74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1225 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1225  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 367 aa  731    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2047  cytochrome oxidase assembly  46.48 
 
 		 362 aa  286  2.9999999999999996e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1224  cytochrome oxidase assembly  41.79 
 
 		 358 aa  256  3e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  39.58 
 
 		 363 aa  215  9e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2502  cytochrome oxidase assembly  36.67 
 
 		 357 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  37.79 
 
 		 364 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1204  cytochrome oxidase assembly  37.46 
 
 		 356 aa  209  5e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2665  cytochrome oxidase assembly  37.75 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.352051  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3097  cytochrome oxidase assembly  40.92 
 
 		 370 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1316  cytochrome oxidase assembly  37.76 
 
 		 367 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1228  cytochrome oxidase assembly  37.76 
 
 		 367 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2460  cytochrome oxidase assembly  36.53 
 
 		 389 aa  194  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1519  cytochrome oxidase assembly  38.35 
 
 		 341 aa  194  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.459506 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0782  putative cytochrome c oxidase assembly protein  37.98 
 
 		 382 aa  192  7e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0787  cytochrome c oxidase assembly protein, putative  37.98 
 
 		 358 aa  192  9e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1160  cytochrome oxidase assembly  37.28 
 
 		 361 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0858  cytochrome oxidase assembly  37.9 
 
 		 367 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  0.254409 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2701  cytochrome oxidase assembly  37.58 
 
 		 362 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2927  cytochrome oxidase assembly  38.01 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548442  hitchhiker  0.000233387 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2687  cytochrome oxidase assembly  39.13 
 
 		 362 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0468581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0627  cytochrome oxidase assembly protein  34.86 
 
 		 358 aa  186  4e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00536761  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1418  cytochrome oxidase assembly  36.66 
 
 		 360 aa  186  5e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2709  cytochrome oxidase assembly  39.6 
 
 		 367 aa  182  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0393197 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43606  predicted protein  34.83 
 
 		 367 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.953763 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5863  cytochrome oxidase assembly  41.94 
 
 		 360 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4601  putative cytochrome oxidase assembly protein  37.35 
 
 		 362 aa  176  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  35.37 
 
 		 325 aa  174  2.9999999999999996e-42  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1335  cytochrome oxidase assembly  35.24 
 
 		 381 aa  173  5e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1878  cytochrome oxidase assembly  36.83 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5367  cytochrome oxidase assembly  41.04 
 
 		 360 aa  170  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_002978  WD0432  cytochrome c oxidase assembly protein  33.04 
 
 		 350 aa  170  4e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.668345  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3699  cytochrome oxidase assembly  36.87 
 
 		 391 aa  169  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2097  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21354  predicted protein  30.73 
 
 		 422 aa  167  2.9999999999999998e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.875011  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3028  cytochrome oxidase assembly  37.72 
 
 		 343 aa  166  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1632  cytochrome oxidase assembly  38.53 
 
 		 381 aa  166  8e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0808  cytochrome oxidase assembly  35.55 
 
 		 359 aa  163  6e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2432  cytochrome oxidase assembly  38.58 
 
 		 379 aa  162  8.000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.11345 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4907  cytochrome oxidase assembly  30.81 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1607  cytochrome oxidase assembly  38.19 
 
 		 382 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1888  cytochrome oxidase assembly  37.61 
 
 		 382 aa  157  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1512  putative cytochrome oxidase assembly protein  34.39 
 
 		 383 aa  157  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159721  normal  0.764722 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0242  cytochrome oxidase assembly  37.87 
 
 		 355 aa  155  8e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177445  normal  0.655757 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01915  cytochrome c oxidase assembly protein cox15 (AFU_orthologue; AFUA_6G07670)  31.27 
 
 		 441 aa  155  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0653735 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0841  cytochrome oxidase assembly  33.7 
 
 		 349 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3524  cytochrome oxidase assembly  34.9 
 
 		 391 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00720  cytochrome c oxidase biogenesis-related protein, putative  31.3 
 
 		 452 aa  147  3e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.564736  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3831  putative cytochrome oxidase assembly factor  34.31 
 
 		 391 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149666  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84097  Cytochrome c oxidase assembly protein COX15  32.7 
 
 		 480 aa  138  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3288  cytochrome oxidase assembly  34.94 
 
 		 350 aa  136  7.000000000000001e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4596  cytochrome oxidase assembly  34.33 
 
 		 380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3812  carboxypeptidase Taq  33.14 
 
 		 391 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0177967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0294  putative cytochrome oxidase assembly protein  30.04 
 
 		 344 aa  122  7e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0709  cytochrome oxidase assembly  28.27 
 
 		 347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  28.08 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  28.08 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  28.33 
 
 		 363 aa  54.3  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1387  cytochrome oxidase assembly  29.61 
 
 		 407 aa  49.7  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  24.05 
 
 		 339 aa  47  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  25.37 
 
 		 367 aa  46.6  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  27.08 
 
 		 370 aa  46.2  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  24.71 
 
 		 369 aa  46.2  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  24.71 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  25.75 
 
 		 370 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  25.75 
 
 		 370 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0069  cytochrome oxidase assembly  25.14 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  25.61 
 
 		 369 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  25.61 
 
 		 369 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  25.61 
 
 		 369 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  25.61 
 
 		 369 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  25.61 
 
 		 369 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  25.61 
 
 		 369 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  25.48 
 
 		 370 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  24.93 
 
 		 369 aa  43.5  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  25.89 
 
 		 369 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>