150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06105 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_06105  cytochrome oxidase assembly protein  100 
 
 		 343 aa  700    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  37.46 
 
 		 342 aa  191  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  32.94 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  33.13 
 
 		 339 aa  179  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  35.87 
 
 		 327 aa  165  9e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0296  cytochrome oxidase assembly  31.9 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300662  normal  0.0109948 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  31.86 
 
 		 311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  29.85 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  27.92 
 
 		 341 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  26.72 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  28.26 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  25.64 
 
 		 339 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  22.74 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  26.29 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  21.83 
 
 		 399 aa  72.8  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  21.08 
 
 		 396 aa  72  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  21.49 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  24.55 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  24.11 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4613  cytochrome oxidase assembly protein, putative  25.73 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  23.98 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  25.44 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  22.55 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  23.4 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  22.77 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  25.3 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  24.43 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  25.3 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  22.73 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0148  cytochrome oxidase assembly  24.71 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4119  cytochrome oxidase assembly  24.71 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4187  cytochrome oxidase assembly  24.71 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  26.74 
 
 		 383 aa  59.3  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4318  cytochrome oxidase assembly  24.71 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3523  cytochrome oxidase assembly  44 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  22.99 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  23.77 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  40.68 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4383  cytochrome oxidase assembly  22.52 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3997  cytochrome oxidase assembly  23.96 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4005  cytochrome oxidase assembly  41.94 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3490  cytochrome oxidase assembly  38.98 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  46.03 
 
 		 325 aa  57  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13300  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  24.59 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0813876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  20.83 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3798  cytochrome oxidase assembly  23.44 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3871  cytochrome oxidase assembly  23.44 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1688  cytochrome oxidase assembly  23.36 
 
 		 398 aa  54.7  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  24.16 
 
 		 392 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0171  cytochrome oxidase assembly  42.86 
 
 		 327 aa  54.3  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00950  Cytochrome oxidase assembly protein  38.46 
 
 		 356 aa  53.5  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1045  cytochrome oxidase assembly  43.48 
 
 		 356 aa  52.8  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01360  hypothetical protein  43.18 
 
 		 357 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5168  cytochrome oxidase assembly  38.78 
 
 		 322 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251951  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4907  cytochrome oxidase assembly  20.45 
 
 		 341 aa  50.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0187  hypothetical protein  41.67 
 
 		 357 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1653  cytochrome oxidase assembly  42.86 
 
 		 342 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0072  cytochrome oxidase assembly  48.65 
 
 		 359 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0069  cytochrome oxidase assembly  35.85 
 
 		 368 aa  50.4  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0230  cytochrome oxidase assembly protein  39.39 
 
 		 353 aa  49.7  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1135  cytochrome oxidase assembly  22.78 
 
 		 318 aa  49.7  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3264  cytochrome oxidase assembly  58.06 
 
 		 298 aa  49.3  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2268  cytochrome oxidase assembly  36.54 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00686495  normal  0.0860504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  40.91 
 
 		 351 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3827  cytochrome oxidase assembly  24.2 
 
 		 411 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.502475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16080  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  51.52 
 
 		 323 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0043  putative cytochrome oxidase assembly protein  50 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.484274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2514  cytochrome oxidase assembly  47.22 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787939  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0126  cytochrome oxidase assembly  53.12 
 
 		 359 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1387  cytochrome oxidase assembly  22.42 
 
 		 407 aa  47.8  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1977  cytochrome oxidase assembly  48.72 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.628163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2467  cytochrome oxidase assembly  50 
 
 		 342 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04451  hypothetical protein  24.4 
 
 		 288 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.898486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4065  cytochrome oxidase assembly  40.91 
 
 		 506 aa  47.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.328508  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0124  cytochrome oxidase assembly  53.12 
 
 		 359 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190927  normal  0.0274429 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  35 
 
 		 622 aa  47.4  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0133  cytochrome oxidase assembly family protein/cell division protein FtsY  33.33 
 
 		 671 aa  47  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3040  cytochrome oxidase assembly  23.27 
 
 		 342 aa  47  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00748587  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2429  cytochrome oxidase assembly  50 
 
 		 342 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0318  cytochrome oxidase assembly  23.39 
 
 		 387 aa  47  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2474  cytochrome oxidase assembly  50 
 
 		 342 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3684  cytochrome oxidase assembly  47.22 
 
 		 318 aa  47  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0129  cytochrome oxidase assembly  50 
 
 		 357 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.96534 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0149  cytochrome oxidase assembly  39.13 
 
 		 345 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  22.41 
 
 		 325 aa  46.2  0.0009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0109  cytochrome oxidase assembly  48.72 
 
 		 359 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.475032  normal  0.476439 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  22.86 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  39.53 
 
 		 369 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  39.53 
 
 		 370 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  25 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  39.53 
 
 		 369 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  39.53 
 
 		 370 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  39.53 
 
 		 370 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  39.53 
 
 		 370 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1133  cytochrome oxidase assembly  39.13 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  22.86 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  22.86 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11484  antibiotic ABC transporter membrane protein  47.22 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.802636 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  39.53 
 
 		 370 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0712  cytochrome oxidase assembly protein  38 
 
 		 387 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>