81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1632 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1632  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 381 aa  726    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1888  cytochrome oxidase assembly  90.29 
 
 		 382 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1607  cytochrome oxidase assembly  90.81 
 
 		 382 aa  580  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905771 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2709  cytochrome oxidase assembly  73.97 
 
 		 367 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0393197 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5863  cytochrome oxidase assembly  65.97 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5367  cytochrome oxidase assembly  66.29 
 
 		 360 aa  343  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  54.89 
 
 		 363 aa  332  5e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2502  cytochrome oxidase assembly  48.54 
 
 		 357 aa  296  5e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2460  cytochrome oxidase assembly  47.29 
 
 		 389 aa  290  4e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  49.28 
 
 		 364 aa  286  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0782  putative cytochrome c oxidase assembly protein  49.42 
 
 		 382 aa  277  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0787  cytochrome c oxidase assembly protein, putative  49.42 
 
 		 358 aa  277  3e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3097  cytochrome oxidase assembly  46.46 
 
 		 370 aa  275  7e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0627  cytochrome oxidase assembly protein  43.53 
 
 		 358 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00536761  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4601  putative cytochrome oxidase assembly protein  48.71 
 
 		 362 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2687  cytochrome oxidase assembly  49.33 
 
 		 362 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0468581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1160  cytochrome oxidase assembly  49.72 
 
 		 361 aa  273  3e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1418  cytochrome oxidase assembly  48.15 
 
 		 360 aa  272  6e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1878  cytochrome oxidase assembly  51.28 
 
 		 359 aa  271  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0858  cytochrome oxidase assembly  47.77 
 
 		 367 aa  261  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  0.254409 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1228  cytochrome oxidase assembly  43.89 
 
 		 367 aa  260  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0808  cytochrome oxidase assembly  48.85 
 
 		 359 aa  256  6e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2665  cytochrome oxidase assembly  45.4 
 
 		 365 aa  255  7e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.352051  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2701  cytochrome oxidase assembly  47.34 
 
 		 362 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1316  cytochrome oxidase assembly  45.48 
 
 		 367 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1519  cytochrome oxidase assembly  44.97 
 
 		 341 aa  247  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.459506 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2047  cytochrome oxidase assembly  42.58 
 
 		 362 aa  243  3.9999999999999997e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1335  cytochrome oxidase assembly  42.33 
 
 		 381 aa  241  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1204  cytochrome oxidase assembly  42.51 
 
 		 356 aa  228  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2927  cytochrome oxidase assembly  43.44 
 
 		 344 aa  221  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548442  hitchhiker  0.000233387 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  40.6 
 
 		 325 aa  216  4e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3699  cytochrome oxidase assembly  44.86 
 
 		 391 aa  213  5.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2097  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4907  cytochrome oxidase assembly  37.57 
 
 		 341 aa  207  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3831  putative cytochrome oxidase assembly factor  42.45 
 
 		 391 aa  206  6e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149666  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3524  cytochrome oxidase assembly  42.45 
 
 		 391 aa  205  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1512  putative cytochrome oxidase assembly protein  43.83 
 
 		 383 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159721  normal  0.764722 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3812  carboxypeptidase Taq  43.87 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0177967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0242  cytochrome oxidase assembly  41.55 
 
 		 355 aa  203  5e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177445  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_002978  WD0432  cytochrome c oxidase assembly protein  37.85 
 
 		 350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.668345  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3028  cytochrome oxidase assembly  42.77 
 
 		 343 aa  196  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4596  cytochrome oxidase assembly  44.55 
 
 		 380 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1225  cytochrome oxidase assembly  38.62 
 
 		 367 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01915  cytochrome c oxidase assembly protein cox15 (AFU_orthologue; AFUA_6G07670)  37.4 
 
 		 441 aa  188  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0653735 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00720  cytochrome c oxidase biogenesis-related protein, putative  35.66 
 
 		 452 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.564736  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21354  predicted protein  35.47 
 
 		 422 aa  181  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.875011  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0841  cytochrome oxidase assembly  39.33 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43606  predicted protein  36.31 
 
 		 367 aa  178  1e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.953763 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3288  cytochrome oxidase assembly  39.15 
 
 		 350 aa  176  6e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84097  Cytochrome c oxidase assembly protein COX15  38.31 
 
 		 480 aa  175  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0709  cytochrome oxidase assembly  34.45 
 
 		 347 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2432  cytochrome oxidase assembly  39.54 
 
 		 379 aa  172  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.11345 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0294  putative cytochrome oxidase assembly protein  35.57 
 
 		 344 aa  169  5e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1224  cytochrome oxidase assembly  35.99 
 
 		 358 aa  150  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  28.49 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  26.19 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  27.62 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  26.54 
 
 		 363 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  26.28 
 
 		 342 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  27.43 
 
 		 373 aa  52.8  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06105  cytochrome oxidase assembly protein  23.53 
 
 		 343 aa  51.6  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  28.1 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  28.1 
 
 		 369 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  26.26 
 
 		 363 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  28.1 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  28.1 
 
 		 369 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  28.1 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  28.1 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  28.4 
 
 		 369 aa  50.8  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  27.33 
 
 		 369 aa  49.7  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  28.4 
 
 		 369 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  29.17 
 
 		 337 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  28.07 
 
 		 367 aa  47  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  26.85 
 
 		 327 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  34.03 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  27.74 
 
 		 370 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  27.74 
 
 		 370 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1197  cytochrome oxidase assembly  26.03 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  27.74 
 
 		 370 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1175  cytochrome oxidase assembly  26.03 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  26.2 
 
 		 335 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  26.87 
 
 		 370 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>