74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2927 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2927  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 344 aa  686    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548442  hitchhiker  0.000233387 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1204  cytochrome oxidase assembly  50.43 
 
 		 356 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0858  cytochrome oxidase assembly  51.93 
 
 		 367 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  0.254409 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  47.95 
 
 		 364 aa  313  3.9999999999999997e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1519  cytochrome oxidase assembly  50.15 
 
 		 341 aa  313  3.9999999999999997e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.459506 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1418  cytochrome oxidase assembly  50.44 
 
 		 360 aa  310  2e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2460  cytochrome oxidase assembly  51.06 
 
 		 389 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  49.57 
 
 		 363 aa  306  3e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3097  cytochrome oxidase assembly  51.38 
 
 		 370 aa  305  6e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4601  putative cytochrome oxidase assembly protein  48.14 
 
 		 362 aa  298  9e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2687  cytochrome oxidase assembly  50.15 
 
 		 362 aa  292  6e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0468581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1160  cytochrome oxidase assembly  48.95 
 
 		 361 aa  290  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1316  cytochrome oxidase assembly  46.57 
 
 		 367 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1228  cytochrome oxidase assembly  45.67 
 
 		 367 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2701  cytochrome oxidase assembly  50.46 
 
 		 362 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2665  cytochrome oxidase assembly  51.82 
 
 		 365 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.352051  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2502  cytochrome oxidase assembly  46.99 
 
 		 357 aa  273  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0808  cytochrome oxidase assembly  48.85 
 
 		 359 aa  271  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0627  cytochrome oxidase assembly protein  44.77 
 
 		 358 aa  270  4e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00536761  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1878  cytochrome oxidase assembly  50.3 
 
 		 359 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3028  cytochrome oxidase assembly  47.49 
 
 		 343 aa  266  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1335  cytochrome oxidase assembly  47.01 
 
 		 381 aa  263  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4907  cytochrome oxidase assembly  39.71 
 
 		 341 aa  263  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1512  putative cytochrome oxidase assembly protein  49.25 
 
 		 383 aa  262  8e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159721  normal  0.764722 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3699  cytochrome oxidase assembly  48.65 
 
 		 391 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2097  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5863  cytochrome oxidase assembly  51.2 
 
 		 360 aa  259  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01915  cytochrome c oxidase assembly protein cox15 (AFU_orthologue; AFUA_6G07670)  40.05 
 
 		 441 aa  251  1e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0653735 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0782  putative cytochrome c oxidase assembly protein  46.57 
 
 		 382 aa  249  4e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0787  cytochrome c oxidase assembly protein, putative  46.57 
 
 		 358 aa  249  5e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3524  cytochrome oxidase assembly  43.96 
 
 		 391 aa  242  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43606  predicted protein  42.36 
 
 		 367 aa  241  9e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.953763 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3831  putative cytochrome oxidase assembly factor  43.96 
 
 		 391 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149666  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2709  cytochrome oxidase assembly  46.88 
 
 		 367 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0393197 
 
 
-
 
NC_002978  WD0432  cytochrome c oxidase assembly protein  40.85 
 
 		 350 aa  235  6e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.668345  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  41.43 
 
 		 325 aa  231  2e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0242  cytochrome oxidase assembly  42.3 
 
 		 355 aa  228  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177445  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00720  cytochrome c oxidase biogenesis-related protein, putative  38.51 
 
 		 452 aa  228  2e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.564736  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21354  predicted protein  37.64 
 
 		 422 aa  226  3e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.875011  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3812  carboxypeptidase Taq  43.49 
 
 		 391 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0177967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84097  Cytochrome c oxidase assembly protein COX15  39.95 
 
 		 480 aa  225  9e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1632  cytochrome oxidase assembly  43.44 
 
 		 381 aa  225  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5367  cytochrome oxidase assembly  51.37 
 
 		 360 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2047  cytochrome oxidase assembly  38.24 
 
 		 362 aa  223  4e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2432  cytochrome oxidase assembly  48.58 
 
 		 379 aa  223  4.9999999999999996e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.11345 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1607  cytochrome oxidase assembly  44.79 
 
 		 382 aa  222  7e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905771 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3288  cytochrome oxidase assembly  42.44 
 
 		 350 aa  221  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1888  cytochrome oxidase assembly  44.79 
 
 		 382 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4596  cytochrome oxidase assembly  47.99 
 
 		 380 aa  215  8e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0841  cytochrome oxidase assembly  44.61 
 
 		 349 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1225  cytochrome oxidase assembly  42.22 
 
 		 367 aa  204  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0709  cytochrome oxidase assembly  36.98 
 
 		 347 aa  202  5e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0294  putative cytochrome oxidase assembly protein  37.27 
 
 		 344 aa  194  1e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1224  cytochrome oxidase assembly  38.26 
 
 		 358 aa  170  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  28.19 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  22.59 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  27.6 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  25.16 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  24.76 
 
 		 328 aa  57  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  22.77 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  26.06 
 
 		 363 aa  52.8  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  25.17 
 
 		 363 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4005  cytochrome oxidase assembly  24.61 
 
 		 327 aa  51.2  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  25.08 
 
 		 363 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  23.84 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  26.01 
 
 		 327 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  23.66 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2076  cytochrome oxidase assembly  26.39 
 
 		 326 aa  47  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.809724 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  27.22 
 
 		 311 aa  46.6  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  24.55 
 
 		 325 aa  46.6  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  25.15 
 
 		 339 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1045  cytochrome oxidase assembly  29.73 
 
 		 356 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06105  cytochrome oxidase assembly protein  21.89 
 
 		 343 aa  44.3  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  23.65 
 
 		 341 aa  43.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0171  cytochrome oxidase assembly  24.48 
 
 		 327 aa  42.7  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>