88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1519 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1519  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 
341 aa  678    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.459506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  48.12 
 
 
363 aa  278  7e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2927  cytochrome oxidase assembly  50.15 
 
 
344 aa  277  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548442  hitchhiker  0.000233387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1316  cytochrome oxidase assembly  48.62 
 
 
367 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  47.38 
 
 
364 aa  275  7e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1228  cytochrome oxidase assembly  48.02 
 
 
367 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26943  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3028  cytochrome oxidase assembly  46.18 
 
 
343 aa  268  7e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1160  cytochrome oxidase assembly  48.64 
 
 
361 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3097  cytochrome oxidase assembly  43.9 
 
 
370 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4601  putative cytochrome oxidase assembly protein  45.4 
 
 
362 aa  262  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314543  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1335  cytochrome oxidase assembly  43.4 
 
 
381 aa  258  1e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3699  cytochrome oxidase assembly  49.41 
 
 
391 aa  257  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2097  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2460  cytochrome oxidase assembly  43.81 
 
 
389 aa  256  4e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2687  cytochrome oxidase assembly  46.39 
 
 
362 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0468581  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1512  putative cytochrome oxidase assembly protein  48.22 
 
 
383 aa  251  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159721  normal  0.764722 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0858  cytochrome oxidase assembly  43.77 
 
 
367 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  0.254409 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1204  cytochrome oxidase assembly  42.3 
 
 
356 aa  250  3e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2701  cytochrome oxidase assembly  44.38 
 
 
362 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1418  cytochrome oxidase assembly  44.67 
 
 
360 aa  248  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2502  cytochrome oxidase assembly  43.66 
 
 
357 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2665  cytochrome oxidase assembly  43.73 
 
 
365 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.352051  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3524  cytochrome oxidase assembly  43.11 
 
 
391 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3831  putative cytochrome oxidase assembly factor  43.11 
 
 
391 aa  235  7e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149666  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43606  predicted protein  42.49 
 
 
367 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.953763 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0782  putative cytochrome c oxidase assembly protein  45.43 
 
 
382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0787  cytochrome c oxidase assembly protein, putative  45.43 
 
 
358 aa  233  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0627  cytochrome oxidase assembly protein  40.71 
 
 
358 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00536761  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1878  cytochrome oxidase assembly  46.15 
 
 
359 aa  229  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0808  cytochrome oxidase assembly  44.18 
 
 
359 aa  227  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3812  carboxypeptidase Taq  42.52 
 
 
391 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0177967  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2709  cytochrome oxidase assembly  47.47 
 
 
367 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0393197 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2432  cytochrome oxidase assembly  44.11 
 
 
379 aa  220  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.11345 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21354  predicted protein  36.86 
 
 
422 aa  215  9.999999999999999e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.875011  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0432  cytochrome c oxidase assembly protein  39.63 
 
 
350 aa  212  5.999999999999999e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.668345  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5863  cytochrome oxidase assembly  46.39 
 
 
360 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0242  cytochrome oxidase assembly  41.96 
 
 
355 aa  211  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177445  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1607  cytochrome oxidase assembly  45.86 
 
 
382 aa  209  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0905771 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  38.94 
 
 
325 aa  209  7e-53  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4907  cytochrome oxidase assembly  36.42 
 
 
341 aa  208  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1632  cytochrome oxidase assembly  44.97 
 
 
381 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185838  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1888  cytochrome oxidase assembly  45.24 
 
 
382 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84097  Cytochrome c oxidase assembly protein COX15  39.67 
 
 
480 aa  207  2e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2047  cytochrome oxidase assembly  39.76 
 
 
362 aa  203  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01915  cytochrome c oxidase assembly protein cox15 (AFU_orthologue; AFUA_6G07670)  38.9 
 
 
441 aa  203  4e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0653735 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4596  cytochrome oxidase assembly  43.08 
 
 
380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3288  cytochrome oxidase assembly  38.87 
 
 
350 aa  195  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0841  cytochrome oxidase assembly  40.96 
 
 
349 aa  186  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00720  cytochrome c oxidase biogenesis-related protein, putative  33.33 
 
 
452 aa  186  7e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.564736  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5367  cytochrome oxidase assembly  42.94 
 
 
360 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1225  cytochrome oxidase assembly  38.11 
 
 
367 aa  178  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1224  cytochrome oxidase assembly  32.35 
 
 
358 aa  170  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0709  cytochrome oxidase assembly  32.12 
 
 
347 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0294  putative cytochrome oxidase assembly protein  33.65 
 
 
344 aa  145  1e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  25.76 
 
 
335 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  24.05 
 
 
328 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  26.04 
 
 
335 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  28.7 
 
 
363 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  26.38 
 
 
363 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  26.52 
 
 
363 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  25.71 
 
 
327 aa  53.9  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  27.93 
 
 
367 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  25.99 
 
 
325 aa  52.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  25.38 
 
 
311 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  26.13 
 
 
369 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  26.13 
 
 
369 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  26.13 
 
 
369 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  26.13 
 
 
369 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  26.13 
 
 
369 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  26.13 
 
 
369 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  25.46 
 
 
327 aa  50.1  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  25.83 
 
 
369 aa  49.3  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  27.23 
 
 
373 aa  48.5  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  22.62 
 
 
339 aa  48.9  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  26.13 
 
 
369 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  28.83 
 
 
367 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2076  cytochrome oxidase assembly  33.66 
 
 
326 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.809724 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  21.25 
 
 
326 aa  46.6  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0072  cytochrome oxidase assembly  26.36 
 
 
359 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  21.34 
 
 
339 aa  43.9  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  27.19 
 
 
348 aa  43.9  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  25.3 
 
 
370 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  24.15 
 
 
383 aa  43.5  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  25 
 
 
370 aa  43.5  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  25.61 
 
 
369 aa  42.7  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  25 
 
 
370 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0109  cytochrome oxidase assembly  24.54 
 
 
359 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.475032  normal  0.476439 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  25 
 
 
370 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  25 
 
 
370 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>