161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4119 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_4119  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 
325 aa  648    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0148  cytochrome oxidase assembly  98.77 
 
 
325 aa  643    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4187  cytochrome oxidase assembly  99.38 
 
 
325 aa  645    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4318  cytochrome oxidase assembly  99.38 
 
 
325 aa  644    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  82.15 
 
 
325 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4613  cytochrome oxidase assembly protein, putative  88.31 
 
 
330 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3997  cytochrome oxidase assembly  79.83 
 
 
352 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3798  cytochrome oxidase assembly  79.55 
 
 
352 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3871  cytochrome oxidase assembly  79.55 
 
 
352 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  72.7 
 
 
326 aa  437  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  69.94 
 
 
328 aa  435  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  70.03 
 
 
327 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4005  cytochrome oxidase assembly  70.64 
 
 
327 aa  412  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3523  cytochrome oxidase assembly  71.17 
 
 
326 aa  396  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0171  cytochrome oxidase assembly  69.42 
 
 
327 aa  396  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3490  cytochrome oxidase assembly  66.36 
 
 
327 aa  374  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  47.53 
 
 
339 aa  323  3e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  46.79 
 
 
339 aa  311  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  51.1 
 
 
325 aa  298  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0230  cytochrome oxidase assembly protein  45.76 
 
 
353 aa  265  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  50.83 
 
 
339 aa  260  3e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  42.39 
 
 
335 aa  246  3e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  42.39 
 
 
335 aa  246  4e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1045  cytochrome oxidase assembly  48.05 
 
 
356 aa  242  6e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0072  cytochrome oxidase assembly  47.56 
 
 
359 aa  240  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0109  cytochrome oxidase assembly  46.36 
 
 
359 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.475032  normal  0.476439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0126  cytochrome oxidase assembly  45.7 
 
 
359 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0124  cytochrome oxidase assembly  44.55 
 
 
359 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190927  normal  0.0274429 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0129  cytochrome oxidase assembly  47.68 
 
 
357 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.96534 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  44.34 
 
 
348 aa  223  4e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0069  cytochrome oxidase assembly  43.29 
 
 
368 aa  222  7e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0043  putative cytochrome oxidase assembly protein  38.19 
 
 
394 aa  219  7e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.484274  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01360  hypothetical protein  47.78 
 
 
357 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0149  cytochrome oxidase assembly  47.8 
 
 
345 aa  215  7e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  44.11 
 
 
361 aa  211  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0187  hypothetical protein  47.47 
 
 
357 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2711  cytochrome oxidase assembly  43.11 
 
 
375 aa  207  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318505  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04006  cytochrome oxidase assembly  44.49 
 
 
354 aa  206  5e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3040  cytochrome oxidase assembly  43.56 
 
 
342 aa  204  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00748587  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00950  Cytochrome oxidase assembly protein  47.52 
 
 
356 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  38.15 
 
 
363 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  39.88 
 
 
367 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  36.59 
 
 
363 aa  195  7e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  39.13 
 
 
399 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  38.51 
 
 
396 aa  192  9e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  39.58 
 
 
404 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0334  putative cytochrome aa3 oxidase assembly protein,related to CtaA  44.69 
 
 
327 aa  191  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  37.46 
 
 
363 aa  189  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0318  cytochrome oxidase assembly  35.66 
 
 
387 aa  189  5.999999999999999e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  40.19 
 
 
367 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  38.89 
 
 
369 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  36.73 
 
 
392 aa  180  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04027  cytochrome oxidase assembly protein  36.34 
 
 
387 aa  181  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  39.2 
 
 
369 aa  179  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  37.96 
 
 
369 aa  178  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  37.96 
 
 
369 aa  178  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  37.96 
 
 
369 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  37.96 
 
 
369 aa  178  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  36.25 
 
 
383 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  37.96 
 
 
369 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  37.96 
 
 
369 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  37.96 
 
 
369 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  37.96 
 
 
369 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  37.74 
 
 
391 aa  177  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0629  putative cytochrome oxidase assembly protein  34.51 
 
 
387 aa  175  8e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4163  putative cytochrome oxidase assembly protein  39.2 
 
 
369 aa  175  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  37.04 
 
 
370 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  37.04 
 
 
370 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0712  cytochrome oxidase assembly protein  34.24 
 
 
387 aa  172  6.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809899  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  37.04 
 
 
370 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  37.04 
 
 
370 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  39.16 
 
 
376 aa  169  8e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  36.73 
 
 
370 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  36.42 
 
 
370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  37.09 
 
 
373 aa  166  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  36.42 
 
 
370 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3827  cytochrome oxidase assembly  35.93 
 
 
411 aa  165  9e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.502475 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1387  cytochrome oxidase assembly  36.76 
 
 
407 aa  158  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4383  cytochrome oxidase assembly  36.5 
 
 
406 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1688  cytochrome oxidase assembly  37.22 
 
 
398 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4065  cytochrome oxidase assembly  33.74 
 
 
506 aa  142  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.328508  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0133  cytochrome oxidase assembly family protein/cell division protein FtsY  34.46 
 
 
671 aa  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  30.73 
 
 
323 aa  94.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  24.76 
 
 
326 aa  78.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06105  cytochrome oxidase assembly protein  25.79 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  28.62 
 
 
313 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  28.62 
 
 
313 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  28.84 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  32.14 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04451  hypothetical protein  27.78 
 
 
288 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.898486  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  26.8 
 
 
342 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  25.4 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1778  hypothetical protein  30.05 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05011  hypothetical protein  28.42 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.550155  normal  0.119353 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  30.46 
 
 
331 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  32.45 
 
 
285 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  25.58 
 
 
339 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2601  putative cytochrome aa3 controlling protein  32.47 
 
 
304 aa  63.5  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.705731 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  27.36 
 
 
311 aa  62.4  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  26.01 
 
 
286 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>