118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1853 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1853  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 317 aa  631  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0981  cytochrome oxidase assembly  76.66 
 
 		 319 aa  501  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3993  cytochrome aa3 controlling protein  64.17 
 
 		 311 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3858  cytochrome aa3 controlling protein  63.84 
 
 		 311 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3689  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  63.84 
 
 		 311 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3706  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  63.84 
 
 		 311 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.006652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4156  cytochrome aa3 controlling protein  63.84 
 
 		 311 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4064  cytochrome aa3 controlling protein  64.17 
 
 		 311 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.839964  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4049  cytochrome aa3 controlling protein  64.17 
 
 		 311 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1191  cytochrome aa3 controlling protein  63.17 
 
 		 311 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3961  cytochrome aa3 controlling protein  63.52 
 
 		 311 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3772  cytochrome oxidase assembly  62.06 
 
 		 311 aa  378  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2648  cytochrome oxidase assembly  61.09 
 
 		 313 aa  366  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0705  cytochrome oxidase assembly protein  49.66 
 
 		 302 aa  290  3e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1175  cytochrome oxidase assembly  50 
 
 		 356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1197  cytochrome oxidase assembly  50 
 
 		 356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  29.96 
 
 		 622 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0662  cytochrome oxidase assembly  27.87 
 
 		 335 aa  97.1  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1459  cytochrome oxidase assembly  39.06 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.494782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4134  cytochrome oxidase assembly  43.16 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2414  cytochrome oxidase assembly  26.87 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0989704  normal  0.228946 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  31.85 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0340  cytochrome oxidase assembly  39.62 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  36.28 
 
 		 624 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2076  cytochrome oxidase assembly  26.92 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.809724 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0409  cytochrome oxidase assembly  38.78 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0707  cytochrome oxidase assembly  33.93 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0545  cytochrome oxidase assembly  39.29 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  26.75 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  34.18 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0213  cytochrome oxidase assembly  37.76 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0224  cytochrome oxidase assembly  37.76 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15999  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0200  cytochrome oxidase assembly protein  38.78 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.571706  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2514  cytochrome oxidase assembly  31.86 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787939  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1803  cytochrome oxidase assembly  30.88 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1133  cytochrome oxidase assembly  34.48 
 
 		 370 aa  55.1  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14570  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  26.52 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852831  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0186  hypothetical protein  30.71 
 
 		 137 aa  53.9  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.480963 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16080  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  25.87 
 
 		 323 aa  53.9  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2407  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 		 452 aa  53.9  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.805442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5168  cytochrome oxidase assembly  29.87 
 
 		 322 aa  53.5  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251951  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2061  cytochrome oxidase assembly  32.09 
 
 		 309 aa  53.5  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.603923  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2429  cytochrome oxidase assembly  33.09 
 
 		 342 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2347  cytochrome oxidase assembly  29.1 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0173507  normal  0.0130822 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2601  putative cytochrome aa3 controlling protein  34.01 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.705731 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2467  cytochrome oxidase assembly  35.71 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3264  cytochrome oxidase assembly  28.3 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  32.73 
 
 		 339 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11450  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  30.37 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.314019  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  24.38 
 
 		 327 aa  51.2  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2099  cytochrome oxidase assembly  31.79 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2474  cytochrome oxidase assembly  34.69 
 
 		 342 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  28.85 
 
 		 337 aa  50.8  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  24.18 
 
 		 339 aa  50.4  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  33.64 
 
 		 331 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1977  cytochrome oxidase assembly  32.48 
 
 		 328 aa  50.1  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.628163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2726  cytochrome oxidase assembly  35.71 
 
 		 318 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0568935  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22000  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  28.28 
 
 		 313 aa  49.7  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.891794  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3684  cytochrome oxidase assembly  35.64 
 
 		 318 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  25.85 
 
 		 342 aa  49.7  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11484  antibiotic ABC transporter membrane protein  32.26 
 
 		 310 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.802636 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  23.9 
 
 		 367 aa  49.3  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  24.78 
 
 		 363 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0636  cytochrome oxidase assembly  27.54 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  23.87 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  21.89 
 
 		 363 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  34.44 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  34.44 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  30.77 
 
 		 361 aa  48.5  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  23.45 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  22.32 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3013  cytochrome oxidase assembly  32.33 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.217193  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13300  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  30.91 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0813876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6009  hypothetical protein  28.66 
 
 		 329 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00257584  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  22.82 
 
 		 326 aa  48.5  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  29.45 
 
 		 333 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2302  protoheme IX farnesyltransferase  29.41 
 
 		 495 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1786  cytochrome oxidase assembly  23.53 
 
 		 338 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.637517  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  32.46 
 
 		 285 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1841  cytochrome oxidase assembly  26.95 
 
 		 314 aa  47  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355712 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1780  cytochrome oxidase assembly  31.58 
 
 		 304 aa  46.6  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  30.28 
 
 		 307 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0334  putative cytochrome aa3 oxidase assembly protein,related to CtaA  24.28 
 
 		 327 aa  46.6  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  24.6 
 
 		 348 aa  46.2  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  23.15 
 
 		 373 aa  45.8  0.0009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  25.99 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  26.7 
 
 		 370 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  28.37 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  28.65 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3312  cytochrome oxidase assembly  26.98 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000656603 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  31.29 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1210  cytochrome oxidase assembly  32.81 
 
 		 336 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.294531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1181  protoheme IX farnesyltransferase  27.34 
 
 		 482 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  28.37 
 
 		 369 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  26.7 
 
 		 370 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  26.7 
 
 		 370 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  28.37 
 
 		 369 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  28.37 
 
 		 369 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  28.37 
 
 		 369 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  26.7 
 
 		 370 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>