185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5672 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 339 aa  676    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  50.46 
 
 		 342 aa  328  6e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  42.24 
 
 		 323 aa  255  6e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0296  cytochrome oxidase assembly  36.12 
 
 		 354 aa  199  6e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300662  normal  0.0109948 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  37.66 
 
 		 327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06105  cytochrome oxidase assembly protein  33.73 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  36.27 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  32.57 
 
 		 326 aa  171  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  33.23 
 
 		 341 aa  166  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  29.44 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  29.29 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  24.29 
 
 		 367 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  20.87 
 
 		 363 aa  76.3  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  26.59 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2430  cytochrome oxidase assembly  23.93 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  24.64 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  29.63 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  26.43 
 
 		 399 aa  72.8  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  24.73 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  27.97 
 
 		 622 aa  69.3  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  31.22 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  22.51 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  22.44 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16080  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  27.95 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  23.97 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  22.46 
 
 		 367 aa  67  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  24.09 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  25.08 
 
 		 391 aa  65.9  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  22.51 
 
 		 369 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  22.51 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  24.93 
 
 		 383 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  22.51 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  22.51 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  22.51 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  22.51 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  22.51 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2514  cytochrome oxidase assembly  22.77 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787939  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  25.24 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  23.83 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  29.82 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  24.12 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4065  cytochrome oxidase assembly  36.08 
 
 		 506 aa  62.8  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.328508  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  22.81 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1653  cytochrome oxidase assembly  27.78 
 
 		 342 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  25.94 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0186  hypothetical protein  27.5 
 
 		 137 aa  61.6  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.480963 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2601  putative cytochrome aa3 controlling protein  29.38 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.705731 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  23.21 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  25.17 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  21.93 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  21.93 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4005  cytochrome oxidase assembly  25.48 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5168  cytochrome oxidase assembly  29.49 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251951  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  27.23 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  26.78 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1977  cytochrome oxidase assembly  25.53 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.628163 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  23.93 
 
 		 328 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  26.11 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4163  putative cytochrome oxidase assembly protein  28.95 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0069  cytochrome oxidase assembly  26.61 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  22.98 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4613  cytochrome oxidase assembly protein, putative  29.2 
 
 		 330 aa  57  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  26.73 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  24.85 
 
 		 392 aa  57  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  27.36 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0627  cytochrome oxidase assembly protein  24.15 
 
 		 358 aa  56.2  0.0000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00536761  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  27.36 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  27.36 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4318  cytochrome oxidase assembly  33.71 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0148  cytochrome oxidase assembly  33.71 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4187  cytochrome oxidase assembly  33.71 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3523  cytochrome oxidase assembly  37.04 
 
 		 326 aa  55.8  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  28.17 
 
 		 326 aa  55.8  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4119  cytochrome oxidase assembly  33.71 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0193  cytochrome oxidase assembly  26.34 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4383  cytochrome oxidase assembly  30.21 
 
 		 406 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3858  cytochrome aa3 controlling protein  22.75 
 
 		 311 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3689  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  22.75 
 
 		 311 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3706  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  22.75 
 
 		 311 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.006652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4156  cytochrome aa3 controlling protein  22.75 
 
 		 311 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  25.82 
 
 		 325 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  26.5 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3772  cytochrome oxidase assembly  22.22 
 
 		 311 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161471  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3312  cytochrome oxidase assembly  24.54 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000656603 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4907  cytochrome oxidase assembly  21.45 
 
 		 341 aa  54.3  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3961  cytochrome aa3 controlling protein  22.22 
 
 		 311 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0043  putative cytochrome oxidase assembly protein  31.73 
 
 		 394 aa  53.5  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.484274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0318  cytochrome oxidase assembly  29.41 
 
 		 387 aa  53.5  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3997  cytochrome oxidase assembly  33.33 
 
 		 352 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1045  cytochrome oxidase assembly  22.61 
 
 		 356 aa  53.5  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2543  cytochrome oxidase assembly  25.45 
 
 		 305 aa  53.1  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0684946  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  23.71 
 
 		 335 aa  52.8  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  24.89 
 
 		 337 aa  52.8  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3798  cytochrome oxidase assembly  32.47 
 
 		 352 aa  52.8  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3871  cytochrome oxidase assembly  32.47 
 
 		 352 aa  52.8  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2268  cytochrome oxidase assembly  27.81 
 
 		 337 aa  52.8  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00686495  normal  0.0860504 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2502  cytochrome oxidase assembly  25.44 
 
 		 357 aa  52.8  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0230  cytochrome oxidase assembly protein  24.76 
 
 		 353 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3827  cytochrome oxidase assembly  28.29 
 
 		 411 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.502475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2726  cytochrome oxidase assembly  26.32 
 
 		 318 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0568935  normal  0.123389 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>