59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_84097 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_84097  Cytochrome c oxidase assembly protein COX15  100 
 
 
480 aa  982    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01915  cytochrome c oxidase assembly protein cox15 (AFU_orthologue; AFUA_6G07670)  51.25 
 
 
441 aa  384  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0653735 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00720  cytochrome c oxidase biogenesis-related protein, putative  47.26 
 
 
452 aa  335  7.999999999999999e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.564736  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21354  predicted protein  40.82 
 
 
422 aa  287  2e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.875011  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43606  predicted protein  43.39 
 
 
367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.953763 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4601  putative cytochrome oxidase assembly protein  40.92 
 
 
362 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314543  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1228  cytochrome oxidase assembly  40.31 
 
 
367 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26943  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1204  cytochrome oxidase assembly  38.86 
 
 
356 aa  248  1e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2460  cytochrome oxidase assembly  40.21 
 
 
389 aa  247  3e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1316  cytochrome oxidase assembly  41.07 
 
 
367 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1418  cytochrome oxidase assembly  40.27 
 
 
360 aa  241  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1519  cytochrome oxidase assembly  39.67 
 
 
341 aa  240  5e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.459506 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  37.19 
 
 
364 aa  239  5.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  39.84 
 
 
363 aa  238  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1160  cytochrome oxidase assembly  41.06 
 
 
361 aa  238  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0858  cytochrome oxidase assembly  41.39 
 
 
367 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  0.254409 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2927  cytochrome oxidase assembly  39.43 
 
 
344 aa  235  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548442  hitchhiker  0.000233387 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2687  cytochrome oxidase assembly  40.95 
 
 
362 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0468581  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3097  cytochrome oxidase assembly  38.5 
 
 
370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2502  cytochrome oxidase assembly  38.86 
 
 
357 aa  228  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3699  cytochrome oxidase assembly  39.57 
 
 
391 aa  225  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2097  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1335  cytochrome oxidase assembly  35.79 
 
 
381 aa  223  8e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2701  cytochrome oxidase assembly  39.33 
 
 
362 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0627  cytochrome oxidase assembly protein  38.04 
 
 
358 aa  221  3e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00536761  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2665  cytochrome oxidase assembly  36.53 
 
 
365 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.352051  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1878  cytochrome oxidase assembly  38.24 
 
 
359 aa  216  7e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0782  putative cytochrome c oxidase assembly protein  40.33 
 
 
382 aa  212  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0787  cytochrome c oxidase assembly protein, putative  40.33 
 
 
358 aa  212  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4907  cytochrome oxidase assembly  33.42 
 
 
341 aa  208  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3028  cytochrome oxidase assembly  36.9 
 
 
343 aa  208  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0808  cytochrome oxidase assembly  37.41 
 
 
359 aa  207  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2047  cytochrome oxidase assembly  35.92 
 
 
362 aa  205  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1512  putative cytochrome oxidase assembly protein  35.41 
 
 
383 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159721  normal  0.764722 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4596  cytochrome oxidase assembly  39.83 
 
 
380 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5863  cytochrome oxidase assembly  39.34 
 
 
360 aa  197  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2709  cytochrome oxidase assembly  39.83 
 
 
367 aa  196  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0393197 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3831  putative cytochrome oxidase assembly factor  36.78 
 
 
391 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149666  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3524  cytochrome oxidase assembly  36.51 
 
 
391 aa  196  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  34.25 
 
 
325 aa  195  1e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1888  cytochrome oxidase assembly  38.53 
 
 
382 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_002978  WD0432  cytochrome c oxidase assembly protein  35.22 
 
 
350 aa  190  4e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.668345  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1607  cytochrome oxidase assembly  38.24 
 
 
382 aa  187  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0905771 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1632  cytochrome oxidase assembly  38.53 
 
 
381 aa  187  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185838  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0242  cytochrome oxidase assembly  38.64 
 
 
355 aa  187  4e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177445  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3812  carboxypeptidase Taq  33.42 
 
 
391 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0177967  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0709  cytochrome oxidase assembly  34.45 
 
 
347 aa  179  8e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5367  cytochrome oxidase assembly  39.37 
 
 
360 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0294  putative cytochrome oxidase assembly protein  33.05 
 
 
344 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3288  cytochrome oxidase assembly  33.77 
 
 
350 aa  159  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2432  cytochrome oxidase assembly  36.19 
 
 
379 aa  158  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.11345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0841  cytochrome oxidase assembly  33.77 
 
 
349 aa  157  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1225  cytochrome oxidase assembly  31.95 
 
 
367 aa  155  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1224  cytochrome oxidase assembly  30.24 
 
 
358 aa  143  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  22.58 
 
 
363 aa  48.5  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0043  putative cytochrome oxidase assembly protein  25 
 
 
394 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.484274  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  23.91 
 
 
327 aa  44.3  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  20.23 
 
 
339 aa  44.3  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  23.84 
 
 
335 aa  43.5  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  23.25 
 
 
335 aa  43.5  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>