77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2553 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2553  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 304 aa  589  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16080  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  53.9 
 
 		 323 aa  284  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5168  cytochrome oxidase assembly  53.31 
 
 		 322 aa  262  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251951  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2268  cytochrome oxidase assembly  45.69 
 
 		 337 aa  208  8e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00686495  normal  0.0860504 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2467  cytochrome oxidase assembly  45.25 
 
 		 342 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2474  cytochrome oxidase assembly  44.11 
 
 		 342 aa  178  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3684  cytochrome oxidase assembly  46.15 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3312  cytochrome oxidase assembly  42.31 
 
 		 325 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000656603 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2429  cytochrome oxidase assembly  43.73 
 
 		 342 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2726  cytochrome oxidase assembly  44.44 
 
 		 318 aa  169  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0568935  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2514  cytochrome oxidase assembly  39.33 
 
 		 326 aa  166  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787939  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2430  cytochrome oxidase assembly  37.92 
 
 		 325 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1977  cytochrome oxidase assembly  37.99 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.628163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2217  cytochrome oxidase assembly  42.03 
 
 		 351 aa  163  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000899528  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3085  cytochrome oxidase assembly  41.96 
 
 		 326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734948  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11484  antibiotic ABC transporter membrane protein  44.44 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.802636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6009  hypothetical protein  39.02 
 
 		 329 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00257584  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2347  cytochrome oxidase assembly  40.53 
 
 		 328 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0173507  normal  0.0130822 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22000  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  40.57 
 
 		 313 aa  153  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.891794  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2543  cytochrome oxidase assembly  42.51 
 
 		 305 aa  152  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0684946  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  38.8 
 
 		 351 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1995  putative integral membrane transport protein  40.47 
 
 		 351 aa  149  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2971  cytochrome oxidase assembly  41.36 
 
 		 370 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1653  cytochrome oxidase assembly  42.28 
 
 		 342 aa  146  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1353  cytochrome oxidase assembly  38.13 
 
 		 320 aa  144  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1133  cytochrome oxidase assembly  42.86 
 
 		 370 aa  142  6e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2061  cytochrome oxidase assembly  42.23 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.603923  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1135  cytochrome oxidase assembly  38.6 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2099  cytochrome oxidase assembly  37.37 
 
 		 301 aa  135  8e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  38.83 
 
 		 337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1666  cytochrome oxidase assembly  34.24 
 
 		 348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00799414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2249  cytochrome oxidase assembly  34.26 
 
 		 386 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165994 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11450  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  34.13 
 
 		 338 aa  124  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.314019  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1841  cytochrome oxidase assembly  35.42 
 
 		 314 aa  122  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355712 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14570  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  37.3 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852831  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13300  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  37.36 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0813876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0193  cytochrome oxidase assembly  32.55 
 
 		 321 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  33.95 
 
 		 331 aa  109  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3264  cytochrome oxidase assembly  37.79 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  28.34 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  27.78 
 
 		 341 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  27.67 
 
 		 308 aa  52.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  36 
 
 		 622 aa  52.4  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  29.29 
 
 		 342 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  27.88 
 
 		 308 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  30.36 
 
 		 313 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  30.36 
 
 		 313 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  29.6 
 
 		 307 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0296  cytochrome oxidase assembly  23.97 
 
 		 354 aa  50.1  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300662  normal  0.0109948 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  27.33 
 
 		 339 aa  49.7  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  30 
 
 		 339 aa  49.3  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1780  cytochrome oxidase assembly  31.25 
 
 		 304 aa  49.3  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  31.82 
 
 		 327 aa  48.5  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  28.69 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  29.93 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  30.36 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  32.7 
 
 		 367 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  25.17 
 
 		 326 aa  47.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  32.74 
 
 		 367 aa  46.2  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  31.47 
 
 		 363 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2601  putative cytochrome aa3 controlling protein  33.96 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.705731 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  28.57 
 
 		 325 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  27.54 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  27.33 
 
 		 363 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  27.78 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0186  hypothetical protein  29.25 
 
 		 137 aa  44.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.480963 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1519  cytochrome oxidase assembly  27.54 
 
 		 341 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.459506 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0072  cytochrome oxidase assembly  32.11 
 
 		 359 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1210  cytochrome oxidase assembly  29.46 
 
 		 336 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.294531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  28.06 
 
 		 285 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06105  cytochrome oxidase assembly protein  38.98 
 
 		 343 aa  43.5  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  33.33 
 
 		 369 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2709  cytochrome oxidase assembly  26.3 
 
 		 367 aa  43.1  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0393197 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  27.45 
 
 		 325 aa  42.7  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  36.14 
 
 		 392 aa  42.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  30.19 
 
 		 404 aa  42.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  32.47 
 
 		 348 aa  42.4  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>