74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_14570 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_14570  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 307 aa  593  1e-168  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852831  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2347  cytochrome oxidase assembly  50.88 
 
 		 328 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0173507  normal  0.0130822 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22000  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  50.57 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.891794  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1666  cytochrome oxidase assembly  46.38 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00799414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1135  cytochrome oxidase assembly  46.15 
 
 		 318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1353  cytochrome oxidase assembly  49.3 
 
 		 320 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13300  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  41.4 
 
 		 287 aa  175  9e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0813876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11450  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  40.94 
 
 		 338 aa  162  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.314019  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2430  cytochrome oxidase assembly  40.36 
 
 		 325 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2217  cytochrome oxidase assembly  43.63 
 
 		 351 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000899528  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  40.58 
 
 		 337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1995  putative integral membrane transport protein  40.74 
 
 		 351 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2543  cytochrome oxidase assembly  40.34 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0684946  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2249  cytochrome oxidase assembly  40.15 
 
 		 386 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165994 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16080  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  36.92 
 
 		 323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2971  cytochrome oxidase assembly  36.67 
 
 		 370 aa  146  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1977  cytochrome oxidase assembly  41.6 
 
 		 328 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.628163 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2061  cytochrome oxidase assembly  43.42 
 
 		 309 aa  145  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.603923  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3312  cytochrome oxidase assembly  38.61 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000656603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  37.69 
 
 		 351 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5168  cytochrome oxidase assembly  39.19 
 
 		 322 aa  139  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251951  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1653  cytochrome oxidase assembly  39.79 
 
 		 342 aa  136  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2268  cytochrome oxidase assembly  36.74 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00686495  normal  0.0860504 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1133  cytochrome oxidase assembly  38.63 
 
 		 370 aa  129  6e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6009  hypothetical protein  42.47 
 
 		 329 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00257584  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3085  cytochrome oxidase assembly  39.52 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734948  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2099  cytochrome oxidase assembly  37.32 
 
 		 301 aa  123  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0193  cytochrome oxidase assembly  35.34 
 
 		 321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1841  cytochrome oxidase assembly  38.52 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2553  cytochrome oxidase assembly  36.2 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  33.77 
 
 		 331 aa  108  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2474  cytochrome oxidase assembly  35.18 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2429  cytochrome oxidase assembly  35.18 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2467  cytochrome oxidase assembly  34.39 
 
 		 342 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3684  cytochrome oxidase assembly  34.72 
 
 		 318 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2726  cytochrome oxidase assembly  35.47 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0568935  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2514  cytochrome oxidase assembly  30.5 
 
 		 326 aa  91.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787939  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11484  antibiotic ABC transporter membrane protein  33.33 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.802636 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3264  cytochrome oxidase assembly  35.38 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1191  cytochrome aa3 controlling protein  26.77 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4049  cytochrome aa3 controlling protein  26.62 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3993  cytochrome aa3 controlling protein  26.3 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4064  cytochrome aa3 controlling protein  26.95 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.839964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3961  cytochrome aa3 controlling protein  25.97 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4156  cytochrome aa3 controlling protein  25.97 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3706  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  25.97 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.006652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3689  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  25.97 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3858  cytochrome aa3 controlling protein  25.97 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  32.09 
 
 		 363 aa  55.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3772  cytochrome oxidase assembly  25.33 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161471  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1459  cytochrome oxidase assembly  37.84 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.494782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  28.92 
 
 		 622 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1853  cytochrome oxidase assembly  26.52 
 
 		 317 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4134  cytochrome oxidase assembly  37.07 
 
 		 318 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0981  cytochrome oxidase assembly  27.53 
 
 		 319 aa  52.8  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  30.73 
 
 		 363 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  29.37 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  30.85 
 
 		 363 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  28.26 
 
 		 391 aa  49.7  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  27.24 
 
 		 383 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  30.95 
 
 		 339 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0340  cytochrome oxidase assembly  34.23 
 
 		 319 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  23.24 
 
 		 326 aa  47  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2648  cytochrome oxidase assembly  25.09 
 
 		 313 aa  46.6  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  26.57 
 
 		 341 aa  46.6  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  30.82 
 
 		 311 aa  46.2  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  40.32 
 
 		 624 aa  45.8  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0296  cytochrome oxidase assembly  46.51 
 
 		 354 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300662  normal  0.0109948 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  27.7 
 
 		 367 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  25.44 
 
 		 339 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  29.22 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  26.19 
 
 		 373 aa  43.9  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  28.99 
 
 		 367 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3827  cytochrome oxidase assembly  29.03 
 
 		 411 aa  43.9  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.502475 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>