75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3812 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3812  carboxypeptidase Taq  100 
 
 		 391 aa  764    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0177967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3524  cytochrome oxidase assembly  90.28 
 
 		 391 aa  684    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3831  putative cytochrome oxidase assembly factor  89.51 
 
 		 391 aa  679    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149666  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1335  cytochrome oxidase assembly  57.33 
 
 		 381 aa  424  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3699  cytochrome oxidase assembly  53.89 
 
 		 391 aa  374  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2097  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1512  putative cytochrome oxidase assembly protein  57.77 
 
 		 383 aa  369  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159721  normal  0.764722 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2432  cytochrome oxidase assembly  53.26 
 
 		 379 aa  333  4e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.11345 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  44.6 
 
 		 363 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1519  cytochrome oxidase assembly  42.52 
 
 		 341 aa  253  4.0000000000000004e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.459506 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3097  cytochrome oxidase assembly  45.06 
 
 		 370 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4601  putative cytochrome oxidase assembly protein  44.51 
 
 		 362 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  39.49 
 
 		 364 aa  243  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2927  cytochrome oxidase assembly  43.53 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548442  hitchhiker  0.000233387 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2460  cytochrome oxidase assembly  41.69 
 
 		 389 aa  238  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1418  cytochrome oxidase assembly  43.84 
 
 		 360 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1204  cytochrome oxidase assembly  40.46 
 
 		 356 aa  232  9e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1228  cytochrome oxidase assembly  39.83 
 
 		 367 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1160  cytochrome oxidase assembly  41.4 
 
 		 361 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2502  cytochrome oxidase assembly  39.23 
 
 		 357 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1316  cytochrome oxidase assembly  39.24 
 
 		 367 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2665  cytochrome oxidase assembly  43.7 
 
 		 365 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.352051  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2687  cytochrome oxidase assembly  42.2 
 
 		 362 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0468581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2701  cytochrome oxidase assembly  42.17 
 
 		 362 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0858  cytochrome oxidase assembly  40.36 
 
 		 367 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  0.254409 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3028  cytochrome oxidase assembly  41.37 
 
 		 343 aa  214  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1878  cytochrome oxidase assembly  41.39 
 
 		 359 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0242  cytochrome oxidase assembly  43.77 
 
 		 355 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177445  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  37.58 
 
 		 325 aa  212  9e-54  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5863  cytochrome oxidase assembly  43.7 
 
 		 360 aa  212  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0808  cytochrome oxidase assembly  41.55 
 
 		 359 aa  211  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2709  cytochrome oxidase assembly  41.93 
 
 		 367 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0393197 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0627  cytochrome oxidase assembly protein  36.84 
 
 		 358 aa  211  2e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00536761  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0782  putative cytochrome c oxidase assembly protein  39.43 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0787  cytochrome c oxidase assembly protein, putative  39.43 
 
 		 358 aa  207  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01915  cytochrome c oxidase assembly protein cox15 (AFU_orthologue; AFUA_6G07670)  36.49 
 
 		 441 aa  206  4e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0653735 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1632  cytochrome oxidase assembly  43.64 
 
 		 381 aa  206  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21354  predicted protein  34.96 
 
 		 422 aa  203  5e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.875011  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4907  cytochrome oxidase assembly  33.24 
 
 		 341 aa  196  7e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1607  cytochrome oxidase assembly  42.15 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1888  cytochrome oxidase assembly  42.44 
 
 		 382 aa  194  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2047  cytochrome oxidase assembly  37.07 
 
 		 362 aa  192  6e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4596  cytochrome oxidase assembly  40.45 
 
 		 380 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3288  cytochrome oxidase assembly  40.83 
 
 		 350 aa  189  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0841  cytochrome oxidase assembly  35.86 
 
 		 349 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00720  cytochrome c oxidase biogenesis-related protein, putative  35.33 
 
 		 452 aa  186  6e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.564736  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43606  predicted protein  35.08 
 
 		 367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.953763 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5367  cytochrome oxidase assembly  42.31 
 
 		 360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_002978  WD0432  cytochrome c oxidase assembly protein  33.92 
 
 		 350 aa  177  3e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.668345  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84097  Cytochrome c oxidase assembly protein COX15  35.26 
 
 		 480 aa  171  3e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0709  cytochrome oxidase assembly  34.57 
 
 		 347 aa  161  2e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0294  putative cytochrome oxidase assembly protein  30.97 
 
 		 344 aa  158  2e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1225  cytochrome oxidase assembly  33.03 
 
 		 367 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1224  cytochrome oxidase assembly  30.77 
 
 		 358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  27.68 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  25.86 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  28.51 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  24.86 
 
 		 339 aa  54.7  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  22.6 
 
 		 328 aa  52.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  27.47 
 
 		 376 aa  51.6  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  26.48 
 
 		 404 aa  49.3  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  27.62 
 
 		 396 aa  48.9  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  22.59 
 
 		 335 aa  47.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  27.78 
 
 		 399 aa  47.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  23.31 
 
 		 363 aa  46.6  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  31.85 
 
 		 369 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  23.75 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  23.93 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  25.82 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  28.48 
 
 		 311 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  26.67 
 
 		 367 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  21.15 
 
 		 325 aa  44.3  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  25.44 
 
 		 363 aa  44.3  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  29.14 
 
 		 285 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  23.11 
 
 		 363 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  23.8 
 
 		 369 aa  43.1  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>