78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1335 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1335  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 381 aa  760    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1512  putative cytochrome oxidase assembly protein  63.42 
 
 		 383 aa  425  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159721  normal  0.764722 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3699  cytochrome oxidase assembly  60.79 
 
 		 391 aa  421  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2097  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3524  cytochrome oxidase assembly  57.99 
 
 		 391 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3831  putative cytochrome oxidase assembly factor  57.47 
 
 		 391 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149666  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3812  carboxypeptidase Taq  57.22 
 
 		 391 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0177967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2432  cytochrome oxidase assembly  57.67 
 
 		 379 aa  375  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.11345 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  44.57 
 
 		 363 aa  268  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3097  cytochrome oxidase assembly  43.66 
 
 		 370 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  41.29 
 
 		 364 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1519  cytochrome oxidase assembly  43.4 
 
 		 341 aa  258  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.459506 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1228  cytochrome oxidase assembly  42.5 
 
 		 367 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0858  cytochrome oxidase assembly  43.41 
 
 		 367 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  0.254409 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2460  cytochrome oxidase assembly  44.11 
 
 		 389 aa  247  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2927  cytochrome oxidase assembly  46.57 
 
 		 344 aa  246  6e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548442  hitchhiker  0.000233387 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0627  cytochrome oxidase assembly protein  42.82 
 
 		 358 aa  246  6.999999999999999e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00536761  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1316  cytochrome oxidase assembly  40.82 
 
 		 367 aa  245  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4601  putative cytochrome oxidase assembly protein  44.38 
 
 		 362 aa  242  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1418  cytochrome oxidase assembly  44.28 
 
 		 360 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1204  cytochrome oxidase assembly  42.12 
 
 		 356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2665  cytochrome oxidase assembly  44.13 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.352051  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2701  cytochrome oxidase assembly  43.79 
 
 		 362 aa  235  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2687  cytochrome oxidase assembly  42.9 
 
 		 362 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0468581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2502  cytochrome oxidase assembly  41.67 
 
 		 357 aa  231  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1878  cytochrome oxidase assembly  43.15 
 
 		 359 aa  228  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1160  cytochrome oxidase assembly  40.94 
 
 		 361 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2709  cytochrome oxidase assembly  47.21 
 
 		 367 aa  224  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0393197 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5863  cytochrome oxidase assembly  44.64 
 
 		 360 aa  220  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0782  putative cytochrome c oxidase assembly protein  40.5 
 
 		 382 aa  219  5e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0787  cytochrome c oxidase assembly protein, putative  40.91 
 
 		 358 aa  218  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3028  cytochrome oxidase assembly  43.36 
 
 		 343 aa  218  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0808  cytochrome oxidase assembly  42.31 
 
 		 359 aa  215  9e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1632  cytochrome oxidase assembly  43.5 
 
 		 381 aa  213  7e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1607  cytochrome oxidase assembly  43.1 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1888  cytochrome oxidase assembly  43.1 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  37.43 
 
 		 325 aa  205  1e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01915  cytochrome c oxidase assembly protein cox15 (AFU_orthologue; AFUA_6G07670)  35 
 
 		 441 aa  204  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0653735 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0242  cytochrome oxidase assembly  41.28 
 
 		 355 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177445  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4907  cytochrome oxidase assembly  32.53 
 
 		 341 aa  199  7e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4596  cytochrome oxidase assembly  45.56 
 
 		 380 aa  196  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43606  predicted protein  36.49 
 
 		 367 aa  193  4e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.953763 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21354  predicted protein  36.92 
 
 		 422 aa  193  5e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.875011  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00720  cytochrome c oxidase biogenesis-related protein, putative  33.33 
 
 		 452 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.564736  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0841  cytochrome oxidase assembly  34.29 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3288  cytochrome oxidase assembly  38.92 
 
 		 350 aa  187  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2047  cytochrome oxidase assembly  36.03 
 
 		 362 aa  187  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84097  Cytochrome c oxidase assembly protein COX15  36.29 
 
 		 480 aa  186  9e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5367  cytochrome oxidase assembly  43.97 
 
 		 360 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_002978  WD0432  cytochrome c oxidase assembly protein  32.92 
 
 		 350 aa  178  1e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.668345  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1225  cytochrome oxidase assembly  34.26 
 
 		 367 aa  169  8e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0709  cytochrome oxidase assembly  32.82 
 
 		 347 aa  160  3e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0294  putative cytochrome oxidase assembly protein  32.14 
 
 		 344 aa  152  7e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1224  cytochrome oxidase assembly  31.18 
 
 		 358 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  25.66 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  26.11 
 
 		 327 aa  53.5  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  28.19 
 
 		 286 aa  53.1  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  26.44 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  24.51 
 
 		 363 aa  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  25.81 
 
 		 342 aa  50.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  27.75 
 
 		 373 aa  50.1  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  24.37 
 
 		 363 aa  49.7  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  24.58 
 
 		 363 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  23.18 
 
 		 369 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  23.42 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  23.42 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  26.1 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  23.42 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  23.42 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  23.42 
 
 		 369 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  23.42 
 
 		 369 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  23.03 
 
 		 311 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  26.51 
 
 		 367 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  23.42 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1175  cytochrome oxidase assembly  25.23 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1197  cytochrome oxidase assembly  25.23 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  23.01 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2648  cytochrome oxidase assembly  25.26 
 
 		 313 aa  43.9  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1045  cytochrome oxidase assembly  25.31 
 
 		 356 aa  43.1  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>