81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1353 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1353  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 320 aa  619  1e-176  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22000  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  57.29 
 
 		 313 aa  285  7e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.891794  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2347  cytochrome oxidase assembly  55.88 
 
 		 328 aa  265  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0173507  normal  0.0130822 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1666  cytochrome oxidase assembly  48.84 
 
 		 348 aa  245  8e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00799414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1135  cytochrome oxidase assembly  47.33 
 
 		 318 aa  224  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14570  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  51.13 
 
 		 307 aa  203  3e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852831  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13300  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  43.34 
 
 		 287 aa  175  9e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0813876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11450  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  41.96 
 
 		 338 aa  172  5e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.314019  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16080  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  38.54 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2249  cytochrome oxidase assembly  43.25 
 
 		 386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165994 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2430  cytochrome oxidase assembly  43.01 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  42.14 
 
 		 337 aa  163  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6009  hypothetical protein  43.9 
 
 		 329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00257584  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2099  cytochrome oxidase assembly  44.09 
 
 		 301 aa  162  8.000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2217  cytochrome oxidase assembly  45.3 
 
 		 351 aa  162  9e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000899528  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3312  cytochrome oxidase assembly  42.61 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000656603 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5168  cytochrome oxidase assembly  40.94 
 
 		 322 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251951  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2543  cytochrome oxidase assembly  41.33 
 
 		 305 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0684946  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1977  cytochrome oxidase assembly  40.58 
 
 		 328 aa  159  6e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.628163 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3085  cytochrome oxidase assembly  43.38 
 
 		 326 aa  156  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734948  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1653  cytochrome oxidase assembly  39.29 
 
 		 342 aa  150  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  37.15 
 
 		 351 aa  149  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1841  cytochrome oxidase assembly  42.96 
 
 		 314 aa  149  8e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355712 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0193  cytochrome oxidase assembly  36.1 
 
 		 321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2061  cytochrome oxidase assembly  42.66 
 
 		 309 aa  142  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.603923  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1995  putative integral membrane transport protein  39.15 
 
 		 351 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1133  cytochrome oxidase assembly  40.71 
 
 		 370 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2553  cytochrome oxidase assembly  38.8 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2429  cytochrome oxidase assembly  37.32 
 
 		 342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2474  cytochrome oxidase assembly  37.32 
 
 		 342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2726  cytochrome oxidase assembly  37.13 
 
 		 318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0568935  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2467  cytochrome oxidase assembly  36.59 
 
 		 342 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3684  cytochrome oxidase assembly  37.06 
 
 		 318 aa  126  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2268  cytochrome oxidase assembly  35.27 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00686495  normal  0.0860504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2971  cytochrome oxidase assembly  35.61 
 
 		 370 aa  123  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2514  cytochrome oxidase assembly  35.9 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787939  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11484  antibiotic ABC transporter membrane protein  34.41 
 
 		 310 aa  107  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.802636 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  30.56 
 
 		 331 aa  92.8  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3264  cytochrome oxidase assembly  36.47 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  33.56 
 
 		 622 aa  57.4  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1459  cytochrome oxidase assembly  34.44 
 
 		 337 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.494782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  29.9 
 
 		 341 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  25.27 
 
 		 327 aa  53.9  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  27.22 
 
 		 363 aa  53.1  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  27.22 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  29.73 
 
 		 308 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4134  cytochrome oxidase assembly  33.81 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  29.05 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  26.75 
 
 		 363 aa  50.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  33.09 
 
 		 348 aa  49.7  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  30.65 
 
 		 308 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0230  cytochrome oxidase assembly protein  29.66 
 
 		 353 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2502  cytochrome oxidase assembly  32.81 
 
 		 357 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0409  cytochrome oxidase assembly  33.94 
 
 		 326 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  24.92 
 
 		 326 aa  47.8  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  29.5 
 
 		 339 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  24.73 
 
 		 367 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  27.5 
 
 		 342 aa  46.6  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1197  cytochrome oxidase assembly  25.69 
 
 		 356 aa  46.6  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1175  cytochrome oxidase assembly  25.69 
 
 		 356 aa  46.6  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  26.38 
 
 		 285 aa  46.2  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  30.53 
 
 		 311 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  24.13 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  26.03 
 
 		 370 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3961  cytochrome aa3 controlling protein  25.69 
 
 		 311 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  30.28 
 
 		 383 aa  43.9  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4156  cytochrome aa3 controlling protein  25.69 
 
 		 311 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  23.72 
 
 		 333 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0126  cytochrome oxidase assembly  35.83 
 
 		 359 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4064  cytochrome aa3 controlling protein  25.69 
 
 		 311 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.839964  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4049  cytochrome aa3 controlling protein  25.69 
 
 		 311 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3706  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  25.69 
 
 		 311 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.006652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3689  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  25.69 
 
 		 311 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3858  cytochrome aa3 controlling protein  25.69 
 
 		 311 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1191  cytochrome aa3 controlling protein  25.69 
 
 		 311 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3993  cytochrome aa3 controlling protein  25.69 
 
 		 311 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1780  cytochrome oxidase assembly  27.87 
 
 		 304 aa  43.5  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  26.67 
 
 		 311 aa  42.4  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0109  cytochrome oxidase assembly  35 
 
 		 359 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.475032  normal  0.476439 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  29.01 
 
 		 286 aa  42.7  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  29.73 
 
 		 361 aa  42.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>