  6e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.564736  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84097  Cytochrome c oxidase assembly protein COX15  37.43 
 
 		 480 aa  197  3e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3288  cytochrome oxidase assembly  42.31 
 
 		 350 aa  196  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01915  cytochrome c oxidase assembly protein cox15 (AFU_orthologue; AFUA_6G07670)  36.11 
 
 		 441 aa  195  8.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0653735 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0709  cytochrome oxidase assembly  34.51 
 
 		 347 aa  188  1e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0841  cytochrome oxidase assembly  41.57 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0294  putative cytochrome oxidase assembly protein  35.59 
 
 		 344 aa  170  3e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1224  cytochrome oxidase assembly  34.97 
 
 		 358 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  28.4 
 
 		 367 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  27.3 
 
 		 363 aa  55.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  26.91 
 
 		 367 aa  54.7  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  25.74 
 
 		 363 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  22.6 
 
 		 339 aa  50.1  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  24.86 
 
 		 335 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  22.94 
 
 		 328 aa  49.3  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  25.37 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  23.27 
 
 		 327 aa  48.5  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  24.86 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  29.51 
 
 		 342 aa  46.2  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  25.45 
 
 		 327 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  27.52 
 
 		 376 aa  44.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  29.17 
 
 		 323 aa  44.3  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  27.12 
 
 		 383 aa  44.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  26.9 
 
 		 373 aa  43.9  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  25.22 
 
 		 341 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  28.1 
 
 		 308 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  20.12 
 
 		 339 aa  42.7  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>