102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4338 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 363 aa  711    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2460  cytochrome oxidase assembly  60.96 
 
 		 389 aa  379  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3097  cytochrome oxidase assembly  57.74 
 
 		 370 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1418  cytochrome oxidase assembly  59.16 
 
 		 360 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2687  cytochrome oxidase assembly  59.88 
 
 		 362 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0468581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4601  putative cytochrome oxidase assembly protein  56.73 
 
 		 362 aa  352  7e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2665  cytochrome oxidase assembly  58.96 
 
 		 365 aa  338  9e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.352051  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2701  cytochrome oxidase assembly  58.46 
 
 		 362 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1160  cytochrome oxidase assembly  58.15 
 
 		 361 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2502  cytochrome oxidase assembly  53.78 
 
 		 357 aa  323  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  52 
 
 		 364 aa  323  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1228  cytochrome oxidase assembly  49.15 
 
 		 367 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1316  cytochrome oxidase assembly  49.29 
 
 		 367 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5863  cytochrome oxidase assembly  57.49 
 
 		 360 aa  300  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2709  cytochrome oxidase assembly  55.97 
 
 		 367 aa  299  4e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0393197 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0858  cytochrome oxidase assembly  50.29 
 
 		 367 aa  295  7e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  0.254409 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0782  putative cytochrome c oxidase assembly protein  53.73 
 
 		 382 aa  294  1e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1632  cytochrome oxidase assembly  54.89 
 
 		 381 aa  294  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185838  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0787  cytochrome c oxidase assembly protein, putative  53.73 
 
 		 358 aa  294  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0627  cytochrome oxidase assembly protein  46.4 
 
 		 358 aa  290  2e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00536761  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1888  cytochrome oxidase assembly  54.76 
 
 		 382 aa  288  7e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0808  cytochrome oxidase assembly  52.82 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1878  cytochrome oxidase assembly  52.54 
 
 		 359 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1607  cytochrome oxidase assembly  55.06 
 
 		 382 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905771 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2927  cytochrome oxidase assembly  49.57 
 
 		 344 aa  278  7e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548442  hitchhiker  0.000233387 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1519  cytochrome oxidase assembly  48.12 
 
 		 341 aa  278  8e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.459506 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1204  cytochrome oxidase assembly  45.98 
 
 		 356 aa  271  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1335  cytochrome oxidase assembly  44.57 
 
 		 381 aa  268  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3028  cytochrome oxidase assembly  47.77 
 
 		 343 aa  253  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3699  cytochrome oxidase assembly  49.07 
 
 		 391 aa  248  8e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2097  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5367  cytochrome oxidase assembly  57.49 
 
 		 360 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1512  putative cytochrome oxidase assembly protein  44.64 
 
 		 383 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159721  normal  0.764722 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3524  cytochrome oxidase assembly  46.57 
 
 		 391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3831  putative cytochrome oxidase assembly factor  46.29 
 
 		 391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149666  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2047  cytochrome oxidase assembly  42.33 
 
 		 362 aa  233  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4907  cytochrome oxidase assembly  40.3 
 
 		 341 aa  232  6e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0432  cytochrome c oxidase assembly protein  41.05 
 
 		 350 aa  231  2e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.668345  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00720  cytochrome c oxidase biogenesis-related protein, putative  39.14 
 
 		 452 aa  231  2e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.564736  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0242  cytochrome oxidase assembly  45.12 
 
 		 355 aa  229  5e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177445  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3812  carboxypeptidase Taq  43.13 
 
 		 391 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0177967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  40.42 
 
 		 325 aa  222  7e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43606  predicted protein  40.87 
 
 		 367 aa  221  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.953763 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21354  predicted protein  37.61 
 
 		 422 aa  218  1e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.875011  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01915  cytochrome c oxidase assembly protein cox15 (AFU_orthologue; AFUA_6G07670)  39.12 
 
 		 441 aa  210  3e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0653735 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1225  cytochrome oxidase assembly  39.56 
 
 		 367 aa  209  6e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84097  Cytochrome c oxidase assembly protein COX15  39.84 
 
 		 480 aa  205  1e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0294  putative cytochrome oxidase assembly protein  39.66 
 
 		 344 aa  204  2e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0709  cytochrome oxidase assembly  37.28 
 
 		 347 aa  204  3e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4596  cytochrome oxidase assembly  48.65 
 
 		 380 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2432  cytochrome oxidase assembly  41.19 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.11345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0841  cytochrome oxidase assembly  41.89 
 
 		 349 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3288  cytochrome oxidase assembly  40.06 
 
 		 350 aa  192  5e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1224  cytochrome oxidase assembly  37.3 
 
 		 358 aa  170  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  28.04 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  24.77 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  28.05 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  28.57 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  27.38 
 
 		 363 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  28.27 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  28.27 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  28.27 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  28.27 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  27.98 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  27.98 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  29.55 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  21.69 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  27.08 
 
 		 363 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  24.68 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  28.78 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  27.98 
 
 		 369 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  30.46 
 
 		 286 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  28.35 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  29.85 
 
 		 348 aa  54.3  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  29.38 
 
 		 370 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  24.16 
 
 		 308 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  29.08 
 
 		 370 aa  53.1  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  29.08 
 
 		 370 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  23.29 
 
 		 326 aa  52.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  29.08 
 
 		 370 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  26.52 
 
 		 367 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  25.15 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  26.63 
 
 		 383 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  22.12 
 
 		 339 aa  50.8  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  28.49 
 
 		 370 aa  50.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  25.08 
 
 		 285 aa  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  27.75 
 
 		 308 aa  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  22.7 
 
 		 308 aa  49.3  0.00009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1175  cytochrome oxidase assembly  24.19 
 
 		 356 aa  49.3  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1197  cytochrome oxidase assembly  24.19 
 
 		 356 aa  49.3  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2430  cytochrome oxidase assembly  25.16 
 
 		 325 aa  49.3  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  27.11 
 
 		 370 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  26.82 
 
 		 370 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  26.35 
 
 		 341 aa  47  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  28.17 
 
 		 313 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  28.17 
 
 		 313 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  25.78 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0705  cytochrome oxidase assembly protein  24.29 
 
 		 302 aa  45.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  25.57 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4005  cytochrome oxidase assembly  23.34 
 
 		 327 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3040  cytochrome oxidase assembly  28.5 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00748587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>