54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1224 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1224  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 358 aa  711    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1225  cytochrome oxidase assembly  41.79 
 
 		 367 aa  236  4e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2047  cytochrome oxidase assembly  39.6 
 
 		 362 aa  232  8.000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1204  cytochrome oxidase assembly  35.93 
 
 		 356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  34.2 
 
 		 364 aa  179  8e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2460  cytochrome oxidase assembly  34.81 
 
 		 389 aa  176  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43606  predicted protein  34.08 
 
 		 367 aa  171  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.953763 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  37.3 
 
 		 363 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1519  cytochrome oxidase assembly  32.35 
 
 		 341 aa  170  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.459506 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2687  cytochrome oxidase assembly  36.94 
 
 		 362 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0468581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1316  cytochrome oxidase assembly  32.94 
 
 		 367 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1228  cytochrome oxidase assembly  33.24 
 
 		 367 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0808  cytochrome oxidase assembly  37.03 
 
 		 359 aa  163  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1418  cytochrome oxidase assembly  35 
 
 		 360 aa  161  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4601  putative cytochrome oxidase assembly protein  36.11 
 
 		 362 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2502  cytochrome oxidase assembly  33.53 
 
 		 357 aa  160  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1878  cytochrome oxidase assembly  36.96 
 
 		 359 aa  159  7e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2665  cytochrome oxidase assembly  34.97 
 
 		 365 aa  159  9e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.352051  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2709  cytochrome oxidase assembly  38.73 
 
 		 367 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0393197 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0858  cytochrome oxidase assembly  32.94 
 
 		 367 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  0.254409 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3097  cytochrome oxidase assembly  33.84 
 
 		 370 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2927  cytochrome oxidase assembly  38.02 
 
 		 344 aa  150  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548442  hitchhiker  0.000233387 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0627  cytochrome oxidase assembly protein  33.24 
 
 		 358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00536761  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2701  cytochrome oxidase assembly  35.97 
 
 		 362 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_004310  BR0787  cytochrome c oxidase assembly protein, putative  34.59 
 
 		 358 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0782  putative cytochrome c oxidase assembly protein  34.59 
 
 		 382 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1160  cytochrome oxidase assembly  33.43 
 
 		 361 aa  146  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  30.46 
 
 		 325 aa  146  7.0000000000000006e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21354  predicted protein  28.33 
 
 		 422 aa  146  7.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.875011  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5863  cytochrome oxidase assembly  35.71 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5367  cytochrome oxidase assembly  37.01 
 
 		 360 aa  143  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3028  cytochrome oxidase assembly  34.04 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01915  cytochrome c oxidase assembly protein cox15 (AFU_orthologue; AFUA_6G07670)  30.52 
 
 		 441 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0653735 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0841  cytochrome oxidase assembly  32.73 
 
 		 349 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0432  cytochrome c oxidase assembly protein  29.11 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.668345  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1335  cytochrome oxidase assembly  31.18 
 
 		 381 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3524  cytochrome oxidase assembly  33.14 
 
 		 391 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00720  cytochrome c oxidase biogenesis-related protein, putative  30.25 
 
 		 452 aa  132  6.999999999999999e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.564736  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3831  putative cytochrome oxidase assembly factor  32.86 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149666  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4907  cytochrome oxidase assembly  28.57 
 
 		 341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1888  cytochrome oxidase assembly  34.11 
 
 		 382 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3699  cytochrome oxidase assembly  30.26 
 
 		 391 aa  129  9.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2097  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1632  cytochrome oxidase assembly  35.99 
 
 		 381 aa  126  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1512  putative cytochrome oxidase assembly protein  30.55 
 
 		 383 aa  126  7e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159721  normal  0.764722 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1607  cytochrome oxidase assembly  34.4 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905771 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84097  Cytochrome c oxidase assembly protein COX15  30.24 
 
 		 480 aa  120  4.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2432  cytochrome oxidase assembly  31.47 
 
 		 379 aa  119  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.11345 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3812  carboxypeptidase Taq  30.77 
 
 		 391 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0177967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4596  cytochrome oxidase assembly  32.27 
 
 		 380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0294  putative cytochrome oxidase assembly protein  29.14 
 
 		 344 aa  112  7.000000000000001e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3288  cytochrome oxidase assembly  30.31 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0709  cytochrome oxidase assembly  29.6 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0242  cytochrome oxidase assembly  29.39 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177445  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  27.93 
 
 		 363 aa  50.4  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>