78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0627 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0627  cytochrome oxidase assembly protein  100 
 
 
358 aa  724    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00536761  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2502  cytochrome oxidase assembly  55.4 
 
 
357 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0782  putative cytochrome c oxidase assembly protein  56.85 
 
 
382 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0787  cytochrome c oxidase assembly protein, putative  56.85 
 
 
358 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1160  cytochrome oxidase assembly  54.07 
 
 
361 aa  371  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  53.37 
 
 
364 aa  362  5.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0858  cytochrome oxidase assembly  52.06 
 
 
367 aa  357  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  0.254409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1316  cytochrome oxidase assembly  50.14 
 
 
367 aa  346  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1228  cytochrome oxidase assembly  50.14 
 
 
367 aa  345  8e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26943  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  46.4 
 
 
363 aa  298  8e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2460  cytochrome oxidase assembly  46.5 
 
 
389 aa  287  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1418  cytochrome oxidase assembly  45.91 
 
 
360 aa  278  1e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2709  cytochrome oxidase assembly  46.31 
 
 
367 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0393197 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4601  putative cytochrome oxidase assembly protein  45.21 
 
 
362 aa  266  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314543  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2927  cytochrome oxidase assembly  44.77 
 
 
344 aa  265  8.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548442  hitchhiker  0.000233387 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3097  cytochrome oxidase assembly  44.98 
 
 
370 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1632  cytochrome oxidase assembly  43.53 
 
 
381 aa  261  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185838  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0808  cytochrome oxidase assembly  43.36 
 
 
359 aa  258  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1335  cytochrome oxidase assembly  42.82 
 
 
381 aa  256  5e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1878  cytochrome oxidase assembly  44.61 
 
 
359 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1607  cytochrome oxidase assembly  43.95 
 
 
382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0905771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2687  cytochrome oxidase assembly  46.18 
 
 
362 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0468581  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5863  cytochrome oxidase assembly  44.91 
 
 
360 aa  252  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1888  cytochrome oxidase assembly  43.07 
 
 
382 aa  248  8e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2701  cytochrome oxidase assembly  45.85 
 
 
362 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3699  cytochrome oxidase assembly  42.51 
 
 
391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2097  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1519  cytochrome oxidase assembly  40.71 
 
 
341 aa  243  3e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.459506 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2665  cytochrome oxidase assembly  44.48 
 
 
365 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.352051  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1512  putative cytochrome oxidase assembly protein  41.03 
 
 
383 aa  227  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159721  normal  0.764722 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5367  cytochrome oxidase assembly  43.79 
 
 
360 aa  227  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1204  cytochrome oxidase assembly  42.69 
 
 
356 aa  223  4e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3028  cytochrome oxidase assembly  39.07 
 
 
343 aa  219  7e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  38.32 
 
 
325 aa  215  9.999999999999999e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2047  cytochrome oxidase assembly  36.44 
 
 
362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0432  cytochrome c oxidase assembly protein  36.61 
 
 
350 aa  212  7e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.668345  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3524  cytochrome oxidase assembly  38.87 
 
 
391 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3831  putative cytochrome oxidase assembly factor  38.87 
 
 
391 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149666  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00720  cytochrome c oxidase biogenesis-related protein, putative  37.64 
 
 
452 aa  205  1e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.564736  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0242  cytochrome oxidase assembly  37.12 
 
 
355 aa  199  6e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177445  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3812  carboxypeptidase Taq  36.84 
 
 
391 aa  199  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0177967  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84097  Cytochrome c oxidase assembly protein COX15  38.04 
 
 
480 aa  199  9e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2432  cytochrome oxidase assembly  39.55 
 
 
379 aa  199  9e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.11345 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4907  cytochrome oxidase assembly  34.43 
 
 
341 aa  194  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43606  predicted protein  35.28 
 
 
367 aa  187  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.953763 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01915  cytochrome c oxidase assembly protein cox15 (AFU_orthologue; AFUA_6G07670)  36.24 
 
 
441 aa  186  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0653735 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4596  cytochrome oxidase assembly  41.64 
 
 
380 aa  186  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1225  cytochrome oxidase assembly  34.65 
 
 
367 aa  185  9e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0841  cytochrome oxidase assembly  35.78 
 
 
349 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0294  putative cytochrome oxidase assembly protein  34.35 
 
 
344 aa  181  2e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3288  cytochrome oxidase assembly  34.91 
 
 
350 aa  180  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0709  cytochrome oxidase assembly  35.6 
 
 
347 aa  179  7e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21354  predicted protein  32.26 
 
 
422 aa  169  7e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.875011  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1224  cytochrome oxidase assembly  33.24 
 
 
358 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  22.48 
 
 
335 aa  67  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  22.19 
 
 
335 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  28.39 
 
 
339 aa  57  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  22.16 
 
 
367 aa  50.4  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  18.55 
 
 
339 aa  50.8  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  22.34 
 
 
367 aa  50.4  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  25.95 
 
 
327 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  25.71 
 
 
342 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  24.36 
 
 
363 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06105  cytochrome oxidase assembly protein  22.91 
 
 
343 aa  48.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  21.13 
 
 
326 aa  47.4  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  20.06 
 
 
339 aa  47  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  24.64 
 
 
376 aa  45.8  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  20.43 
 
 
327 aa  45.8  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  28.12 
 
 
323 aa  45.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  22.29 
 
 
337 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  21.74 
 
 
328 aa  44.3  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  22.13 
 
 
399 aa  43.9  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  23.5 
 
 
363 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  21.76 
 
 
341 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  20.67 
 
 
369 aa  42.7  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  20.67 
 
 
369 aa  42.7  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  20.67 
 
 
369 aa  42.7  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  21.86 
 
 
396 aa  42.7  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  20.67 
 
 
369 aa  42.7  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>