92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3699 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3699  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 391 aa  773    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2097  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1335  cytochrome oxidase assembly  60.79 
 
 		 381 aa  457  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1512  putative cytochrome oxidase assembly protein  60.16 
 
 		 383 aa  402  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159721  normal  0.764722 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3524  cytochrome oxidase assembly  56.48 
 
 		 391 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3831  putative cytochrome oxidase assembly factor  56.22 
 
 		 391 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149666  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3812  carboxypeptidase Taq  54.4 
 
 		 391 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0177967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2432  cytochrome oxidase assembly  56 
 
 		 379 aa  361  2e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.11345 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1519  cytochrome oxidase assembly  49.41 
 
 		 341 aa  279  5e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.459506 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3097  cytochrome oxidase assembly  46.18 
 
 		 370 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  49.07 
 
 		 363 aa  269  7e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2927  cytochrome oxidase assembly  48.35 
 
 		 344 aa  261  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548442  hitchhiker  0.000233387 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  43.55 
 
 		 364 aa  260  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2460  cytochrome oxidase assembly  45.32 
 
 		 389 aa  259  4e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0627  cytochrome oxidase assembly protein  42.51 
 
 		 358 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00536761  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2502  cytochrome oxidase assembly  44.44 
 
 		 357 aa  243  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4601  putative cytochrome oxidase assembly protein  45.48 
 
 		 362 aa  242  7.999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1418  cytochrome oxidase assembly  43.2 
 
 		 360 aa  241  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2687  cytochrome oxidase assembly  44.41 
 
 		 362 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0468581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1204  cytochrome oxidase assembly  42.39 
 
 		 356 aa  238  9e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1160  cytochrome oxidase assembly  43.25 
 
 		 361 aa  237  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1228  cytochrome oxidase assembly  40.97 
 
 		 367 aa  236  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1316  cytochrome oxidase assembly  42.81 
 
 		 367 aa  233  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2665  cytochrome oxidase assembly  43.6 
 
 		 365 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.352051  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21354  predicted protein  39.12 
 
 		 422 aa  229  7e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.875011  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2701  cytochrome oxidase assembly  42.15 
 
 		 362 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1878  cytochrome oxidase assembly  45.55 
 
 		 359 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2709  cytochrome oxidase assembly  46.72 
 
 		 367 aa  226  7e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0393197 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43606  predicted protein  42.48 
 
 		 367 aa  225  1e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.953763 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0858  cytochrome oxidase assembly  41.36 
 
 		 367 aa  225  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  0.254409 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01915  cytochrome c oxidase assembly protein cox15 (AFU_orthologue; AFUA_6G07670)  40.44 
 
 		 441 aa  223  3e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0653735 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3028  cytochrome oxidase assembly  46.79 
 
 		 343 aa  221  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0808  cytochrome oxidase assembly  44.38 
 
 		 359 aa  220  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0782  putative cytochrome c oxidase assembly protein  43.12 
 
 		 382 aa  220  3.9999999999999997e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0787  cytochrome c oxidase assembly protein, putative  43.25 
 
 		 358 aa  219  6e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1607  cytochrome oxidase assembly  45.98 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905771 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4907  cytochrome oxidase assembly  35.16 
 
 		 341 aa  215  9e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1888  cytochrome oxidase assembly  44.29 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4596  cytochrome oxidase assembly  47.08 
 
 		 380 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1632  cytochrome oxidase assembly  44.51 
 
 		 381 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84097  Cytochrome c oxidase assembly protein COX15  39.57 
 
 		 480 aa  212  7e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  38.41 
 
 		 325 aa  211  2e-53  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5863  cytochrome oxidase assembly  45.2 
 
 		 360 aa  210  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00720  cytochrome c oxidase biogenesis-related protein, putative  36.16 
 
 		 452 aa  204  2e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.564736  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3288  cytochrome oxidase assembly  44.28 
 
 		 350 aa  204  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0242  cytochrome oxidase assembly  39.04 
 
 		 355 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177445  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0841  cytochrome oxidase assembly  40.22 
 
 		 349 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2047  cytochrome oxidase assembly  37.36 
 
 		 362 aa  196  6e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5367  cytochrome oxidase assembly  44.67 
 
 		 360 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1225  cytochrome oxidase assembly  36.05 
 
 		 367 aa  182  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0432  cytochrome c oxidase assembly protein  35.8 
 
 		 350 aa  178  1e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.668345  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0709  cytochrome oxidase assembly  32.34 
 
 		 347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0294  putative cytochrome oxidase assembly protein  31.88 
 
 		 344 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1224  cytochrome oxidase assembly  30.26 
 
 		 358 aa  145  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  26.05 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  26.21 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  25.9 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  26.58 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  27.78 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  28.41 
 
 		 373 aa  56.2  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  27.67 
 
 		 363 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  26.49 
 
 		 327 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0072  cytochrome oxidase assembly  28.83 
 
 		 359 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  25.9 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  25.9 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  25.9 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  25.9 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  25.9 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  25.9 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  27.63 
 
 		 348 aa  50.8  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  24.33 
 
 		 326 aa  50.4  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  26.83 
 
 		 342 aa  50.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  25.23 
 
 		 369 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  25.9 
 
 		 369 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  26.06 
 
 		 369 aa  49.7  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3040  cytochrome oxidase assembly  27.16 
 
 		 342 aa  49.7  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00748587  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06105  cytochrome oxidase assembly protein  21.88 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  25.15 
 
 		 339 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0043  putative cytochrome oxidase assembly protein  28.57 
 
 		 394 aa  47  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.484274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  29.53 
 
 		 285 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  29.9 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  26.57 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1045  cytochrome oxidase assembly  27.13 
 
 		 356 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  26.86 
 
 		 363 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  27.41 
 
 		 341 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  22.99 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0318  cytochrome oxidase assembly  37.21 
 
 		 387 aa  44.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  25.23 
 
 		 370 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  24.62 
 
 		 327 aa  43.5  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2956  Uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly-like protein  31.45 
 
 		 328 aa  43.5  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  29.53 
 
 		 308 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  25.23 
 
 		 370 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  25.23 
 
 		 370 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>