39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0662 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0662  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 
335 aa  664    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3858  cytochrome aa3 controlling protein  27.71 
 
 
311 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3689  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  27.71 
 
 
311 aa  106  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3706  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  27.71 
 
 
311 aa  106  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.006652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4156  cytochrome aa3 controlling protein  27.71 
 
 
311 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3961  cytochrome aa3 controlling protein  27.71 
 
 
311 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3993  cytochrome aa3 controlling protein  27.41 
 
 
311 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4049  cytochrome aa3 controlling protein  27.71 
 
 
311 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4064  cytochrome aa3 controlling protein  27.41 
 
 
311 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.839964  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1191  cytochrome aa3 controlling protein  27.97 
 
 
311 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2648  cytochrome oxidase assembly  28.25 
 
 
313 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3772  cytochrome oxidase assembly  28.2 
 
 
311 aa  99.4  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161471  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1197  cytochrome oxidase assembly  28.11 
 
 
356 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0705  cytochrome oxidase assembly protein  27.86 
 
 
302 aa  99  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1175  cytochrome oxidase assembly  28.11 
 
 
356 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0981  cytochrome oxidase assembly  26.71 
 
 
319 aa  87  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1853  cytochrome oxidase assembly  28.11 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  25.76 
 
 
622 aa  73.6  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0186  hypothetical protein  30.6 
 
 
137 aa  56.6  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.480963 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  25.51 
 
 
286 aa  52.8  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4134  cytochrome oxidase assembly  28.68 
 
 
318 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0340  cytochrome oxidase assembly  26.46 
 
 
319 aa  50.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1459  cytochrome oxidase assembly  30.99 
 
 
337 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.494782  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  25.72 
 
 
337 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0707  cytochrome oxidase assembly  34.69 
 
 
317 aa  48.9  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1135  cytochrome oxidase assembly  27.97 
 
 
318 aa  47.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22000  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  28.57 
 
 
313 aa  46.2  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.891794  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0200  cytochrome oxidase assembly protein  52.63 
 
 
316 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.571706  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0224  cytochrome oxidase assembly  52.63 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15999  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0213  cytochrome oxidase assembly  52.63 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0545  cytochrome oxidase assembly  31.07 
 
 
335 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1210  cytochrome oxidase assembly  30.18 
 
 
336 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.294531  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2414  cytochrome oxidase assembly  48.72 
 
 
321 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0989704  normal  0.228946 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  26.32 
 
 
307 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  25.33 
 
 
311 aa  44.3  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2076  cytochrome oxidase assembly  25.25 
 
 
326 aa  43.9  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.809724 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  22.68 
 
 
313 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  22.68 
 
 
313 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  50 
 
 
624 aa  42.7  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.234547 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>