81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0841 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0841  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 349 aa  698    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4907  cytochrome oxidase assembly  39.23 
 
 		 341 aa  246  4.9999999999999997e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1204  cytochrome oxidase assembly  37.46 
 
 		 356 aa  219  5e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2460  cytochrome oxidase assembly  39.71 
 
 		 389 aa  218  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  40.25 
 
 		 363 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1519  cytochrome oxidase assembly  37.5 
 
 		 341 aa  213  3.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.459506 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1418  cytochrome oxidase assembly  38.66 
 
 		 360 aa  211  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3097  cytochrome oxidase assembly  38.75 
 
 		 370 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2687  cytochrome oxidase assembly  40 
 
 		 362 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0468581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4601  putative cytochrome oxidase assembly protein  39.47 
 
 		 362 aa  209  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1335  cytochrome oxidase assembly  35.43 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  35.87 
 
 		 364 aa  202  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2927  cytochrome oxidase assembly  40.35 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548442  hitchhiker  0.000233387 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2665  cytochrome oxidase assembly  39.22 
 
 		 365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.352051  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0627  cytochrome oxidase assembly protein  35.06 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00536761  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2701  cytochrome oxidase assembly  39.13 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1228  cytochrome oxidase assembly  36.39 
 
 		 367 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3699  cytochrome oxidase assembly  38.07 
 
 		 391 aa  192  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2097  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_002978  WD0432  cytochrome c oxidase assembly protein  37.28 
 
 		 350 aa  192  7e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.668345  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0858  cytochrome oxidase assembly  37.69 
 
 		 367 aa  192  9e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  0.254409 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3524  cytochrome oxidase assembly  36.7 
 
 		 391 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3028  cytochrome oxidase assembly  39.34 
 
 		 343 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2047  cytochrome oxidase assembly  35.16 
 
 		 362 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1316  cytochrome oxidase assembly  36.42 
 
 		 367 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2502  cytochrome oxidase assembly  37.88 
 
 		 357 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4596  cytochrome oxidase assembly  42.42 
 
 		 380 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3831  putative cytochrome oxidase assembly factor  36.09 
 
 		 391 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149666  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1160  cytochrome oxidase assembly  37.61 
 
 		 361 aa  186  8e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2709  cytochrome oxidase assembly  36.49 
 
 		 367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0393197 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  36.97 
 
 		 325 aa  183  5.0000000000000004e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1512  putative cytochrome oxidase assembly protein  36.07 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159721  normal  0.764722 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3288  cytochrome oxidase assembly  39.19 
 
 		 350 aa  179  7e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0242  cytochrome oxidase assembly  35.94 
 
 		 355 aa  178  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177445  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0808  cytochrome oxidase assembly  38.24 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1878  cytochrome oxidase assembly  36.2 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2432  cytochrome oxidase assembly  37.5 
 
 		 379 aa  175  9e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.11345 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1888  cytochrome oxidase assembly  37.73 
 
 		 382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_004310  BR0787  cytochrome c oxidase assembly protein, putative  38.97 
 
 		 358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0782  putative cytochrome c oxidase assembly protein  38.97 
 
 		 382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1632  cytochrome oxidase assembly  36.78 
 
 		 381 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1607  cytochrome oxidase assembly  37.73 
 
 		 382 aa  172  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905771 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3812  carboxypeptidase Taq  36.21 
 
 		 391 aa  173  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0177967  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01915  cytochrome c oxidase assembly protein cox15 (AFU_orthologue; AFUA_6G07670)  36.09 
 
 		 441 aa  170  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0653735 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0709  cytochrome oxidase assembly  36.73 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5863  cytochrome oxidase assembly  37.13 
 
 		 360 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21354  predicted protein  33.33 
 
 		 422 aa  163  4.0000000000000004e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.875011  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0294  putative cytochrome oxidase assembly protein  39.62 
 
 		 344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43606  predicted protein  32.87 
 
 		 367 aa  162  6e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.953763 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1225  cytochrome oxidase assembly  32.52 
 
 		 367 aa  159  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5367  cytochrome oxidase assembly  34.93 
 
 		 360 aa  156  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00720  cytochrome c oxidase biogenesis-related protein, putative  32.13 
 
 		 452 aa  153  5e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.564736  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1224  cytochrome oxidase assembly  31.36 
 
 		 358 aa  151  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84097  Cytochrome c oxidase assembly protein COX15  32.55 
 
 		 480 aa  140  3.9999999999999997e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  27.38 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  27.09 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  24.78 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3040  cytochrome oxidase assembly  28.64 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00748587  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  24.64 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  24.56 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  23.68 
 
 		 339 aa  54.3  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4065  cytochrome oxidase assembly  25.64 
 
 		 506 aa  53.5  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.328508  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  24.47 
 
 		 404 aa  52.8  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0069  cytochrome oxidase assembly  26.94 
 
 		 368 aa  50.8  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2076  cytochrome oxidase assembly  23.73 
 
 		 326 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.809724 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  23.47 
 
 		 323 aa  50.8  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  25 
 
 		 327 aa  50.4  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1387  cytochrome oxidase assembly  25.98 
 
 		 407 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  24.92 
 
 		 328 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0126  cytochrome oxidase assembly  25.93 
 
 		 359 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  24 
 
 		 363 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  24 
 
 		 363 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  26.24 
 
 		 363 aa  46.6  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  26.61 
 
 		 373 aa  46.2  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0124  cytochrome oxidase assembly  24.84 
 
 		 359 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190927  normal  0.0274429 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  23.01 
 
 		 392 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0109  cytochrome oxidase assembly  25.23 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.475032  normal  0.476439 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  24.77 
 
 		 376 aa  44.3  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  23.12 
 
 		 326 aa  43.5  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0712  cytochrome oxidase assembly protein  25.13 
 
 		 387 aa  43.5  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809899  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4005  cytochrome oxidase assembly  22.57 
 
 		 327 aa  42.7  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06105  cytochrome oxidase assembly protein  22.42 
 
 		 343 aa  42.7  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>