158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3827 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3827  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 411 aa  793    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.502475 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  55.09 
 
 		 392 aa  385  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  59.07 
 
 		 391 aa  383  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  57.86 
 
 		 399 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  57.86 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  55.36 
 
 		 383 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  56.68 
 
 		 404 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1387  cytochrome oxidase assembly  61.56 
 
 		 407 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4383  cytochrome oxidase assembly  55.01 
 
 		 406 aa  362  9e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1688  cytochrome oxidase assembly  58.12 
 
 		 398 aa  322  6e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4065  cytochrome oxidase assembly  54.52 
 
 		 506 aa  307  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.328508  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  51.41 
 
 		 363 aa  298  9e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  47.78 
 
 		 363 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  47.78 
 
 		 363 aa  295  9e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  47.95 
 
 		 367 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  48.9 
 
 		 367 aa  282  6.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  45.14 
 
 		 376 aa  265  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  45.43 
 
 		 369 aa  256  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  43.98 
 
 		 369 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  46.81 
 
 		 369 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  43.98 
 
 		 369 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  43.98 
 
 		 369 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  43.98 
 
 		 369 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  43.88 
 
 		 370 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  43.72 
 
 		 369 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  43.88 
 
 		 370 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  43.88 
 
 		 370 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  43.72 
 
 		 369 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  43.37 
 
 		 370 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  43.72 
 
 		 369 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  43.75 
 
 		 369 aa  249  6e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  43.11 
 
 		 370 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  43.11 
 
 		 370 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4163  putative cytochrome oxidase assembly protein  46.54 
 
 		 369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  44.32 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  44 
 
 		 370 aa  242  7e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0334  putative cytochrome aa3 oxidase assembly protein,related to CtaA  49.37 
 
 		 327 aa  224  3e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  43.64 
 
 		 348 aa  215  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0126  cytochrome oxidase assembly  41.51 
 
 		 359 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0129  cytochrome oxidase assembly  42.9 
 
 		 357 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.96534 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0109  cytochrome oxidase assembly  41.51 
 
 		 359 aa  206  9e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.475032  normal  0.476439 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  35.55 
 
 		 339 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0124  cytochrome oxidase assembly  42.27 
 
 		 359 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190927  normal  0.0274429 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0072  cytochrome oxidase assembly  41.41 
 
 		 359 aa  199  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01360  hypothetical protein  42.3 
 
 		 357 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0187  hypothetical protein  42.73 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0069  cytochrome oxidase assembly  37.98 
 
 		 368 aa  194  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  35.36 
 
 		 339 aa  193  5e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  34.91 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  34.62 
 
 		 335 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0149  cytochrome oxidase assembly  43.53 
 
 		 345 aa  186  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  41.44 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  36.17 
 
 		 325 aa  184  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  36.87 
 
 		 328 aa  183  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4613  cytochrome oxidase assembly protein, putative  39.7 
 
 		 330 aa  179  7e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  34.48 
 
 		 325 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  36.01 
 
 		 326 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  35.5 
 
 		 327 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3490  cytochrome oxidase assembly  38.01 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4318  cytochrome oxidase assembly  36.7 
 
 		 325 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4187  cytochrome oxidase assembly  36.39 
 
 		 325 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4119  cytochrome oxidase assembly  36.39 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0148  cytochrome oxidase assembly  36.09 
 
 		 325 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3523  cytochrome oxidase assembly  37.27 
 
 		 326 aa  169  9e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4005  cytochrome oxidase assembly  38.32 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00950  Cytochrome oxidase assembly protein  41.69 
 
 		 356 aa  167  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0629  putative cytochrome oxidase assembly protein  34.87 
 
 		 387 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  43.73 
 
 		 361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3997  cytochrome oxidase assembly  34.88 
 
 		 352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0171  cytochrome oxidase assembly  38.55 
 
 		 327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3040  cytochrome oxidase assembly  38.44 
 
 		 342 aa  162  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00748587  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0712  cytochrome oxidase assembly protein  35.16 
 
 		 387 aa  162  1e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809899  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0230  cytochrome oxidase assembly protein  32.38 
 
 		 353 aa  158  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0318  cytochrome oxidase assembly  34.68 
 
 		 387 aa  157  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3798  cytochrome oxidase assembly  34.88 
 
 		 352 aa  156  6e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3871  cytochrome oxidase assembly  34.88 
 
 		 352 aa  156  6e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04027  cytochrome oxidase assembly protein  36.08 
 
 		 387 aa  152  8.999999999999999e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0043  putative cytochrome oxidase assembly protein  41.23 
 
 		 394 aa  151  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.484274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1045  cytochrome oxidase assembly  38.62 
 
 		 356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2711  cytochrome oxidase assembly  30.91 
 
 		 375 aa  120  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318505  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04006  cytochrome oxidase assembly  29.93 
 
 		 354 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0133  cytochrome oxidase assembly family protein/cell division protein FtsY  34.46 
 
 		 671 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  25.8 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  27.5 
 
 		 311 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1210  cytochrome oxidase assembly  39.33 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.294531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  28.3 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  23.87 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1780  cytochrome oxidase assembly  34.93 
 
 		 304 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  28.57 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  36.3 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1778  hypothetical protein  30.23 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  28.1 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  27.37 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13300  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  36.18 
 
 		 287 aa  62.4  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0813876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05011  hypothetical protein  30.48 
 
 		 308 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.550155  normal  0.119353 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06105  cytochrome oxidase assembly protein  20.57 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  33.82 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  33.09 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  25.95 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  32.61 
 
 		 308 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>