166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3900 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 404 aa  788    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  79.8 
 
 		 399 aa  571  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  79.84 
 
 		 396 aa  565  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1387  cytochrome oxidase assembly  68.2 
 
 		 407 aa  449  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  61.58 
 
 		 392 aa  442  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4383  cytochrome oxidase assembly  66.75 
 
 		 406 aa  435  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  63.06 
 
 		 383 aa  428  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4065  cytochrome oxidase assembly  69.04 
 
 		 506 aa  411  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.328508  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1688  cytochrome oxidase assembly  67.38 
 
 		 398 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  63.2 
 
 		 391 aa  389  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3827  cytochrome oxidase assembly  57.43 
 
 		 411 aa  344  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.502475 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  51.83 
 
 		 369 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  51.83 
 
 		 369 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  51.57 
 
 		 369 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  51.57 
 
 		 369 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  51.57 
 
 		 369 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  51.57 
 
 		 369 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  51.57 
 
 		 369 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  51.76 
 
 		 369 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  50.14 
 
 		 367 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  51.19 
 
 		 370 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  51.19 
 
 		 370 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  51.19 
 
 		 370 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  50.66 
 
 		 370 aa  299  5e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  48.73 
 
 		 367 aa  298  9e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  50.66 
 
 		 369 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  49.17 
 
 		 363 aa  297  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  48.76 
 
 		 363 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  50.42 
 
 		 363 aa  295  7e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  52.57 
 
 		 369 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  50.95 
 
 		 370 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  50.95 
 
 		 370 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4163  putative cytochrome oxidase assembly protein  52.86 
 
 		 369 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  50.68 
 
 		 370 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  48.66 
 
 		 376 aa  265  8.999999999999999e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  49.25 
 
 		 373 aa  260  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  44.08 
 
 		 348 aa  210  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  38.77 
 
 		 335 aa  207  3e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  39.76 
 
 		 335 aa  207  4e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0334  putative cytochrome aa3 oxidase assembly protein,related to CtaA  44.26 
 
 		 327 aa  203  4e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  38.89 
 
 		 325 aa  202  9e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  36.09 
 
 		 339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0069  cytochrome oxidase assembly  39.82 
 
 		 368 aa  196  6e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3040  cytochrome oxidase assembly  42.62 
 
 		 342 aa  192  9e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00748587  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  36.23 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4613  cytochrome oxidase assembly protein, putative  38.18 
 
 		 330 aa  191  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0072  cytochrome oxidase assembly  41.3 
 
 		 359 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  42.49 
 
 		 339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0126  cytochrome oxidase assembly  41.8 
 
 		 359 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  37.39 
 
 		 326 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  36.42 
 
 		 339 aa  189  7e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0109  cytochrome oxidase assembly  41.16 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.475032  normal  0.476439 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4318  cytochrome oxidase assembly  37.08 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4187  cytochrome oxidase assembly  36.78 
 
 		 325 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4119  cytochrome oxidase assembly  36.78 
 
 		 325 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01360  hypothetical protein  44.38 
 
 		 357 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0148  cytochrome oxidase assembly  36.47 
 
 		 325 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0318  cytochrome oxidase assembly  36.72 
 
 		 387 aa  186  8e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3490  cytochrome oxidase assembly  38.69 
 
 		 327 aa  186  9e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0187  hypothetical protein  43.71 
 
 		 357 aa  182  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0129  cytochrome oxidase assembly  41.61 
 
 		 357 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.96534 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  38.34 
 
 		 327 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0124  cytochrome oxidase assembly  41.53 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190927  normal  0.0274429 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4005  cytochrome oxidase assembly  37.39 
 
 		 327 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0230  cytochrome oxidase assembly protein  34.07 
 
 		 353 aa  179  8e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04027  cytochrome oxidase assembly protein  36.29 
 
 		 387 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0149  cytochrome oxidase assembly  43.46 
 
 		 345 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3523  cytochrome oxidase assembly  35.78 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  35.17 
 
 		 325 aa  170  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0629  putative cytochrome oxidase assembly protein  35.16 
 
 		 387 aa  169  9e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0712  cytochrome oxidase assembly protein  35.16 
 
 		 387 aa  168  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809899  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0171  cytochrome oxidase assembly  36.02 
 
 		 327 aa  167  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  43.35 
 
 		 361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3997  cytochrome oxidase assembly  34.87 
 
 		 352 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3798  cytochrome oxidase assembly  34.58 
 
 		 352 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3871  cytochrome oxidase assembly  34.58 
 
 		 352 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00950  Cytochrome oxidase assembly protein  41.81 
 
 		 356 aa  157  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1045  cytochrome oxidase assembly  39.43 
 
 		 356 aa  142  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0043  putative cytochrome oxidase assembly protein  42.18 
 
 		 394 aa  138  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.484274  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0133  cytochrome oxidase assembly family protein/cell division protein FtsY  35.97 
 
 		 671 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04006  cytochrome oxidase assembly  32.4 
 
 		 354 aa  109  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2711  cytochrome oxidase assembly  32.59 
 
 		 375 aa  107  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318505  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  24.92 
 
 		 323 aa  86.3  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06105  cytochrome oxidase assembly protein  21.29 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  27.27 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  29.97 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  29.97 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  25.86 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  30.94 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  24.93 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1780  cytochrome oxidase assembly  31.19 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  28.05 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1210  cytochrome oxidase assembly  33.48 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.294531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  32.18 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  27.3 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  25.45 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  27.82 
 
 		 364 aa  66.6  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  27.71 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  29.8 
 
 		 326 aa  66.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  26.11 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>