80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2460 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2460  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 389 aa  766    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1418  cytochrome oxidase assembly  86.67 
 
 		 360 aa  610  1e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2687  cytochrome oxidase assembly  70.85 
 
 		 362 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0468581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3097  cytochrome oxidase assembly  66.2 
 
 		 370 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4601  putative cytochrome oxidase assembly protein  67.75 
 
 		 362 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2665  cytochrome oxidase assembly  70.45 
 
 		 365 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.352051  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2701  cytochrome oxidase assembly  68.58 
 
 		 362 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  60.96 
 
 		 363 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  51.22 
 
 		 364 aa  309  5.9999999999999995e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2502  cytochrome oxidase assembly  49.7 
 
 		 357 aa  302  7.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1228  cytochrome oxidase assembly  48.17 
 
 		 367 aa  300  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1316  cytochrome oxidase assembly  48.79 
 
 		 367 aa  295  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1878  cytochrome oxidase assembly  48.73 
 
 		 359 aa  294  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0858  cytochrome oxidase assembly  47.93 
 
 		 367 aa  290  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  0.254409 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1160  cytochrome oxidase assembly  51.22 
 
 		 361 aa  290  3e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0808  cytochrome oxidase assembly  49.41 
 
 		 359 aa  285  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2927  cytochrome oxidase assembly  49.28 
 
 		 344 aa  283  5.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548442  hitchhiker  0.000233387 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0627  cytochrome oxidase assembly protein  46.5 
 
 		 358 aa  278  9e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00536761  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0782  putative cytochrome c oxidase assembly protein  49.7 
 
 		 382 aa  278  1e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0787  cytochrome c oxidase assembly protein, putative  49.7 
 
 		 358 aa  277  3e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5863  cytochrome oxidase assembly  50.15 
 
 		 360 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1204  cytochrome oxidase assembly  48.38 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1888  cytochrome oxidase assembly  49.24 
 
 		 382 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2709  cytochrome oxidase assembly  48.04 
 
 		 367 aa  260  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0393197 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1632  cytochrome oxidase assembly  47.29 
 
 		 381 aa  257  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1607  cytochrome oxidase assembly  49.54 
 
 		 382 aa  257  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905771 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1519  cytochrome oxidase assembly  43.81 
 
 		 341 aa  256  5e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.459506 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1335  cytochrome oxidase assembly  44.11 
 
 		 381 aa  247  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3028  cytochrome oxidase assembly  46.85 
 
 		 343 aa  239  5e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3699  cytochrome oxidase assembly  45.32 
 
 		 391 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2097  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21354  predicted protein  38.7 
 
 		 422 aa  232  9e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.875011  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0242  cytochrome oxidase assembly  41.37 
 
 		 355 aa  231  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177445  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5367  cytochrome oxidase assembly  51.82 
 
 		 360 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3524  cytochrome oxidase assembly  44.12 
 
 		 391 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3831  putative cytochrome oxidase assembly factor  44.12 
 
 		 391 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149666  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4596  cytochrome oxidase assembly  46.05 
 
 		 380 aa  225  8e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  40.67 
 
 		 325 aa  223  4e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0432  cytochrome c oxidase assembly protein  39.51 
 
 		 350 aa  222  7e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.668345  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43606  predicted protein  39 
 
 		 367 aa  222  8e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.953763 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00720  cytochrome c oxidase biogenesis-related protein, putative  38.81 
 
 		 452 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.564736  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1512  putative cytochrome oxidase assembly protein  42.55 
 
 		 383 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159721  normal  0.764722 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84097  Cytochrome c oxidase assembly protein COX15  40.21 
 
 		 480 aa  212  9e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4907  cytochrome oxidase assembly  35.71 
 
 		 341 aa  211  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3812  carboxypeptidase Taq  41.69 
 
 		 391 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0177967  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01915  cytochrome c oxidase assembly protein cox15 (AFU_orthologue; AFUA_6G07670)  37.3 
 
 		 441 aa  210  4e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0653735 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2047  cytochrome oxidase assembly  38.29 
 
 		 362 aa  209  6e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2432  cytochrome oxidase assembly  41.05 
 
 		 379 aa  204  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.11345 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3288  cytochrome oxidase assembly  40.06 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0709  cytochrome oxidase assembly  37.27 
 
 		 347 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0841  cytochrome oxidase assembly  39.94 
 
 		 349 aa  193  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1225  cytochrome oxidase assembly  35.09 
 
 		 367 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0294  putative cytochrome oxidase assembly protein  39.25 
 
 		 344 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1224  cytochrome oxidase assembly  34.81 
 
 		 358 aa  176  7e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  24.62 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  25.3 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  26.32 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  26.61 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  24.49 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  25 
 
 		 363 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  26.45 
 
 		 392 aa  52.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  25.61 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1197  cytochrome oxidase assembly  25.29 
 
 		 356 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1175  cytochrome oxidase assembly  25.29 
 
 		 356 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  27.54 
 
 		 285 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0705  cytochrome oxidase assembly protein  25.29 
 
 		 302 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  24.61 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  27.04 
 
 		 341 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  24.38 
 
 		 308 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  26.53 
 
 		 308 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  25.59 
 
 		 404 aa  47.8  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  24.16 
 
 		 325 aa  47  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  23.75 
 
 		 308 aa  46.6  0.0009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  26.09 
 
 		 376 aa  46.2  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  24.37 
 
 		 327 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  24.47 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04451  hypothetical protein  27.92 
 
 		 288 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.898486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  27.1 
 
 		 396 aa  44.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  26.7 
 
 		 399 aa  44.7  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  22.64 
 
 		 339 aa  44.3  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1045  cytochrome oxidase assembly  24.22 
 
 		 356 aa  43.5  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>