102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0242 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0242  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 355 aa  686    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177445  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3288  cytochrome oxidase assembly  51.41 
 
 		 350 aa  297  2e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4596  cytochrome oxidase assembly  54.04 
 
 		 380 aa  295  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  44.77 
 
 		 363 aa  248  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2460  cytochrome oxidase assembly  42.26 
 
 		 389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2701  cytochrome oxidase assembly  45.57 
 
 		 362 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1418  cytochrome oxidase assembly  44.21 
 
 		 360 aa  241  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4601  putative cytochrome oxidase assembly protein  43.87 
 
 		 362 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3097  cytochrome oxidase assembly  42.81 
 
 		 370 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2665  cytochrome oxidase assembly  43.93 
 
 		 365 aa  232  9e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.352051  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2687  cytochrome oxidase assembly  42.69 
 
 		 362 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0468581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1878  cytochrome oxidase assembly  44.25 
 
 		 359 aa  231  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  40.28 
 
 		 364 aa  230  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1519  cytochrome oxidase assembly  41.5 
 
 		 341 aa  227  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.459506 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1228  cytochrome oxidase assembly  41.61 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1335  cytochrome oxidase assembly  39.83 
 
 		 381 aa  222  6e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4907  cytochrome oxidase assembly  36.23 
 
 		 341 aa  220  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0808  cytochrome oxidase assembly  41.84 
 
 		 359 aa  220  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1316  cytochrome oxidase assembly  40.81 
 
 		 367 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2927  cytochrome oxidase assembly  43.45 
 
 		 344 aa  219  7e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548442  hitchhiker  0.000233387 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2502  cytochrome oxidase assembly  40.76 
 
 		 357 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3524  cytochrome oxidase assembly  44.68 
 
 		 391 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1204  cytochrome oxidase assembly  36.93 
 
 		 356 aa  216  5e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1160  cytochrome oxidase assembly  42.15 
 
 		 361 aa  215  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3831  putative cytochrome oxidase assembly factor  44.38 
 
 		 391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149666  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3028  cytochrome oxidase assembly  43.79 
 
 		 343 aa  212  7.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_002978  WD0432  cytochrome c oxidase assembly protein  36.14 
 
 		 350 aa  209  5e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.668345  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0627  cytochrome oxidase assembly protein  36.02 
 
 		 358 aa  207  2e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00536761  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0858  cytochrome oxidase assembly  42.9 
 
 		 367 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  0.254409 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3812  carboxypeptidase Taq  43.77 
 
 		 391 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0177967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2709  cytochrome oxidase assembly  43.34 
 
 		 367 aa  206  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0393197 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  36.14 
 
 		 325 aa  197  3e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1632  cytochrome oxidase assembly  41.83 
 
 		 381 aa  197  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3699  cytochrome oxidase assembly  39.64 
 
 		 391 aa  196  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2097  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5863  cytochrome oxidase assembly  42.55 
 
 		 360 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1512  putative cytochrome oxidase assembly protein  40.12 
 
 		 383 aa  192  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159721  normal  0.764722 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0782  putative cytochrome c oxidase assembly protein  42.47 
 
 		 382 aa  192  7e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0787  cytochrome c oxidase assembly protein, putative  42.47 
 
 		 358 aa  192  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1607  cytochrome oxidase assembly  41.62 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1888  cytochrome oxidase assembly  41.33 
 
 		 382 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00720  cytochrome c oxidase biogenesis-related protein, putative  34.95 
 
 		 452 aa  186  4e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.564736  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2047  cytochrome oxidase assembly  35.38 
 
 		 362 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01915  cytochrome c oxidase assembly protein cox15 (AFU_orthologue; AFUA_6G07670)  38.73 
 
 		 441 aa  181  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0653735 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0294  putative cytochrome oxidase assembly protein  36.42 
 
 		 344 aa  182  1e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21354  predicted protein  35 
 
 		 422 aa  182  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.875011  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0841  cytochrome oxidase assembly  41.06 
 
 		 349 aa  179  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0709  cytochrome oxidase assembly  35.51 
 
 		 347 aa  179  8e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43606  predicted protein  34.59 
 
 		 367 aa  171  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.953763 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1225  cytochrome oxidase assembly  36.2 
 
 		 367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5367  cytochrome oxidase assembly  41.43 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84097  Cytochrome c oxidase assembly protein COX15  35.03 
 
 		 480 aa  164  3e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2432  cytochrome oxidase assembly  38.27 
 
 		 379 aa  157  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.11345 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1224  cytochrome oxidase assembly  29.31 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  29.1 
 
 		 363 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  29.91 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  30.38 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  27.41 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  27.6 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  30.38 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  30.22 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  28.57 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  28.57 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  28.57 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  28.57 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  28.27 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  28.27 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  28.02 
 
 		 373 aa  55.8  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  22.84 
 
 		 285 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  28.27 
 
 		 369 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  27.66 
 
 		 369 aa  53.1  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  23.65 
 
 		 328 aa  50.8  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  27.57 
 
 		 376 aa  50.4  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  27.96 
 
 		 370 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1753  putative cytochrome c oxidase assembly protein  33.33 
 
 		 327 aa  49.7  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  27.27 
 
 		 370 aa  49.7  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  27.96 
 
 		 370 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  27.96 
 
 		 370 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  25.89 
 
 		 348 aa  49.3  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  24.28 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0069  cytochrome oxidase assembly  27.37 
 
 		 368 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  24.84 
 
 		 325 aa  49.3  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  28.26 
 
 		 369 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1045  cytochrome oxidase assembly  28 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  24.04 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  24.89 
 
 		 333 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  26.09 
 
 		 307 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  24.11 
 
 		 313 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  24.11 
 
 		 313 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  26.92 
 
 		 339 aa  47  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  20.28 
 
 		 308 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  27.66 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  27.66 
 
 		 370 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4005  cytochrome oxidase assembly  25.23 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04451  hypothetical protein  23.64 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.898486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2601  putative cytochrome aa3 controlling protein  27.63 
 
 		 304 aa  44.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.705731 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  22.5 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  25.64 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  27.66 
 
 		 370 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  24.16 
 
 		 311 aa  43.9  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  25.75 
 
 		 327 aa  43.5  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>