104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1204 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1204  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 
356 aa  721    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2927  cytochrome oxidase assembly  50.43 
 
 
344 aa  299  4e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548442  hitchhiker  0.000233387 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43606  predicted protein  46.02 
 
 
367 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.953763 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3097  cytochrome oxidase assembly  47.59 
 
 
370 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2460  cytochrome oxidase assembly  48.38 
 
 
389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  45.98 
 
 
363 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4601  putative cytochrome oxidase assembly protein  46.69 
 
 
362 aa  281  9e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314543  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1418  cytochrome oxidase assembly  48.22 
 
 
360 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4907  cytochrome oxidase assembly  41.18 
 
 
341 aa  271  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0432  cytochrome c oxidase assembly protein  43.6 
 
 
350 aa  268  7e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.668345  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2687  cytochrome oxidase assembly  46.97 
 
 
362 aa  268  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0468581  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2665  cytochrome oxidase assembly  47.59 
 
 
365 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.352051  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1160  cytochrome oxidase assembly  46.67 
 
 
361 aa  265  8e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1519  cytochrome oxidase assembly  42.3 
 
 
341 aa  265  8e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.459506 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  44.21 
 
 
364 aa  265  8.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2701  cytochrome oxidase assembly  46.63 
 
 
362 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.214669 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01915  cytochrome c oxidase assembly protein cox15 (AFU_orthologue; AFUA_6G07670)  41.67 
 
 
441 aa  260  3e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0653735 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1228  cytochrome oxidase assembly  41.03 
 
 
367 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26943  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0858  cytochrome oxidase assembly  43.22 
 
 
367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  0.254409 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21354  predicted protein  39.6 
 
 
422 aa  252  6e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.875011  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2502  cytochrome oxidase assembly  41.14 
 
 
357 aa  252  7e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00720  cytochrome c oxidase biogenesis-related protein, putative  39.36 
 
 
452 aa  250  3e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.564736  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1335  cytochrome oxidase assembly  42.12 
 
 
381 aa  250  3e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1316  cytochrome oxidase assembly  41.34 
 
 
367 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1878  cytochrome oxidase assembly  44.48 
 
 
359 aa  246  4e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2047  cytochrome oxidase assembly  40.83 
 
 
362 aa  243  5e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3028  cytochrome oxidase assembly  42.77 
 
 
343 aa  240  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5863  cytochrome oxidase assembly  48.92 
 
 
360 aa  239  5e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3699  cytochrome oxidase assembly  42.39 
 
 
391 aa  234  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2097  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0627  cytochrome oxidase assembly protein  42.69 
 
 
358 aa  229  4e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00536761  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2709  cytochrome oxidase assembly  45.7 
 
 
367 aa  229  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0393197 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84097  Cytochrome c oxidase assembly protein COX15  39.01 
 
 
480 aa  229  8e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3831  putative cytochrome oxidase assembly factor  41.31 
 
 
391 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149666  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0787  cytochrome c oxidase assembly protein, putative  41.64 
 
 
358 aa  227  3e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0782  putative cytochrome c oxidase assembly protein  41.64 
 
 
382 aa  227  3e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3524  cytochrome oxidase assembly  41.03 
 
 
391 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1512  putative cytochrome oxidase assembly protein  41.64 
 
 
383 aa  225  7e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159721  normal  0.764722 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0808  cytochrome oxidase assembly  43.5 
 
 
359 aa  225  9e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  40.75 
 
 
325 aa  224  1e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0709  cytochrome oxidase assembly  39.65 
 
 
347 aa  223  3e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0294  putative cytochrome oxidase assembly protein  41.87 
 
 
344 aa  217  2e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5367  cytochrome oxidase assembly  45.35 
 
 
360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1632  cytochrome oxidase assembly  42.51 
 
 
381 aa  212  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185838  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0841  cytochrome oxidase assembly  37.46 
 
 
349 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3812  carboxypeptidase Taq  40.46 
 
 
391 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0177967  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1607  cytochrome oxidase assembly  44.27 
 
 
382 aa  206  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0905771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1888  cytochrome oxidase assembly  41.4 
 
 
382 aa  206  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2432  cytochrome oxidase assembly  41.12 
 
 
379 aa  205  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.11345 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0242  cytochrome oxidase assembly  38.51 
 
 
355 aa  204  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177445  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4596  cytochrome oxidase assembly  43.05 
 
 
380 aa  202  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1225  cytochrome oxidase assembly  37.07 
 
 
367 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1224  cytochrome oxidase assembly  36.23 
 
 
358 aa  189  7e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3288  cytochrome oxidase assembly  37.65 
 
 
350 aa  187  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  27.27 
 
 
363 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  24.64 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  26.47 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  25.91 
 
 
339 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  27.14 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  24.46 
 
 
363 aa  62.8  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  24.46 
 
 
363 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  27.86 
 
 
335 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  24.43 
 
 
326 aa  60.8  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  24.77 
 
 
326 aa  60.5  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  27.41 
 
 
335 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0072  cytochrome oxidase assembly  28.53 
 
 
359 aa  57  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  24.01 
 
 
339 aa  56.6  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4005  cytochrome oxidase assembly  24.04 
 
 
327 aa  54.7  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  26.65 
 
 
367 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  25.66 
 
 
325 aa  53.5  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  29.44 
 
 
323 aa  53.5  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  23.05 
 
 
369 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  23.75 
 
 
369 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  23.75 
 
 
369 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  23.75 
 
 
369 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  23.75 
 
 
369 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  23.75 
 
 
369 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  23.75 
 
 
369 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  30.6 
 
 
286 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  23.75 
 
 
369 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  25.87 
 
 
404 aa  49.3  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0171  cytochrome oxidase assembly  25.36 
 
 
327 aa  48.9  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0334  putative cytochrome aa3 oxidase assembly protein,related to CtaA  36.18 
 
 
327 aa  48.9  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  24.05 
 
 
369 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  23.58 
 
 
369 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  26.84 
 
 
399 aa  48.5  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0069  cytochrome oxidase assembly  25.2 
 
 
368 aa  47.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  24.29 
 
 
311 aa  47  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4613  cytochrome oxidase assembly protein, putative  23.72 
 
 
330 aa  47  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  23.58 
 
 
370 aa  46.2  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  23.88 
 
 
370 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  23.88 
 
 
370 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  23.88 
 
 
370 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4163  putative cytochrome oxidase assembly protein  23.28 
 
 
369 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  25.14 
 
 
327 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  26.32 
 
 
396 aa  45.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  24.05 
 
 
370 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  30.34 
 
 
342 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  25.16 
 
 
367 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  26.35 
 
 
376 aa  44.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  26.99 
 
 
373 aa  44.3  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>