91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3288 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_3288  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 
350 aa  679    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0242  cytochrome oxidase assembly  51.78 
 
 
355 aa  297  2e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177445  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4907  cytochrome oxidase assembly  38.15 
 
 
341 aa  237  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  41.11 
 
 
364 aa  222  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3097  cytochrome oxidase assembly  40.11 
 
 
370 aa  222  8e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2460  cytochrome oxidase assembly  40.06 
 
 
389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4596  cytochrome oxidase assembly  47.25 
 
 
380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2927  cytochrome oxidase assembly  42.06 
 
 
344 aa  217  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548442  hitchhiker  0.000233387 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1519  cytochrome oxidase assembly  38.19 
 
 
341 aa  217  2.9999999999999998e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.459506 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1228  cytochrome oxidase assembly  40.79 
 
 
367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26943  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  40.06 
 
 
363 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1878  cytochrome oxidase assembly  40 
 
 
359 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2502  cytochrome oxidase assembly  40.06 
 
 
357 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1316  cytochrome oxidase assembly  40.48 
 
 
367 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2687  cytochrome oxidase assembly  41.28 
 
 
362 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0468581  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2701  cytochrome oxidase assembly  43.12 
 
 
362 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1418  cytochrome oxidase assembly  41.56 
 
 
360 aa  208  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0808  cytochrome oxidase assembly  42.99 
 
 
359 aa  207  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1204  cytochrome oxidase assembly  38.42 
 
 
356 aa  207  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3028  cytochrome oxidase assembly  44.41 
 
 
343 aa  205  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1335  cytochrome oxidase assembly  38.92 
 
 
381 aa  204  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1160  cytochrome oxidase assembly  38.91 
 
 
361 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4601  putative cytochrome oxidase assembly protein  39.2 
 
 
362 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314543  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3699  cytochrome oxidase assembly  44.64 
 
 
391 aa  203  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2097  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0858  cytochrome oxidase assembly  40.12 
 
 
367 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  0.254409 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2665  cytochrome oxidase assembly  41.42 
 
 
365 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.352051  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3524  cytochrome oxidase assembly  40.71 
 
 
391 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3831  putative cytochrome oxidase assembly factor  40.41 
 
 
391 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149666  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  34.58 
 
 
325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0782  putative cytochrome c oxidase assembly protein  41.28 
 
 
382 aa  189  9e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0787  cytochrome c oxidase assembly protein, putative  40.62 
 
 
358 aa  188  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3812  carboxypeptidase Taq  40.83 
 
 
391 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0177967  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0627  cytochrome oxidase assembly protein  34.91 
 
 
358 aa  187  2e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00536761  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2709  cytochrome oxidase assembly  41.76 
 
 
367 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0393197 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21354  predicted protein  34.25 
 
 
422 aa  182  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.875011  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0841  cytochrome oxidase assembly  42.6 
 
 
349 aa  179  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5863  cytochrome oxidase assembly  39.88 
 
 
360 aa  179  8e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1888  cytochrome oxidase assembly  38.75 
 
 
382 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_002978  WD0432  cytochrome c oxidase assembly protein  33.43 
 
 
350 aa  175  9.999999999999999e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.668345  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1607  cytochrome oxidase assembly  38.75 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0905771 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1512  putative cytochrome oxidase assembly protein  40.31 
 
 
383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159721  normal  0.764722 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1632  cytochrome oxidase assembly  38.92 
 
 
381 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185838  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5367  cytochrome oxidase assembly  42.3 
 
 
360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.234791 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01915  cytochrome c oxidase assembly protein cox15 (AFU_orthologue; AFUA_6G07670)  36 
 
 
441 aa  162  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0653735 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43606  predicted protein  34.53 
 
 
367 aa  160  3e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.953763 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2047  cytochrome oxidase assembly  33.14 
 
 
362 aa  159  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00720  cytochrome c oxidase biogenesis-related protein, putative  31.49 
 
 
452 aa  151  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.564736  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0294  putative cytochrome oxidase assembly protein  31.3 
 
 
344 aa  150  4e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0709  cytochrome oxidase assembly  32.06 
 
 
347 aa  149  5e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2432  cytochrome oxidase assembly  36.06 
 
 
379 aa  149  7e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.11345 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84097  Cytochrome c oxidase assembly protein COX15  33.95 
 
 
480 aa  148  1.0000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1225  cytochrome oxidase assembly  34.81 
 
 
367 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1224  cytochrome oxidase assembly  29.83 
 
 
358 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  27.22 
 
 
363 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  26.22 
 
 
335 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  25.81 
 
 
335 aa  57.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  26.79 
 
 
363 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  26.32 
 
 
363 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  25.83 
 
 
367 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  25.52 
 
 
328 aa  55.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  25.15 
 
 
326 aa  51.6  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  25.97 
 
 
367 aa  50.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  26.71 
 
 
376 aa  50.8  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  25.69 
 
 
313 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  25.69 
 
 
313 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  26.14 
 
 
373 aa  49.7  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  28.32 
 
 
369 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  28.32 
 
 
369 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  28.32 
 
 
369 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  28.32 
 
 
369 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  28.32 
 
 
369 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  28.32 
 
 
369 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  28.32 
 
 
369 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  26.43 
 
 
327 aa  47.4  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  28.41 
 
 
404 aa  47  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0230  cytochrome oxidase assembly protein  22.91 
 
 
353 aa  47  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  30.34 
 
 
370 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  30.34 
 
 
370 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  30.34 
 
 
369 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  30.34 
 
 
370 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  22.87 
 
 
325 aa  47  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  29.2 
 
 
369 aa  46.2  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  30.34 
 
 
370 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  29.66 
 
 
370 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  29.66 
 
 
370 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  29.66 
 
 
370 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  30.14 
 
 
369 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4163  putative cytochrome oxidase assembly protein  29.66 
 
 
369 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1045  cytochrome oxidase assembly  30.43 
 
 
356 aa  44.3  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  27.54 
 
 
307 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  22.82 
 
 
339 aa  43.5  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>