84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1888 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1607  cytochrome oxidase assembly  98.17 
 
 		 382 aa  719    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1888  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 382 aa  736    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1632  cytochrome oxidase assembly  90.81 
 
 		 381 aa  590  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2709  cytochrome oxidase assembly  74.08 
 
 		 367 aa  444  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0393197 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5863  cytochrome oxidase assembly  66.47 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5367  cytochrome oxidase assembly  65.74 
 
 		 360 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  55.95 
 
 		 363 aa  332  9e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2460  cytochrome oxidase assembly  49.24 
 
 		 389 aa  298  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2502  cytochrome oxidase assembly  49.1 
 
 		 357 aa  293  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2687  cytochrome oxidase assembly  49.44 
 
 		 362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0468581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3097  cytochrome oxidase assembly  48.39 
 
 		 370 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  47.88 
 
 		 364 aa  283  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4601  putative cytochrome oxidase assembly protein  49.25 
 
 		 362 aa  280  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1878  cytochrome oxidase assembly  49.71 
 
 		 359 aa  278  8e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1160  cytochrome oxidase assembly  51.51 
 
 		 361 aa  279  8e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1418  cytochrome oxidase assembly  47.84 
 
 		 360 aa  278  1e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0782  putative cytochrome c oxidase assembly protein  46.99 
 
 		 382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0787  cytochrome c oxidase assembly protein, putative  49.11 
 
 		 358 aa  273  3e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1228  cytochrome oxidase assembly  44.57 
 
 		 367 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0627  cytochrome oxidase assembly protein  43.07 
 
 		 358 aa  270  4e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00536761  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0858  cytochrome oxidase assembly  46.05 
 
 		 367 aa  263  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  0.254409 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0808  cytochrome oxidase assembly  48.01 
 
 		 359 aa  261  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2665  cytochrome oxidase assembly  46.59 
 
 		 365 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.352051  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1316  cytochrome oxidase assembly  45.76 
 
 		 367 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2701  cytochrome oxidase assembly  47.32 
 
 		 362 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2047  cytochrome oxidase assembly  43.6 
 
 		 362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1335  cytochrome oxidase assembly  43.18 
 
 		 381 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1519  cytochrome oxidase assembly  45.24 
 
 		 341 aa  242  9e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.459506 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2927  cytochrome oxidase assembly  44.79 
 
 		 344 aa  230  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548442  hitchhiker  0.000233387 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1204  cytochrome oxidase assembly  43.9 
 
 		 356 aa  229  7e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  39.94 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3699  cytochrome oxidase assembly  45.71 
 
 		 391 aa  219  7e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2097  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4907  cytochrome oxidase assembly  38.19 
 
 		 341 aa  216  8e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1512  putative cytochrome oxidase assembly protein  44.94 
 
 		 383 aa  206  6e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159721  normal  0.764722 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3831  putative cytochrome oxidase assembly factor  43.14 
 
 		 391 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149666  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3524  cytochrome oxidase assembly  43.14 
 
 		 391 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3812  carboxypeptidase Taq  42.73 
 
 		 391 aa  199  9e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0177967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3028  cytochrome oxidase assembly  43.24 
 
 		 343 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_002978  WD0432  cytochrome c oxidase assembly protein  38.63 
 
 		 350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.668345  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0242  cytochrome oxidase assembly  41.71 
 
 		 355 aa  195  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177445  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0841  cytochrome oxidase assembly  39.93 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43606  predicted protein  37.09 
 
 		 367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.953763 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00720  cytochrome c oxidase biogenesis-related protein, putative  37.46 
 
 		 452 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.564736  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4596  cytochrome oxidase assembly  42.94 
 
 		 380 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01915  cytochrome c oxidase assembly protein cox15 (AFU_orthologue; AFUA_6G07670)  38.27 
 
 		 441 aa  181  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0653735 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21354  predicted protein  34.88 
 
 		 422 aa  181  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.875011  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1225  cytochrome oxidase assembly  37.65 
 
 		 367 aa  180  4e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3288  cytochrome oxidase assembly  38.75 
 
 		 350 aa  178  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84097  Cytochrome c oxidase assembly protein COX15  38.31 
 
 		 480 aa  177  4e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2432  cytochrome oxidase assembly  40.4 
 
 		 379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.11345 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0709  cytochrome oxidase assembly  33.74 
 
 		 347 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0294  putative cytochrome oxidase assembly protein  38.63 
 
 		 344 aa  160  4e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1224  cytochrome oxidase assembly  34.11 
 
 		 358 aa  152  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  28.31 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  26.71 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  28.81 
 
 		 373 aa  57  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  27.14 
 
 		 363 aa  56.2  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  28.57 
 
 		 369 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  28.57 
 
 		 369 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  28.57 
 
 		 369 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  28.57 
 
 		 369 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  28.57 
 
 		 369 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  28.57 
 
 		 369 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  28.57 
 
 		 369 aa  54.7  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  26.23 
 
 		 342 aa  53.5  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  26.86 
 
 		 363 aa  53.5  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  26.88 
 
 		 376 aa  52.8  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  28.57 
 
 		 369 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  27.96 
 
 		 370 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  22.29 
 
 		 328 aa  50.8  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  27.14 
 
 		 367 aa  50.4  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  27.96 
 
 		 370 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  27.96 
 
 		 370 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  26.57 
 
 		 327 aa  50.1  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  26.09 
 
 		 370 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  29.17 
 
 		 337 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06105  cytochrome oxidase assembly protein  23.13 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  26.9 
 
 		 369 aa  47  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  26.47 
 
 		 341 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  25.68 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  23.8 
 
 		 339 aa  44.3  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  34.27 
 
 		 326 aa  44.3  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  26.22 
 
 		 370 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  28.78 
 
 		 331 aa  42.7  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>