153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0296 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0296  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 354 aa  719    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300662  normal  0.0109948 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  39.65 
 
 		 342 aa  247  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  39.29 
 
 		 327 aa  212  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  34.21 
 
 		 323 aa  210  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  35.82 
 
 		 339 aa  205  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  35.01 
 
 		 326 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06105  cytochrome oxidase assembly protein  32.24 
 
 		 343 aa  172  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  33.43 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  29.36 
 
 		 311 aa  142  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  31.91 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  28.63 
 
 		 373 aa  79.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  27.97 
 
 		 367 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  25.66 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  24.24 
 
 		 339 aa  72  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  27.63 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3312  cytochrome oxidase assembly  26.03 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000656603 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0193  cytochrome oxidase assembly  25.07 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0230  cytochrome oxidase assembly protein  29.31 
 
 		 353 aa  68.9  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  26.28 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  25.94 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  25.35 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  22.68 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  27.05 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0069  cytochrome oxidase assembly  25 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  25.64 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  24.8 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  25.69 
 
 		 327 aa  67  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  24.81 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  28.31 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4613  cytochrome oxidase assembly protein, putative  30.12 
 
 		 330 aa  65.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  24.1 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  26.57 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  23.93 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4119  cytochrome oxidase assembly  28.92 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4187  cytochrome oxidase assembly  28.92 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  26.97 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4318  cytochrome oxidase assembly  28.92 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0148  cytochrome oxidase assembly  28.92 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2061  cytochrome oxidase assembly  26.02 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.603923  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  29.12 
 
 		 370 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  28.07 
 
 		 383 aa  62.8  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3085  cytochrome oxidase assembly  27.8 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734948  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  26.97 
 
 		 367 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3997  cytochrome oxidase assembly  31.14 
 
 		 352 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22000  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  24.8 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.891794  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2099  cytochrome oxidase assembly  24.73 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0072  cytochrome oxidase assembly  30.82 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0149  cytochrome oxidase assembly  29.56 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3798  cytochrome oxidase assembly  29.94 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3871  cytochrome oxidase assembly  29.94 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2430  cytochrome oxidase assembly  27.36 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3490  cytochrome oxidase assembly  27.71 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  27.78 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3523  cytochrome oxidase assembly  31.74 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0334  putative cytochrome aa3 oxidase assembly protein,related to CtaA  25.41 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  27.47 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  27.47 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  27.47 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  27.47 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  27.47 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  27.47 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  27.47 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4049  cytochrome aa3 controlling protein  24.31 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  26.92 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  26.92 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  26.92 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  26.92 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5168  cytochrome oxidase assembly  25.62 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251951  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3993  cytochrome aa3 controlling protein  23.69 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4064  cytochrome aa3 controlling protein  23.69 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.839964  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3858  cytochrome aa3 controlling protein  23.76 
 
 		 311 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3689  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  23.76 
 
 		 311 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3706  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  23.76 
 
 		 311 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.006652  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3040  cytochrome oxidase assembly  27.86 
 
 		 342 aa  55.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00748587  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4156  cytochrome aa3 controlling protein  23.76 
 
 		 311 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1977  cytochrome oxidase assembly  26.59 
 
 		 328 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.628163 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2543  cytochrome oxidase assembly  28.12 
 
 		 305 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0684946  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1191  cytochrome aa3 controlling protein  24.31 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3264  cytochrome oxidase assembly  40.98 
 
 		 298 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4005  cytochrome oxidase assembly  27.27 
 
 		 327 aa  55.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  27.93 
 
 		 370 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  23.16 
 
 		 286 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0186  hypothetical protein  23.2 
 
 		 137 aa  55.1  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.480963 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  27.93 
 
 		 370 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3961  cytochrome aa3 controlling protein  23.76 
 
 		 311 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1135  cytochrome oxidase assembly  24.65 
 
 		 318 aa  54.7  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  25.56 
 
 		 369 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2268  cytochrome oxidase assembly  24.19 
 
 		 337 aa  53.9  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00686495  normal  0.0860504 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13300  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  24.87 
 
 		 287 aa  53.9  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0813876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  27.66 
 
 		 392 aa  53.5  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0126  cytochrome oxidase assembly  26.9 
 
 		 359 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  25.56 
 
 		 335 aa  53.5  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2347  cytochrome oxidase assembly  25.12 
 
 		 328 aa  53.1  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0173507  normal  0.0130822 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0981  cytochrome oxidase assembly  21.85 
 
 		 319 aa  53.1  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  26.82 
 
 		 370 aa  53.1  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  24.44 
 
 		 391 aa  52.8  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  25.56 
 
 		 335 aa  52.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2514  cytochrome oxidase assembly  24.86 
 
 		 326 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787939  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0171  cytochrome oxidase assembly  27.11 
 
 		 327 aa  52.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1786  cytochrome oxidase assembly  26.18 
 
 		 338 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.637517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>