120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1160 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1160  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 361 aa  723    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  64.36 
 
 		 364 aa  468  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0858  cytochrome oxidase assembly  68.44 
 
 		 367 aa  455  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  0.254409 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1228  cytochrome oxidase assembly  64.35 
 
 		 367 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2502  cytochrome oxidase assembly  66.86 
 
 		 357 aa  439  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1316  cytochrome oxidase assembly  64.01 
 
 		 367 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0787  cytochrome c oxidase assembly protein, putative  67.45 
 
 		 358 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0782  putative cytochrome c oxidase assembly protein  67.45 
 
 		 382 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0627  cytochrome oxidase assembly protein  54.07 
 
 		 358 aa  372  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00536761  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  58.15 
 
 		 363 aa  344  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4601  putative cytochrome oxidase assembly protein  52.84 
 
 		 362 aa  322  5e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2460  cytochrome oxidase assembly  51.22 
 
 		 389 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3097  cytochrome oxidase assembly  53.42 
 
 		 370 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1418  cytochrome oxidase assembly  50.77 
 
 		 360 aa  295  8e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2687  cytochrome oxidase assembly  52.8 
 
 		 362 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0468581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2927  cytochrome oxidase assembly  48.95 
 
 		 344 aa  288  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548442  hitchhiker  0.000233387 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1878  cytochrome oxidase assembly  50.14 
 
 		 359 aa  285  7e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1519  cytochrome oxidase assembly  48.64 
 
 		 341 aa  284  2.0000000000000002e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.459506 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2701  cytochrome oxidase assembly  52.32 
 
 		 362 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2709  cytochrome oxidase assembly  51.02 
 
 		 367 aa  278  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0393197 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2665  cytochrome oxidase assembly  50.15 
 
 		 365 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.352051  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5863  cytochrome oxidase assembly  51.65 
 
 		 360 aa  268  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1204  cytochrome oxidase assembly  46.67 
 
 		 356 aa  267  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0808  cytochrome oxidase assembly  48.31 
 
 		 359 aa  262  6.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1888  cytochrome oxidase assembly  51.51 
 
 		 382 aa  259  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1632  cytochrome oxidase assembly  49.72 
 
 		 381 aa  260  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1607  cytochrome oxidase assembly  51.51 
 
 		 382 aa  256  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905771 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5367  cytochrome oxidase assembly  53.06 
 
 		 360 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3028  cytochrome oxidase assembly  47.15 
 
 		 343 aa  246  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1335  cytochrome oxidase assembly  40.94 
 
 		 381 aa  239  5e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0432  cytochrome c oxidase assembly protein  38.63 
 
 		 350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.668345  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  40.24 
 
 		 325 aa  233  5e-60  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4907  cytochrome oxidase assembly  38.6 
 
 		 341 aa  231  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3699  cytochrome oxidase assembly  43.73 
 
 		 391 aa  229  4e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2097  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2047  cytochrome oxidase assembly  40.82 
 
 		 362 aa  226  6e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4596  cytochrome oxidase assembly  51.41 
 
 		 380 aa  223  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1512  putative cytochrome oxidase assembly protein  44.25 
 
 		 383 aa  222  7e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159721  normal  0.764722 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3524  cytochrome oxidase assembly  41.94 
 
 		 391 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3831  putative cytochrome oxidase assembly factor  41.64 
 
 		 391 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149666  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84097  Cytochrome c oxidase assembly protein COX15  41.06 
 
 		 480 aa  215  9.999999999999999e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0242  cytochrome oxidase assembly  40.99 
 
 		 355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177445  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3812  carboxypeptidase Taq  41.23 
 
 		 391 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0177967  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00720  cytochrome c oxidase biogenesis-related protein, putative  37.3 
 
 		 452 aa  209  7e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.564736  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01915  cytochrome c oxidase assembly protein cox15 (AFU_orthologue; AFUA_6G07670)  38.16 
 
 		 441 aa  204  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0653735 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43606  predicted protein  38.57 
 
 		 367 aa  203  3e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.953763 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21354  predicted protein  35.71 
 
 		 422 aa  200  3.9999999999999996e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.875011  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3288  cytochrome oxidase assembly  38.91 
 
 		 350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1225  cytochrome oxidase assembly  37.61 
 
 		 367 aa  196  6e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0709  cytochrome oxidase assembly  34.49 
 
 		 347 aa  195  1e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0294  putative cytochrome oxidase assembly protein  37.85 
 
 		 344 aa  188  2e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0841  cytochrome oxidase assembly  39.31 
 
 		 349 aa  182  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2432  cytochrome oxidase assembly  41.25 
 
 		 379 aa  176  6e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.11345 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1224  cytochrome oxidase assembly  33.43 
 
 		 358 aa  155  7e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  28.14 
 
 		 328 aa  89.4  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  27.86 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  27.27 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  28.71 
 
 		 367 aa  77.4  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  27.24 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  24.92 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  27.44 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  27.22 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  26.74 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4005  cytochrome oxidase assembly  25.62 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  27.49 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  26.93 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  29.77 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  26.43 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  27.91 
 
 		 383 aa  60.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  26.3 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  25.39 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  26.95 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  24.93 
 
 		 369 aa  57  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  28.89 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  24.08 
 
 		 326 aa  55.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4163  putative cytochrome oxidase assembly protein  24.66 
 
 		 369 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  26.4 
 
 		 323 aa  53.1  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  24.7 
 
 		 326 aa  53.1  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  29.15 
 
 		 376 aa  52.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4187  cytochrome oxidase assembly  26.75 
 
 		 325 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0171  cytochrome oxidase assembly  25.85 
 
 		 327 aa  50.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1175  cytochrome oxidase assembly  23.91 
 
 		 356 aa  50.4  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1197  cytochrome oxidase assembly  23.91 
 
 		 356 aa  50.4  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3827  cytochrome oxidase assembly  25.96 
 
 		 411 aa  50.4  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.502475 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4119  cytochrome oxidase assembly  26.75 
 
 		 325 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0072  cytochrome oxidase assembly  26.28 
 
 		 359 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0148  cytochrome oxidase assembly  26.75 
 
 		 325 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0126  cytochrome oxidase assembly  28.88 
 
 		 359 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4318  cytochrome oxidase assembly  26.75 
 
 		 325 aa  49.7  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  24.8 
 
 		 369 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  24.8 
 
 		 369 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0230  cytochrome oxidase assembly protein  23.32 
 
 		 353 aa  49.3  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  24.8 
 
 		 369 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  26.69 
 
 		 370 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  26.21 
 
 		 313 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0069  cytochrome oxidase assembly  26.39 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  24.8 
 
 		 369 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  26.21 
 
 		 313 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  24.8 
 
 		 369 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  24.8 
 
 		 369 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0981  cytochrome oxidase assembly  27.35 
 
 		 319 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>