117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3264 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3264  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 298 aa  557  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  43.54 
 
 		 351 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  41.67 
 
 		 337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3312  cytochrome oxidase assembly  43.66 
 
 		 325 aa  162  8.000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000656603 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1653  cytochrome oxidase assembly  42.95 
 
 		 342 aa  161  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2249  cytochrome oxidase assembly  39.73 
 
 		 386 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165994 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2099  cytochrome oxidase assembly  39.86 
 
 		 301 aa  155  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1133  cytochrome oxidase assembly  42.75 
 
 		 370 aa  154  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1841  cytochrome oxidase assembly  42.29 
 
 		 314 aa  152  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355712 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3085  cytochrome oxidase assembly  44.27 
 
 		 326 aa  150  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734948  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11450  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  42.6 
 
 		 338 aa  149  6e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.314019  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2217  cytochrome oxidase assembly  44.16 
 
 		 351 aa  149  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000899528  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2514  cytochrome oxidase assembly  38.49 
 
 		 326 aa  146  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2061  cytochrome oxidase assembly  44.69 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.603923  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1977  cytochrome oxidase assembly  42.35 
 
 		 328 aa  142  9e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.628163 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1995  putative integral membrane transport protein  45.33 
 
 		 351 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2430  cytochrome oxidase assembly  38.08 
 
 		 325 aa  138  8.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0193  cytochrome oxidase assembly  37.29 
 
 		 321 aa  137  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1135  cytochrome oxidase assembly  36.75 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6009  hypothetical protein  39.86 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00257584  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2347  cytochrome oxidase assembly  40.33 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0173507  normal  0.0130822 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2543  cytochrome oxidase assembly  41.06 
 
 		 305 aa  133  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0684946  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22000  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  41.16 
 
 		 313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.891794  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13300  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  36.3 
 
 		 287 aa  129  7.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0813876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5168  cytochrome oxidase assembly  38.49 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251951  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16080  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  37.18 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2268  cytochrome oxidase assembly  39.65 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00686495  normal  0.0860504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2726  cytochrome oxidase assembly  38.23 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0568935  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3684  cytochrome oxidase assembly  37.76 
 
 		 318 aa  119  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1666  cytochrome oxidase assembly  37.69 
 
 		 348 aa  117  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00799414  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2971  cytochrome oxidase assembly  42.03 
 
 		 370 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2474  cytochrome oxidase assembly  37.25 
 
 		 342 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2467  cytochrome oxidase assembly  37.6 
 
 		 342 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14570  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  37.45 
 
 		 307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852831  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2429  cytochrome oxidase assembly  39.32 
 
 		 342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  34.3 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1353  cytochrome oxidase assembly  35.27 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11484  antibiotic ABC transporter membrane protein  35.52 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.802636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2553  cytochrome oxidase assembly  38.68 
 
 		 304 aa  90.1  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  29.06 
 
 		 341 aa  87  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  30.9 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  27.91 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  23.68 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  23.89 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  26.1 
 
 		 622 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  25.9 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0296  cytochrome oxidase assembly  40.98 
 
 		 354 aa  57  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300662  normal  0.0109948 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  32.62 
 
 		 370 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  31.91 
 
 		 370 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  31.91 
 
 		 370 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  31.91 
 
 		 370 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0981  cytochrome oxidase assembly  25.23 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  31.21 
 
 		 369 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  31.21 
 
 		 369 aa  53.5  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  31.4 
 
 		 367 aa  53.5  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  31.21 
 
 		 369 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  31.21 
 
 		 369 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  31.21 
 
 		 369 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  31.88 
 
 		 369 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  31.21 
 
 		 369 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  32.61 
 
 		 370 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  31.21 
 
 		 369 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  31.21 
 
 		 369 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  31.88 
 
 		 370 aa  53.1  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  32.61 
 
 		 370 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  23.18 
 
 		 342 aa  53.1  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  27.03 
 
 		 367 aa  52.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2601  putative cytochrome aa3 controlling protein  31.79 
 
 		 304 aa  50.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.705731 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0409  cytochrome oxidase assembly  36.07 
 
 		 326 aa  50.8  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4163  putative cytochrome oxidase assembly protein  31.16 
 
 		 369 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  31.16 
 
 		 369 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06105  cytochrome oxidase assembly protein  58.06 
 
 		 343 aa  49.7  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  28.28 
 
 		 396 aa  49.7  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  28.28 
 
 		 399 aa  49.7  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  24.16 
 
 		 325 aa  49.3  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  54.84 
 
 		 327 aa  48.9  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  27.03 
 
 		 363 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4005  cytochrome oxidase assembly  23.18 
 
 		 327 aa  48.9  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3858  cytochrome aa3 controlling protein  27.27 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3689  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  27.27 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3706  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  27.27 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.006652  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1786  cytochrome oxidase assembly  26.52 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.637517  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4156  cytochrome aa3 controlling protein  27.27 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3772  cytochrome oxidase assembly  26.73 
 
 		 311 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161471  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  23.6 
 
 		 328 aa  47.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  27.86 
 
 		 307 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  29.03 
 
 		 339 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4318  cytochrome oxidase assembly  23.36 
 
 		 325 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  28.99 
 
 		 373 aa  47  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  26.85 
 
 		 363 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4119  cytochrome oxidase assembly  23.03 
 
 		 325 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  27.74 
 
 		 285 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  23.16 
 
 		 325 aa  46.6  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4187  cytochrome oxidase assembly  23.03 
 
 		 325 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  25.68 
 
 		 363 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  22.77 
 
 		 327 aa  46.2  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1853  cytochrome oxidase assembly  28.83 
 
 		 317 aa  46.2  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1780  cytochrome oxidase assembly  28.06 
 
 		 304 aa  46.2  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0705  cytochrome oxidase assembly protein  24.39 
 
 		 302 aa  45.8  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  27.66 
 
 		 311 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>